RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486404.5

CHMP3-208, Transcript of charged multivesicular body protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene CHMP3, Length 650 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP3-208ENST00000486404 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CHMP3-208ENST00000486404 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CHMP3-208ENST00000486404 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.52□□□□□ -1.21
CHMP3-208ENST00000486404 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.52□□□□□ -1.21
CHMP3-208ENST00000486404 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.52□□□□□ -1.21
CHMP3-208ENST00000486404 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.52□□□□□ -1.21
CHMP3-208ENST00000486404 CBY1Q9Y3M2 126 aa7.52□□□□□ -1.21
CHMP3-208ENST00000486404 B5MCH6 92 aa7.51□□□□□ -1.21
CHMP3-208ENST00000486404 TIMM17BO60830 172 aa7.51□□□□□ -1.21
CHMP3-208ENST00000486404 IGLV6-57P01721 117 aa7.51□□□□□ -1.21
CHMP3-208ENST00000486404 Q6ZRX8 168 aa7.51□□□□□ -1.21
CHMP3-208ENST00000486404 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.51□□□□□ -1.21
CHMP3-208ENST00000486404 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CHMP3-208ENST00000486404 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.5□□□□□ -1.21
CHMP3-208ENST00000486404 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.5□□□□□ -1.21
CHMP3-208ENST00000486404 SPANXCQ9NY87 97 aa7.5□□□□□ -1.21
CHMP3-208ENST00000486404 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
CHMP3-208ENST00000486404 AKR1D1P51857 326 aa7.49□□□□□ -1.21
CHMP3-208ENST00000486404 XP32Q5T750 250 aa7.49□□□□□ -1.21
CHMP3-208ENST00000486404 GAGE2AQ6NT46 116 aa7.49□□□□□ -1.21
CHMP3-208ENST00000486404 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.49□□□□□ -1.21
CHMP3-208ENST00000486404 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.49□□□□□ -1.21
CHMP3-208ENST00000486404 RNF213Q63HN8 5207 aa7.49□□□□□ -1.21
CHMP3-208ENST00000486404 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
CHMP3-208ENST00000486404 LITAFQ99732 161 aa7.48□□□□□ -1.21
CHMP3-208ENST00000486404 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.48□□□□□ -1.21
CHMP3-208ENST00000486404 ATOH7Q8N100 152 aa7.47□□□□□ -1.21
CHMP3-208ENST00000486404 LPAP08519 4548 aa7.47□□□□□ -1.21
CHMP3-208ENST00000486404 S100A2P29034 98 aa7.46□□□□□ -1.22
CHMP3-208ENST00000486404 CTAG1AP78358 180 aa7.46□□□□□ -1.22
CHMP3-208ENST00000486404 LINC00483Q53H64 154 aa7.46□□□□□ -1.22
CHMP3-208ENST00000486404 SPAG11AQ6PDA7 123 aa7.46□□□□□ -1.22
CHMP3-208ENST00000486404 Q8NBF4 154 aa7.46□□□□□ -1.22
CHMP3-208ENST00000486404 COPS9Q8WXC6 57 aa7.46□□□□□ -1.22
CHMP3-208ENST00000486404 Q9BRP9 147 aa7.46□□□□□ -1.22
CHMP3-208ENST00000486404 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.46□□□□□ -1.22
CHMP3-208ENST00000486404 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.45□□□□□ -1.22
CHMP3-208ENST00000486404 ERC2-IT1O76042 136 aa7.45□□□□□ -1.22
CHMP3-208ENST00000486404 S100A1P23297 94 aa7.45□□□□□ -1.22
CHMP3-208ENST00000486404 MOBPQ13875 183 aa7.44□□□□□ -1.22
CHMP3-208ENST00000486404 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.44□□□□□ -1.22
CHMP3-208ENST00000486404 LINC00518Q8N0U6 118 aa7.43□□□□□ -1.22
CHMP3-208ENST00000486404 S100A6P06703 90 aa7.42□□□□□ -1.22
CHMP3-208ENST00000486404 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.42□□□□□ -1.22
CHMP3-208ENST00000486404 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CHMP3-208ENST00000486404 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.4□□□□□ -1.22
CHMP3-208ENST00000486404 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.4□□□□□ -1.22
CHMP3-208ENST00000486404 IFITM1P13164 125 aa7.4□□□□□ -1.22
CHMP3-208ENST00000486404 PCP2Q8IVA1 136 aa7.4□□□□□ -1.22
CHMP3-208ENST00000486404 HIST3H2BBQ8N257 126 aa7.4□□□□□ -1.22
CHMP3-208ENST00000486404 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.4□□□□□ -1.22
CHMP3-208ENST00000486404 SPINK1P00995 79 aa7.39□□□□□ -1.23
CHMP3-208ENST00000486404 COX7BP24311 80 aa7.39□□□□□ -1.23
CHMP3-208ENST00000486404 Q6ZVH6 145 aa7.39□□□□□ -1.23
CHMP3-208ENST00000486404 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.39□□□□□ -1.23
CHMP3-208ENST00000486404 CDIP1Q9H305 208 aa7.39□□□□□ -1.23
CHMP3-208ENST00000486404 TPRXLQ17RH7 258 aa7.38□□□□□ -1.23
CHMP3-208ENST00000486404 C6orf99Q4VX62 202 aa7.38□□□□□ -1.23
CHMP3-208ENST00000486404 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.38□□□□□ -1.23
CHMP3-208ENST00000486404 A6NDN8 102 aa7.37□□□□□ -1.23
CHMP3-208ENST00000486404 C5orf52A6NGY3 159 aa7.37□□□□□ -1.23
CHMP3-208ENST00000486404 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CHMP3-208ENST00000486404 SLC25A34Q6PIV7 304 aa7.37□□□□□ -1.23
CHMP3-208ENST00000486404 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CHMP3-208ENST00000486404 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.37□□□□□ -1.23
CHMP3-208ENST00000486404 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.35□□□□□ -1.23
CHMP3-208ENST00000486404 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.33□□□□□ -1.24
CHMP3-208ENST00000486404 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.33□□□□□ -1.24
CHMP3-208ENST00000486404 A0A1B0GWB2 263 aa7.33□□□□□ -1.24
CHMP3-208ENST00000486404 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CHMP3-208ENST00000486404 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7.33□□□□□ -1.24
CHMP3-208ENST00000486404 A0A0U1RQV1 116 aa7.32□□□□□ -1.24
CHMP3-208ENST00000486404 H3BS24 57 aa7.32□□□□□ -1.24
CHMP3-208ENST00000486404 SCGB1D1O95968 90 aa7.32□□□□□ -1.24
CHMP3-208ENST00000486404 SLC25A20O43772 301 aa7.31□□□□□ -1.24
CHMP3-208ENST00000486404 SPRR1BP22528 89 aa7.31□□□□□ -1.24
CHMP3-208ENST00000486404 TAL2Q16559 108 aa7.31□□□□□ -1.24
CHMP3-208ENST00000486404 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.31□□□□□ -1.24
CHMP3-208ENST00000486404 Q8N377 158 aa7.3□□□□□ -1.24
CHMP3-208ENST00000486404 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CHMP3-208ENST00000486404 A4D1N5 150 aa7.29□□□□□ -1.24
CHMP3-208ENST00000486404 Q1RN00 199 aa7.29□□□□□ -1.24
CHMP3-208ENST00000486404 LIMD2Q9BT23 127 aa7.29□□□□□ -1.24
CHMP3-208ENST00000486404 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.28□□□□□ -1.24
CHMP3-208ENST00000486404 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.28□□□□□ -1.24
CHMP3-208ENST00000486404 HRCT1Q6UXD1 115 aa7.27□□□□□ -1.25
CHMP3-208ENST00000486404 SMIM11BQ8TCY0 68 aa7.27□□□□□ -1.25
CHMP3-208ENST00000486404 VAMP3Q15836 100 aa7.26□□□□□ -1.25
CHMP3-208ENST00000486404 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7.25□□□□□ -1.25
CHMP3-208ENST00000486404 HIST1H4GQ99525 98 aa7.25□□□□□ -1.25
CHMP3-208ENST00000486404 PRO1933Q9H354 126 aa7.24□□□□□ -1.25
CHMP3-208ENST00000486404 C12orf57Q99622 126 aa7.23□□□□□ -1.25
CHMP3-208ENST00000486404 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.22□□□□□ -1.25
CHMP3-208ENST00000486404 F8WEM9 126 aa7.22□□□□□ -1.25
CHMP3-208ENST00000486404 COX8AP10176 69 aa7.22□□□□□ -1.25
CHMP3-208ENST00000486404 MUC2Q02817 5179 aa7.22□□□□□ -1.25
CHMP3-208ENST00000486404 H7C2G1 150 aa7.21□□□□□ -1.26
CHMP3-208ENST00000486404 CD164Q04900 197 aa7.2□□□□□ -1.26
CHMP3-208ENST00000486404 VAMP8Q9BV40 100 aa7.2□□□□□ -1.26
CHMP3-208ENST00000486404 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.9 ms