RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373433.8

RPRD1B-201, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPRD1B, Length 3,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-201ENST00000373433 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7.59□□□□□ -1.19
RPRD1B-201ENST00000373433 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.59□□□□□ -1.19
RPRD1B-201ENST00000373433 PLAC8L1A1L4L8 177 aa7.59□□□□□ -1.19
RPRD1B-201ENST00000373433 EPM2AB3EWF7 344 aa7.59□□□□□ -1.19
RPRD1B-201ENST00000373433 UBE2AP49459 152 aa7.58□□□□□ -1.2
RPRD1B-201ENST00000373433 LELP1Q5T871 98 aa7.57□□□□□ -1.2
RPRD1B-201ENST00000373433 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa7.57□□□□□ -1.2
RPRD1B-201ENST00000373433 Q8NDZ9 215 aa7.57□□□□□ -1.2
RPRD1B-201ENST00000373433 BCE1O60756 84 aa7.57□□□□□ -1.2
RPRD1B-201ENST00000373433 C6orf223Q8N319 242 aa7.57□□□□□ -1.2
RPRD1B-201ENST00000373433 CDK2AP2O75956 126 aa7.56□□□□□ -1.2
RPRD1B-201ENST00000373433 NREPQ16612 68 aa7.56□□□□□ -1.2
RPRD1B-201ENST00000373433 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa7.56□□□□□ -1.2
RPRD1B-201ENST00000373433 SYCNQ0VAF6 134 aa7.55□□□□□ -1.2
RPRD1B-201ENST00000373433 Q8N9L7 120 aa7.55□□□□□ -1.2
RPRD1B-201ENST00000373433 VWFP04275 2813 aa7.55□□□□□ -1.2
RPRD1B-201ENST00000373433 NDUFC1O43677 76 aa7.55□□□□□ -1.2
RPRD1B-201ENST00000373433 MUC7Q8TAX7 377 aa7.55□□□□□ -1.2
RPRD1B-201ENST00000373433 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.55□□□□□ -1.2
RPRD1B-201ENST00000373433 CXCL6P80162 114 aa7.54□□□□□ -1.2
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
RPRD1B-201ENST00000373433 BPY2O14599 106 aa7.53□□□□□ -1.2
RPRD1B-201ENST00000373433 C1orf195Q5TG92 126 aa7.53□□□□□ -1.2
RPRD1B-201ENST00000373433 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.52□□□□□ -1.2
RPRD1B-201ENST00000373433 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.52□□□□□ -1.2
RPRD1B-201ENST00000373433 COX17Q14061 63 aa7.52□□□□□ -1.21
RPRD1B-201ENST00000373433 PDE6GP18545 87 aa7.52□□□□□ -1.21
RPRD1B-201ENST00000373433 KIAA0087Q14695 138 aa7.52□□□□□ -1.21
RPRD1B-201ENST00000373433 DIRC1Q969H9 104 aa7.51□□□□□ -1.21
RPRD1B-201ENST00000373433 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
RPRD1B-201ENST00000373433 C10orf25Q5T742 122 aa7.51□□□□□ -1.21
RPRD1B-201ENST00000373433 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.51□□□□□ -1.21
RPRD1B-201ENST00000373433 NDUFS5O43920 106 aa7.5□□□□□ -1.21
RPRD1B-201ENST00000373433 V9GYY9 64 aa7.5□□□□□ -1.21
RPRD1B-201ENST00000373433 AKAP9Q99996 3911 aa7.49□□□□□ -1.21
RPRD1B-201ENST00000373433 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.49□□□□□ -1.21
RPRD1B-201ENST00000373433 LINC00612Q8N6U2 182 aa7.49□□□□□ -1.21
RPRD1B-201ENST00000373433 B9D2Q9BPU9 175 aa7.49□□□□□ -1.21
RPRD1B-201ENST00000373433 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
RPRD1B-201ENST00000373433 A0A1B0GUV1 79 aa7.49□□□□□ -1.21
RPRD1B-201ENST00000373433 PRYO14603 147 aa7.48□□□□□ -1.21
RPRD1B-201ENST00000373433 ESRGQ1W209 222 aa7.47□□□□□ -1.21
RPRD1B-201ENST00000373433 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
RPRD1B-201ENST00000373433 F8WDY8 70 aa7.46□□□□□ -1.21
RPRD1B-201ENST00000373433 C3orf84H3BNL1 204 aa7.46□□□□□ -1.22
RPRD1B-201ENST00000373433 COX7BP24311 80 aa7.46□□□□□ -1.22
RPRD1B-201ENST00000373433 NUPR2A6NF83 97 aa7.45□□□□□ -1.22
RPRD1B-201ENST00000373433 IGLV6-57P01721 117 aa7.45□□□□□ -1.22
RPRD1B-201ENST00000373433 TENM3Q9P273 2699 aa7.45□□□□□ -1.22
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
RPRD1B-201ENST00000373433 SEC61GP60059 68 aa7.45□□□□□ -1.22
RPRD1B-201ENST00000373433 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.45□□□□□ -1.22
RPRD1B-201ENST00000373433 H3BNG1 76 aa7.44□□□□□ -1.22
RPRD1B-201ENST00000373433 H3BQ85 93 aa7.42□□□□□ -1.22
RPRD1B-201ENST00000373433 IGKV4-1P06312 121 aa7.42□□□□□ -1.22
RPRD1B-201ENST00000373433 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.42□□□□□ -1.22
RPRD1B-201ENST00000373433 OCR1Q9BZK8 76 aa7.4□□□□□ -1.22
RPRD1B-201ENST00000373433 H0Y9J4 135 aa7.4□□□□□ -1.23
RPRD1B-201ENST00000373433 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.39□□□□□ -1.23
RPRD1B-201ENST00000373433 ERC2-IT1O76042 136 aa7.39□□□□□ -1.23
RPRD1B-201ENST00000373433 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RPRD1B-201ENST00000373433 Q6ZRU5 148 aa7.39□□□□□ -1.23
RPRD1B-201ENST00000373433 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
RPRD1B-201ENST00000373433 PRR4Q16378 134 aa7.38□□□□□ -1.23
RPRD1B-201ENST00000373433 LINC00588Q9Y4M8 146 aa7.38□□□□□ -1.23
RPRD1B-201ENST00000373433 LINC01556Q5JQF7 62 aa7.37□□□□□ -1.23
RPRD1B-201ENST00000373433 SMIM29Q86T20 159 aa7.37□□□□□ -1.23
RPRD1B-201ENST00000373433 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.37□□□□□ -1.23
RPRD1B-201ENST00000373433 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.37□□□□□ -1.23
RPRD1B-201ENST00000373433 PSPHP1O15172 72 aa7.36□□□□□ -1.23
RPRD1B-201ENST00000373433 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RPRD1B-201ENST00000373433 C14orf177Q52M58 125 aa7.36□□□□□ -1.23
RPRD1B-201ENST00000373433 PRLHP81277 87 aa7.34□□□□□ -1.23
RPRD1B-201ENST00000373433 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RPRD1B-201ENST00000373433 CHTF8P0CG12 524 aa7.32□□□□□ -1.24
RPRD1B-201ENST00000373433 DEFB116Q30KQ4 102 aa7.32□□□□□ -1.24
RPRD1B-201ENST00000373433 C1orf64Q8NEQ6 169 aa7.32□□□□□ -1.24
RPRD1B-201ENST00000373433 hDV103S1A0JD37 113 aa7.32□□□□□ -1.24
RPRD1B-201ENST00000373433 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.31□□□□□ -1.24
RPRD1B-201ENST00000373433 VPREB1P12018 145 aa7.31□□□□□ -1.24
RPRD1B-201ENST00000373433 PMAIP1Q13794 54 aa7.31□□□□□ -1.24
RPRD1B-201ENST00000373433 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.31□□□□□ -1.24
RPRD1B-201ENST00000373433 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa7.31□□□□□ -1.24
RPRD1B-201ENST00000373433 M0R378 163 aa7.31□□□□□ -1.24
RPRD1B-201ENST00000373433 Q6ZRP5 223 aa7.3□□□□□ -1.24
RPRD1B-201ENST00000373433 DNAH10OSP0CZ25 163 aa7.29□□□□□ -1.24
RPRD1B-201ENST00000373433 C1orf134Q5TEV5 83 aa7.29□□□□□ -1.24
RPRD1B-201ENST00000373433 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RPRD1B-201ENST00000373433 WFDC13Q8IUB5 93 aa7.28□□□□□ -1.24
RPRD1B-201ENST00000373433 C7orf33Q8WU49 177 aa7.28□□□□□ -1.24
RPRD1B-201ENST00000373433 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa7.27□□□□□ -1.24
RPRD1B-201ENST00000373433 PRR15Q8IV56 129 aa7.27□□□□□ -1.25
RPRD1B-201ENST00000373433 PRR34Q9NV39 138 aa7.27□□□□□ -1.25
RPRD1B-201ENST00000373433 NDUFB1O75438 58 aa7.26□□□□□ -1.25
RPRD1B-201ENST00000373433 C1orf137Q5JT78 98 aa7.26□□□□□ -1.25
RPRD1B-201ENST00000373433 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa7.26□□□□□ -1.25
RPRD1B-201ENST00000373433 TRAV22A0A0B4J277 110 aa7.25□□□□□ -1.25
RPRD1B-201ENST00000373433 Q8N377 158 aa7.25□□□□□ -1.25
RPRD1B-201ENST00000373433 Q1T7F1 81 aa7.24□□□□□ -1.25
RPRD1B-201ENST00000373433 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96.2 ms