RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492185.5

NELFE-211, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,786 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-211ENST00000492185 C16orf90A8MZG2 172 aa12.78□□□□□ -0.36
NELFE-211ENST00000492185 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa12.78□□□□□ -0.36
NELFE-211ENST00000492185 PRYO14603 147 aa12.78□□□□□ -0.36
NELFE-211ENST00000492185 PCP4P48539 62 aa12.78□□□□□ -0.36
NELFE-211ENST00000492185 Q6ZQY7 126 aa12.78□□□□□ -0.36
NELFE-211ENST00000492185 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.36
NELFE-211ENST00000492185 SPRR1AP35321 89 aa12.77□□□□□ -0.36
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NELFE-211ENST00000492185 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
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NELFE-211ENST00000492185 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.38
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NELFE-211ENST00000492185 SMCR5Q8TEV8 140 aa12.7□□□□□ -0.38
NELFE-211ENST00000492185 B5MCH6 92 aa12.69□□□□□ -0.38
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NELFE-211ENST00000492185 LINC00846Q9NV44 126 aa12.61□□□□□ -0.39
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NELFE-211ENST00000492185 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa12.59□□□□□ -0.39
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NELFE-211ENST00000492185 EPM2AB3EWF7 344 aa12.57□□□□□ -0.4
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NELFE-211ENST00000492185 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa12.56□□□□□ -0.4
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NELFE-211ENST00000492185 C1orf134Q5TEV5 83 aa12.51□□□□□ -0.41
NELFE-211ENST00000492185 SPACA4Q8TDM5 124 aa12.51□□□□□ -0.41
NELFE-211ENST00000492185 LINC00476Q8WZB0 136 aa12.51□□□□□ -0.41
NELFE-211ENST00000492185 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa12.49□□□□□ -0.41
NELFE-211ENST00000492185 UBE2BP63146 152 aa12.49□□□□□ -0.41
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NELFE-211ENST00000492185 RTL8CO15255 209 aa12.47□□□□□ -0.41
NELFE-211ENST00000492185 LY6G6CO95867 125 aa12.47□□□□□ -0.41
NELFE-211ENST00000492185 TNP2Q05952 138 aa12.47□□□□□ -0.41
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NELFE-211ENST00000492185 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa12.46□□□□□ -0.42
NELFE-211ENST00000492185 PRLHP81277 87 aa12.43□□□□□ -0.42
NELFE-211ENST00000492185 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa12.43□□□□□ -0.42
NELFE-211ENST00000492185 UBL5Q9BZL1 73 aa12.43□□□□□ -0.42
NELFE-211ENST00000492185 C3orf84H3BNL1 204 aa12.41□□□□□ -0.42
NELFE-211ENST00000492185 SMIM29Q86T20 159 aa12.41□□□□□ -0.42
NELFE-211ENST00000492185 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa12.4□□□□□ -0.42
NELFE-211ENST00000492185 C3orf22Q8N5N4 141 aa12.4□□□□□ -0.42
NELFE-211ENST00000492185 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa12.38□□□□□ -0.43
NELFE-211ENST00000492185 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP12.38□□□□□ -0.43
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NELFE-211ENST00000492185 PLAC8Q9NZF1 115 aa12.37□□□□□ -0.43
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NELFE-211ENST00000492185 SPRR1BP22528 89 aa12.35□□□□□ -0.43
NELFE-211ENST00000492185 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
NELFE-211ENST00000492185 A0A1B0GW54 56 aa12.34□□□□□ -0.43
NELFE-211ENST00000492185 DPH3Q96FX2 82 aa12.34□□□□□ -0.43
NELFE-211ENST00000492185 ANAPC13Q9BS18 74 aa12.34□□□□□ -0.43
NELFE-211ENST00000492185 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa12.33□□□□□ -0.44
NELFE-211ENST00000492185 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa12.33□□□□□ -0.44
NELFE-211ENST00000492185 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa12.33□□□□□ -0.44
NELFE-211ENST00000492185 FRAS1Q86XX4 4008 aa12.32□□□□□ -0.44
NELFE-211ENST00000492185 C1orf137Q5JT78 98 aa12.32□□□□□ -0.44
NELFE-211ENST00000492185 A0A1W2PNM2 257 aa12.31□□□□□ -0.44
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