RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420058.1

NFE4-201, Transcript of nuclear factor, erythroid 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NFE4, Length 1,072 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE4-201ENST00000420058 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
NFE4-201ENST00000420058 SPRR1BP22528 89 aa7.58□□□□□ -1.2
NFE4-201ENST00000420058 C10orf91Q5T1B1 145 aa7.58□□□□□ -1.2
NFE4-201ENST00000420058 HRCT1Q6UXD1 115 aa7.58□□□□□ -1.2
NFE4-201ENST00000420058 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.58□□□□□ -1.2
NFE4-201ENST00000420058 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
NFE4-201ENST00000420058 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa7.57□□□□□ -1.2
NFE4-201ENST00000420058 C5orf52A6NGY3 159 aa7.56□□□□□ -1.2
NFE4-201ENST00000420058 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
NFE4-201ENST00000420058 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
NFE4-201ENST00000420058 LCE3BQ5TA77 95 aa7.56□□□□□ -1.2
NFE4-201ENST00000420058 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.55□□□□□ -1.2
NFE4-201ENST00000420058 NDUFC2O95298 119 aa7.55□□□□□ -1.2
NFE4-201ENST00000420058 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.55□□□□□ -1.2
NFE4-201ENST00000420058 LIMD2Q9BT23 127 aa7.55□□□□□ -1.2
NFE4-201ENST00000420058 LEPROTO15243 131 aa7.54□□□□□ -1.2
NFE4-201ENST00000420058 IFITM2Q01629 132 aa7.53□□□□□ -1.2
NFE4-201ENST00000420058 RHEBQ15382 184 aa7.53□□□□□ -1.2
NFE4-201ENST00000420058 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.53□□□□□ -1.2
NFE4-201ENST00000420058 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
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NFE4-201ENST00000420058 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.52□□□□□ -1.21
NFE4-201ENST00000420058 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
NFE4-201ENST00000420058 J3QQQ9 107 aa7.5□□□□□ -1.21
NFE4-201ENST00000420058 C1orf195Q5TG92 126 aa7.5□□□□□ -1.21
NFE4-201ENST00000420058 COX6B2Q6YFQ2 88 aa7.5□□□□□ -1.21
NFE4-201ENST00000420058 CD164Q04900 197 aa7.49□□□□□ -1.21
NFE4-201ENST00000420058 Q5XG85 94 aa7.49□□□□□ -1.21
NFE4-201ENST00000420058 H7C2G1 150 aa7.47□□□□□ -1.21
NFE4-201ENST00000420058 NPC2P61916 151 aa7.47□□□□□ -1.21
NFE4-201ENST00000420058 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.47□□□□□ -1.21
NFE4-201ENST00000420058 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7.47□□□□□ -1.21
NFE4-201ENST00000420058 H0Y8G0 127 aa7.46□□□□□ -1.22
NFE4-201ENST00000420058 SLC25A34Q6PIV7 304 aa7.46□□□□□ -1.22
NFE4-201ENST00000420058 YPEL4Q96NS1 127 aa7.46□□□□□ -1.22
NFE4-201ENST00000420058 A0A0G2JQZ4 141 aa7.45□□□□□ -1.22
NFE4-201ENST00000420058 NMUP48645 174 aa7.45□□□□□ -1.22
NFE4-201ENST00000420058 SMIM29Q86T20 159 aa7.45□□□□□ -1.22
NFE4-201ENST00000420058 COMMD7Q86VX2 200 aa7.45□□□□□ -1.22
NFE4-201ENST00000420058 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.45□□□□□ -1.22
NFE4-201ENST00000420058 A0A0J9YXY3 114 aa7.44□□□□□ -1.22
NFE4-201ENST00000420058 LINC00310P59036 64 aa7.44□□□□□ -1.22
NFE4-201ENST00000420058 Q1RN00 199 aa7.44□□□□□ -1.22
NFE4-201ENST00000420058 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa7.44□□□□□ -1.22
NFE4-201ENST00000420058 PRO1933Q9H354 126 aa7.44□□□□□ -1.22
NFE4-201ENST00000420058 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
NFE4-201ENST00000420058 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.43□□□□□ -1.22
NFE4-201ENST00000420058 PMCHL2Q9BQD1 86 aa7.43□□□□□ -1.22
NFE4-201ENST00000420058 PLNP26678 52 aa7.42□□□□□ -1.22
NFE4-201ENST00000420058 LITAFQ99732 161 aa7.42□□□□□ -1.22
NFE4-201ENST00000420058 HSBP1O75506 76 aa7.41□□□□□ -1.22
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NFE4-201ENST00000420058 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
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NFE4-201ENST00000420058 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.39□□□□□ -1.23
NFE4-201ENST00000420058 LEPROTL1O95214 131 aa7.39□□□□□ -1.23
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NFE4-201ENST00000420058 TAL2Q16559 108 aa7.39□□□□□ -1.23
NFE4-201ENST00000420058 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.39□□□□□ -1.23
NFE4-201ENST00000420058 SPANXCQ9NY87 97 aa7.39□□□□□ -1.23
NFE4-201ENST00000420058 CBY1Q9Y3M2 126 aa7.39□□□□□ -1.23
NFE4-201ENST00000420058 COX7BP24311 80 aa7.38□□□□□ -1.23
NFE4-201ENST00000420058 HERVK_113P61574 105 aa7.38□□□□□ -1.23
NFE4-201ENST00000420058 IGKCP01834 107 aa7.37□□□□□ -1.23
NFE4-201ENST00000420058 APOC3P02656 99 aa7.37□□□□□ -1.23
NFE4-201ENST00000420058 C6orf99Q4VX62 202 aa7.37□□□□□ -1.23
NFE4-201ENST00000420058 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.36□□□□□ -1.23
NFE4-201ENST00000420058 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.35□□□□□ -1.23
NFE4-201ENST00000420058 E9PLD3 99 aa7.35□□□□□ -1.23
NFE4-201ENST00000420058 SERF1AO75920 110 aa7.35□□□□□ -1.23
NFE4-201ENST00000420058 FABP4P15090 132 aa7.34□□□□□ -1.23
NFE4-201ENST00000420058 Q6Q795 121 aa7.34□□□□□ -1.23
NFE4-201ENST00000420058 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa7.33□□□□□ -1.24
NFE4-201ENST00000420058 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.33□□□□□ -1.24
NFE4-201ENST00000420058 TIMM17BO60830 172 aa7.32□□□□□ -1.24
NFE4-201ENST00000420058 SNAPINO95295 136 aa7.32□□□□□ -1.24
NFE4-201ENST00000420058 CFC1P0CG37 223 aa7.32□□□□□ -1.24
NFE4-201ENST00000420058 HSPB8Q9UJY1 196 aa7.32□□□□□ -1.24
NFE4-201ENST00000420058 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.31□□□□□ -1.24
NFE4-201ENST00000420058 TRGC2P03986 189 aa7.31□□□□□ -1.24
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NFE4-201ENST00000420058 LINC00518Q8N0U6 118 aa7.29□□□□□ -1.24
NFE4-201ENST00000420058 TCL1BO95988 128 aa7.28□□□□□ -1.24
NFE4-201ENST00000420058 Q75L30 129 aa7.28□□□□□ -1.24
NFE4-201ENST00000420058 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.28□□□□□ -1.24
NFE4-201ENST00000420058 MT2AP02795 61 aa7.26□□□□□ -1.25
NFE4-201ENST00000420058 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa7.26□□□□□ -1.25
NFE4-201ENST00000420058 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
NFE4-201ENST00000420058 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.25□□□□□ -1.25
NFE4-201ENST00000420058 A0A1B0GWB2 263 aa7.25□□□□□ -1.25
NFE4-201ENST00000420058 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.25□□□□□ -1.25
NFE4-201ENST00000420058 ZNF815PA8K554 130 aa7.23□□□□□ -1.25
NFE4-201ENST00000420058 NDUFA5Q16718 116 aa7.23□□□□□ -1.25
NFE4-201ENST00000420058 PCP2Q8IVA1 136 aa7.23□□□□□ -1.25
NFE4-201ENST00000420058 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.22□□□□□ -1.25
NFE4-201ENST00000420058 C20orf202A1L168 122 aa7.21□□□□□ -1.26
NFE4-201ENST00000420058 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa7.21□□□□□ -1.26
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