RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494067.5

CTDSP1-212, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSP1, Length 362 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-212ENST00000494067 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
CTDSP1-212ENST00000494067 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.59□□□□□ -1.19
CTDSP1-212ENST00000494067 A0A0J9YXY3 114 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDSP1-212ENST00000494067 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
CTDSP1-212ENST00000494067 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDSP1-212ENST00000494067 FAT4Q6V0I7 4981 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDSP1-212ENST00000494067 SLC25A20O43772 301 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDSP1-212ENST00000494067 S100A1P23297 94 aa7.57□□□□□ -1.2
CTDSP1-212ENST00000494067 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
CTDSP1-212ENST00000494067 C5orf52A6NGY3 159 aa7.56□□□□□ -1.2
CTDSP1-212ENST00000494067 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.56□□□□□ -1.2
CTDSP1-212ENST00000494067 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa7.55□□□□□ -1.2
CTDSP1-212ENST00000494067 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7.55□□□□□ -1.2
CTDSP1-212ENST00000494067 SLC25A34Q6PIV7 304 aa7.55□□□□□ -1.2
CTDSP1-212ENST00000494067 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CTDSP1-212ENST00000494067 LITAFQ99732 161 aa7.54□□□□□ -1.2
CTDSP1-212ENST00000494067 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.54□□□□□ -1.2
CTDSP1-212ENST00000494067 SPANXCQ9NY87 97 aa7.54□□□□□ -1.2
CTDSP1-212ENST00000494067 TIMM17BO60830 172 aa7.53□□□□□ -1.2
CTDSP1-212ENST00000494067 Q8N377 158 aa7.53□□□□□ -1.2
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CTDSP1-212ENST00000494067 HIST1H2BOP23527 126 aa7.52□□□□□ -1.21
CTDSP1-212ENST00000494067 HIST1H2BBP33778 126 aa7.52□□□□□ -1.21
CTDSP1-212ENST00000494067 HIST1H2BDP58876 126 aa7.52□□□□□ -1.21
CTDSP1-212ENST00000494067 HIST1H2BCP62807 126 aa7.52□□□□□ -1.21
CTDSP1-212ENST00000494067 HIST2H2BEQ16778 126 aa7.52□□□□□ -1.21
CTDSP1-212ENST00000494067 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
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CTDSP1-212ENST00000494067 HIST1H2BHQ93079 126 aa7.52□□□□□ -1.21
CTDSP1-212ENST00000494067 HIST1H2BNQ99877 126 aa7.52□□□□□ -1.21
CTDSP1-212ENST00000494067 HIST1H2BMQ99879 126 aa7.52□□□□□ -1.21
CTDSP1-212ENST00000494067 ZNF815PA8K554 130 aa7.51□□□□□ -1.21
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CTDSP1-212ENST00000494067 LINC00518Q8N0U6 118 aa7.51□□□□□ -1.21
CTDSP1-212ENST00000494067 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.51□□□□□ -1.21
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CTDSP1-212ENST00000494067 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.51□□□□□ -1.21
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CTDSP1-212ENST00000494067 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.5□□□□□ -1.21
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CTDSP1-212ENST00000494067 LINC01545Q5VT33 79 aa7.49□□□□□ -1.21
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CTDSP1-212ENST00000494067 LIMD2Q9BT23 127 aa7.49□□□□□ -1.21
CTDSP1-212ENST00000494067 COX7BP24311 80 aa7.47□□□□□ -1.21
CTDSP1-212ENST00000494067 TAL2Q16559 108 aa7.47□□□□□ -1.21
CTDSP1-212ENST00000494067 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.47□□□□□ -1.21
CTDSP1-212ENST00000494067 C20orf202A1L168 122 aa7.46□□□□□ -1.22
CTDSP1-212ENST00000494067 SPRR1BP22528 89 aa7.46□□□□□ -1.22
CTDSP1-212ENST00000494067 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CTDSP1-212ENST00000494067 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.45□□□□□ -1.22
CTDSP1-212ENST00000494067 C3orf79P0CE67 100 aa7.45□□□□□ -1.22
CTDSP1-212ENST00000494067 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CTDSP1-212ENST00000494067 KRTDAPP60985 99 aa7.44□□□□□ -1.22
CTDSP1-212ENST00000494067 C6orf99Q4VX62 202 aa7.44□□□□□ -1.22
CTDSP1-212ENST00000494067 HRCT1Q6UXD1 115 aa7.44□□□□□ -1.22
CTDSP1-212ENST00000494067 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.43□□□□□ -1.22
CTDSP1-212ENST00000494067 IFITM1P13164 125 aa7.42□□□□□ -1.22
CTDSP1-212ENST00000494067 AKR1D1P51857 326 aa7.42□□□□□ -1.22
CTDSP1-212ENST00000494067 XP32Q5T750 250 aa7.42□□□□□ -1.22
CTDSP1-212ENST00000494067 PRO1933Q9H354 126 aa7.42□□□□□ -1.22
CTDSP1-212ENST00000494067 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.41□□□□□ -1.22
CTDSP1-212ENST00000494067 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.41□□□□□ -1.22
CTDSP1-212ENST00000494067 A6NDN8 102 aa7.41□□□□□ -1.22
CTDSP1-212ENST00000494067 Q6ZVH6 145 aa7.41□□□□□ -1.22
CTDSP1-212ENST00000494067 A0A1B0GWB2 263 aa7.4□□□□□ -1.22
CTDSP1-212ENST00000494067 Q1RN00 199 aa7.4□□□□□ -1.22
CTDSP1-212ENST00000494067 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.4□□□□□ -1.22
CTDSP1-212ENST00000494067 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
CTDSP1-212ENST00000494067 H7C2G1 150 aa7.39□□□□□ -1.23
CTDSP1-212ENST00000494067 CD164Q04900 197 aa7.39□□□□□ -1.23
CTDSP1-212ENST00000494067 A4D1N5 150 aa7.38□□□□□ -1.23
CTDSP1-212ENST00000494067 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CTDSP1-212ENST00000494067 ATOH7Q8N100 152 aa7.37□□□□□ -1.23
CTDSP1-212ENST00000494067 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.35□□□□□ -1.23
CTDSP1-212ENST00000494067 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CTDSP1-212ENST00000494067 PCP2Q8IVA1 136 aa7.35□□□□□ -1.23
CTDSP1-212ENST00000494067 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.35□□□□□ -1.23
CTDSP1-212ENST00000494067 C9orf92A6NGG3 77 aa7.34□□□□□ -1.23
CTDSP1-212ENST00000494067 SMIM29Q86T20 159 aa7.34□□□□□ -1.23
CTDSP1-212ENST00000494067 A0A0G2JQZ4 141 aa7.33□□□□□ -1.24
CTDSP1-212ENST00000494067 VAMP3Q15836 100 aa7.33□□□□□ -1.24
CTDSP1-212ENST00000494067 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.32□□□□□ -1.24
CTDSP1-212ENST00000494067 PCOTHQ58A44 107 aa7.31□□□□□ -1.24
CTDSP1-212ENST00000494067 Q5XG85 94 aa7.31□□□□□ -1.24
CTDSP1-212ENST00000494067 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDSP1-212ENST00000494067 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDSP1-212ENST00000494067 F8WEM9 126 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDSP1-212ENST00000494067 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDSP1-212ENST00000494067 LCE2CQ5TA81 110 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDSP1-212ENST00000494067 SMIM11BQ8TCY0 68 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDSP1-212ENST00000494067 TCL1BO95988 128 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDSP1-212ENST00000494067 S100A2P29034 98 aa7.28□□□□□ -1.24
CTDSP1-212ENST00000494067 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CTDSP1-212ENST00000494067 C1orf195Q5TG92 126 aa7.26□□□□□ -1.25
CTDSP1-212ENST00000494067 hADV29S1A0JD25 119 aa7.24□□□□□ -1.25
CTDSP1-212ENST00000494067 HIST3H2BBQ8N257 126 aa7.24□□□□□ -1.25
CTDSP1-212ENST00000494067 Q6JHZ5 121 aa7.23□□□□□ -1.25
CTDSP1-212ENST00000494067 LINC00575Q6W349 94 aa7.23□□□□□ -1.25
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