RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443120.5

ANKRD39-202, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD39, Length 4,965 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-202ENST00000443120 C16orf90A8MZG2 172 aa10.19□□□□□ -0.78
ANKRD39-202ENST00000443120 MDFIQ99750 246 aa10.19□□□□□ -0.78
ANKRD39-202ENST00000443120 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa10.17□□□□□ -0.78
ANKRD39-202ENST00000443120 Q8NAQ8 132 aa10.17□□□□□ -0.78
ANKRD39-202ENST00000443120 FAM229AH3BQW9 127 aa10.17□□□□□ -0.78
ANKRD39-202ENST00000443120 MIR22HGQ0VDD5 57 aa10.16□□□□□ -0.78
ANKRD39-202ENST00000443120 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
ANKRD39-202ENST00000443120 CYSTM1Q9H1C7 97 aa10.16□□□□□ -0.78
ANKRD39-202ENST00000443120 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
ANKRD39-202ENST00000443120 LINC00313P59037 77 aa10.14□□□□□ -0.79
ANKRD39-202ENST00000443120 A0A1W2PNM2 257 aa10.13□□□□□ -0.79
ANKRD39-202ENST00000443120 C8orf17Q9NRJ1 99 aa10.13□□□□□ -0.79
ANKRD39-202ENST00000443120 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa10.12□□□□□ -0.79
ANKRD39-202ENST00000443120 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa10.11□□□□□ -0.79
ANKRD39-202ENST00000443120 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa10.11□□□□□ -0.79
ANKRD39-202ENST00000443120 LINC00612Q8N6U2 182 aa10.11□□□□□ -0.79
ANKRD39-202ENST00000443120 FAM104AQ969W3 186 aa10.1□□□□□ -0.79
ANKRD39-202ENST00000443120 FAM168BA1KXE4 195 aa10.1□□□□□ -0.79
ANKRD39-202ENST00000443120 DNAH10OSP0CZ25 163 aa10.09□□□□□ -0.79
ANKRD39-202ENST00000443120 SPINT4Q6UDR6 99 aa10.09□□□□□ -0.79
ANKRD39-202ENST00000443120 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa10.09□□□□□ -0.79
ANKRD39-202ENST00000443120 C15orf56Q8N910 161 aa10.07□□□□□ -0.8
ANKRD39-202ENST00000443120 TLX1NBP0CAT3 122 aa10.06□□□□□ -0.8
ANKRD39-202ENST00000443120 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
ANKRD39-202ENST00000443120 A0A096LNT2 108 aa10.05□□□□□ -0.8
ANKRD39-202ENST00000443120 A0A1B0GVX0 72 aa10.05□□□□□ -0.8
ANKRD39-202ENST00000443120 Q75L30 129 aa10.04□□□□□ -0.8
ANKRD39-202ENST00000443120 OXTP01178 125 aa10.03□□□□□ -0.8
ANKRD39-202ENST00000443120 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa10.03□□□□□ -0.8
ANKRD39-202ENST00000443120 FAM229BQ4G0N7 80 aa10.02□□□□□ -0.8
ANKRD39-202ENST00000443120 HECTD1Q9ULT8 2610 aa10.02□□□□□ -0.81
ANKRD39-202ENST00000443120 LINC00588Q9Y4M8 146 aa10.02□□□□□ -0.81
ANKRD39-202ENST00000443120 SPACA4Q8TDM5 124 aa10.02□□□□□ -0.81
ANKRD39-202ENST00000443120 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa10.01□□□□□ -0.81
ANKRD39-202ENST00000443120 MGAM2Q2M2H8 2515 aa10□□□□□ -0.81
ANKRD39-202ENST00000443120 USP24Q9UPU5 2620 aa10□□□□□ -0.81
ANKRD39-202ENST00000443120 C19orf73Q9NVV2 129 aa9.99□□□□□ -0.81
ANKRD39-202ENST00000443120 SPRR4Q96PI1 79 aa9.99□□□□□ -0.81
ANKRD39-202ENST00000443120 DSCR10P59022 87 aa9.98□□□□□ -0.81
ANKRD39-202ENST00000443120 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa9.98□□□□□ -0.81
ANKRD39-202ENST00000443120 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa9.96□□□□□ -0.81
ANKRD39-202ENST00000443120 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
ANKRD39-202ENST00000443120 CHTF8P0CG12 524 aa9.96□□□□□ -0.82
ANKRD39-202ENST00000443120 A0A0G2JQZ4 141 aa9.95□□□□□ -0.82
ANKRD39-202ENST00000443120 A0A1W2PNN7 141 aa9.95□□□□□ -0.82
ANKRD39-202ENST00000443120 RTL8CO15255 209 aa9.95□□□□□ -0.82
ANKRD39-202ENST00000443120 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa9.92□□□□□ -0.82
ANKRD39-202ENST00000443120 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa9.92□□□□□ -0.82
ANKRD39-202ENST00000443120 BRCA2P51587 3418 aa9.9□□□□□ -0.82
ANKRD39-202ENST00000443120 LINC01554Q52M75 96 aa9.9□□□□□ -0.82
ANKRD39-202ENST00000443120 Q5VV11 94 aa9.89□□□□□ -0.83
ANKRD39-202ENST00000443120 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
ANKRD39-202ENST00000443120 Q96NJ1 140 aa9.87□□□□□ -0.83
ANKRD39-202ENST00000443120 PRR26Q8N8Z3 221 aa9.86□□□□□ -0.83
ANKRD39-202ENST00000443120 MAST4O15021 2626 aa9.86□□□□□ -0.83
ANKRD39-202ENST00000443120 CRIPTQ9P021 101 aa9.85□□□□□ -0.83
ANKRD39-202ENST00000443120 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
ANKRD39-202ENST00000443120 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
ANKRD39-202ENST00000443120 TYMSOSQ8TAI1 123 aa9.84□□□□□ -0.83
ANKRD39-202ENST00000443120 K7EIL1 84 aa9.83□□□□□ -0.84
ANKRD39-202ENST00000443120 ATRQ13535 2644 aa9.82□□□□□ -0.84
ANKRD39-202ENST00000443120 C9orf163Q8N9P6 203 aa9.82□□□□□ -0.84
ANKRD39-202ENST00000443120 LAMA3Q16787 3333 aa9.81□□□□□ -0.84
ANKRD39-202ENST00000443120 H3BS24 57 aa9.8□□□□□ -0.84
ANKRD39-202ENST00000443120 ZNF861PO60384 105 aa9.79□□□□□ -0.84
ANKRD39-202ENST00000443120 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
ANKRD39-202ENST00000443120 BPTFQ12830 3046 aa9.78□□□□□ -0.84
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP10-11P60412 298 aa9.78□□□□□ -0.84
ANKRD39-202ENST00000443120 CNBPP62633 177 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
ANKRD39-202ENST00000443120 Q8NDZ9 215 aa9.75□□□□□ -0.85
ANKRD39-202ENST00000443120 CR1P17927 2039 aa9.73□□□□□ -0.85
ANKRD39-202ENST00000443120 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
ANKRD39-202ENST00000443120 PRAC1Q96KF2 57 aa9.72□□□□□ -0.85
ANKRD39-202ENST00000443120 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa9.71□□□□□ -0.86
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP10-3P60369 221 aa9.7□□□□□ -0.86
ANKRD39-202ENST00000443120 HTTP42858 3142 aa9.7□□□□□ -0.86
ANKRD39-202ENST00000443120 SPRR1AP35321 89 aa9.69□□□□□ -0.86
ANKRD39-202ENST00000443120 APLNQ9ULZ1 77 aa9.68□□□□□ -0.86
ANKRD39-202ENST00000443120 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
ANKRD39-202ENST00000443120 HRES1P13985 223 aa9.67□□□□□ -0.86
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa9.67□□□□□ -0.86
ANKRD39-202ENST00000443120 CASC10Q5T4H9 136 aa9.66□□□□□ -0.86
ANKRD39-202ENST00000443120 SPINK7P58062 85 aa9.66□□□□□ -0.86
ANKRD39-202ENST00000443120 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
ANKRD39-202ENST00000443120 J3QL48 77 aa9.65□□□□□ -0.86
ANKRD39-202ENST00000443120 C5orf42Q9H799 3197 aa9.65□□□□□ -0.86
ANKRD39-202ENST00000443120 A0A087WTM6 91 aa9.65□□□□□ -0.87
ANKRD39-202ENST00000443120 ITPR3Q14573 2671 aa9.63□□□□□ -0.87
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP1-1Q07627 177 aa9.62□□□□□ -0.87
ANKRD39-202ENST00000443120 ANAPC11Q9NYG5 84 aa9.61□□□□□ -0.87
ANKRD39-202ENST00000443120 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa9.61□□□□□ -0.87
ANKRD39-202ENST00000443120 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa9.6□□□□□ -0.87
ANKRD39-202ENST00000443120 LINC00472Q9H8W2 130 aa9.6□□□□□ -0.87
ANKRD39-202ENST00000443120 IGLV7-43P04211 117 aa9.59□□□□□ -0.87
ANKRD39-202ENST00000443120 UNC80Q8N2C7 3258 aa9.59□□□□□ -0.87
ANKRD39-202ENST00000443120 Q8N1X5 172 aa9.59□□□□□ -0.87
ANKRD39-202ENST00000443120 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
ANKRD39-202ENST00000443120 CSAG1Q6PB30 78 aa9.58□□□□□ -0.88
ANKRD39-202ENST00000443120 A0A1B0GU33 70 aa9.57□□□□□ -0.88
ANKRD39-202ENST00000443120 LINC00304Q8N9R0 145 aa9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 283.6 ms