RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429798.1

LIMD1-AS1-202, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LIMD1-AS1, Length 955 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HAMPP81172 84 aa6.45□□□□□ -1.38
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 Q1RN00 199 aa6.45□□□□□ -1.38
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 Q8NDZ9 215 aa6.45□□□□□ -1.38
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LINC00167Q96N53 147 aa6.45□□□□□ -1.38
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PKD1P98161 4303 aa6.44□□□□□ -1.38
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.44□□□□□ -1.38
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.44□□□□□ -1.38
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 EPM2AB3EWF7 344 aa6.44□□□□□ -1.38
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PRYO14603 147 aa6.44□□□□□ -1.38
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CFC1BP0CG36 223 aa6.44□□□□□ -1.38
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CFC1P0CG37 223 aa6.44□□□□□ -1.38
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.44□□□□□ -1.38
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.44□□□□□ -1.38
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.43□□□□□ -1.38
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.43□□□□□ -1.38
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGLV6-57P01721 117 aa6.43□□□□□ -1.38
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.43□□□□□ -1.38
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.42□□□□□ -1.38
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.41□□□□□ -1.38
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.41□□□□□ -1.38
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DIRC1Q969H9 104 aa6.41□□□□□ -1.38
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.41□□□□□ -1.38
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PKHD1P08F94 4074 aa6.41□□□□□ -1.38
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 A0A1B0GWB2 263 aa6.4□□□□□ -1.38
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 K7ERJ3 54 aa6.4□□□□□ -1.38
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 VAMP3Q15836 100 aa6.4□□□□□ -1.38
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.4□□□□□ -1.38
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 UBE2AP49459 152 aa6.39□□□□□ -1.39
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PSMB2P49721 201 aa6.39□□□□□ -1.39
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C1orf137Q5JT78 98 aa6.39□□□□□ -1.39
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 BCE1O60756 84 aa6.38□□□□□ -1.39
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 COX6CP09669 75 aa6.38□□□□□ -1.39
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.38□□□□□ -1.39
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.38□□□□□ -1.39
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.38□□□□□ -1.39
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SNCGO76070 127 aa6.37□□□□□ -1.39
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C6orf99Q4VX62 202 aa6.37□□□□□ -1.39
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.37□□□□□ -1.39
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.37□□□□□ -1.39
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.36□□□□□ -1.39
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.36□□□□□ -1.39
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC25A20O43772 301 aa6.35□□□□□ -1.39
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TSPAN13O95857 204 aa6.35□□□□□ -1.39
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 H0YGX0 51 aa6.33□□□□□ -1.4
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRIAP1O43715 76 aa6.33□□□□□ -1.4
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGLV7-43P04211 117 aa6.33□□□□□ -1.4
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PRLHP81277 87 aa6.33□□□□□ -1.4
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.33□□□□□ -1.4
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.32□□□□□ -1.4
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 B5MCH6 92 aa6.32□□□□□ -1.4
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 H0Y9J4 135 aa6.32□□□□□ -1.4
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 Q5VSD8 79 aa6.32□□□□□ -1.4
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.32□□□□□ -1.4
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 H3BUT2 72 aa6.31□□□□□ -1.4
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF861PO60384 105 aa6.31□□□□□ -1.4
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C9orf118A6NHY6 69 aa6.3□□□□□ -1.4
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 INAFM2P0DMQ5 153 aa6.3□□□□□ -1.4
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 Q8N1X5 172 aa6.3□□□□□ -1.4
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TAX1BP3O14907 124 aa6.29□□□□□ -1.4
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DNAL4O96015 105 aa6.29□□□□□ -1.4
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FABP2P12104 132 aa6.29□□□□□ -1.4
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.29□□□□□ -1.4
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 hADV29S1A0JD25 119 aa6.28□□□□□ -1.4
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LINC00575Q6W349 94 aa6.28□□□□□ -1.4
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 BIRC6Q9NR09 4857 aa6.27□□□□□ -1.41
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.27□□□□□ -1.41
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 A0A1B0GX51 115 aa6.27□□□□□ -1.41
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.27□□□□□ -1.41
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.27□□□□□ -1.41
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.26□□□□□ -1.41
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 A0A1W2PPM0 123 aa6.26□□□□□ -1.41
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ATXN8Q156A1 80 aa6.26□□□□□ -1.41
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.26□□□□□ -1.41
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CLEC2BQ92478 149 aa6.26□□□□□ -1.41
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 Q9BRP9 147 aa6.26□□□□□ -1.41
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.24□□□□□ -1.41
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 H3BQ85 93 aa6.23□□□□□ -1.41
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