RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592911.5

SMAD4-215, Transcript of SMAD family member 4, human

TSL 5

Gene SMAD4, Length 475 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMAD4-215	ENST00000592911	TMEM250	H0YL14	139 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SMAD4-215	ENST00000592911	HBB	P68871	147 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SMAD4-215	ENST00000592911	KIAA0087	Q14695	138 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SMAD4-215	ENST00000592911	VAMP3	Q15836	100 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SMAD4-215	ENST00000592911	PMCHL1	Q16048	86 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SMAD4-215	ENST00000592911	COX19	Q49B96	90 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SMAD4-215	ENST00000592911	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SMAD4-215	ENST00000592911	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SMAD4-215	ENST00000592911	C10orf25	Q5T742	122 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SMAD4-215	ENST00000592911		K7EN84	100 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SMAD4-215	ENST00000592911	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SMAD4-215	ENST00000592911		Q6ZN92	141 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SMAD4-215	ENST00000592911	OCC1	Q8TAD7	63 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SMAD4-215	ENST00000592911	TNFRSF6B	O95407	300 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SMAD4-215	ENST00000592911	IGLC3	P0DOY3	106 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SMAD4-215	ENST00000592911	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SMAD4-215	ENST00000592911	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SMAD4-215	ENST00000592911	NRAC	Q8N912	160 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SMAD4-215	ENST00000592911	C22orf24	Q9Y442	160 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SMAD4-215	ENST00000592911	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SMAD4-215	ENST00000592911	HIGD1C	A8MV81	97 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SMAD4-215	ENST00000592911	RIG	Q13278	110 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SMAD4-215	ENST00000592911	SPATA45	Q537H7	98 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SMAD4-215	ENST00000592911	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
SMAD4-215	ENST00000592911	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
SMAD4-215	ENST00000592911	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SMAD4-215	ENST00000592911	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SMAD4-215	ENST00000592911	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SMAD4-215	ENST00000592911		A0A1B0GW15	77 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SMAD4-215	ENST00000592911		J3QR89	54 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SMAD4-215	ENST00000592911	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
SMAD4-215	ENST00000592911	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SMAD4-215	ENST00000592911	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
SMAD4-215	ENST00000592911	AMN1	Q8IY45	258 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SMAD4-215	ENST00000592911	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SMAD4-215	ENST00000592911	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		5	□□□□□ -1.61
SMAD4-215	ENST00000592911	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
SMAD4-215	ENST00000592911	ADIRF	Q15847	76 aa		5	□□□□□ -1.61
SMAD4-215	ENST00000592911	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		5	□□□□□ -1.61
SMAD4-215	ENST00000592911		Q8IZM0	81 aa		5	□□□□□ -1.61
SMAD4-215	ENST00000592911	FAM104A	Q969W3	186 aa		5	□□□□□ -1.61
SMAD4-215	ENST00000592911	SIGMAR1	Q99720	223 aa		5	□□□□□ -1.61
SMAD4-215	ENST00000592911	PRSS2	P07478	247 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMAD4-215	ENST00000592911	CFC1B	P0CG36	223 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMAD4-215	ENST00000592911	CXCL5	P42830	114 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMAD4-215	ENST00000592911	CKS1B	P61024	79 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMAD4-215	ENST00000592911	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMAD4-215	ENST00000592911	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMAD4-215	ENST00000592911	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMAD4-215	ENST00000592911	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMAD4-215	ENST00000592911	OSTC	Q9NRP0	149 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SMAD4-215	ENST00000592911	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SMAD4-215	ENST00000592911	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SMAD4-215	ENST00000592911	SEC11A	P67812	179 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SMAD4-215	ENST00000592911	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SMAD4-215	ENST00000592911	BAGE3	Q86Y29	109 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SMAD4-215	ENST00000592911		F8VRH5	84 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SMAD4-215	ENST00000592911	UBE2A	P49459	152 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SMAD4-215	ENST00000592911	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SMAD4-215	ENST00000592911	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SMAD4-215	ENST00000592911	C2orf82	Q6UX34	121 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SMAD4-215	ENST00000592911	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SMAD4-215	ENST00000592911	TMEM141	Q96I45	108 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SMAD4-215	ENST00000592911	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SMAD4-215	ENST00000592911	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SMAD4-215	ENST00000592911		A6NDN8	102 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMAD4-215	ENST00000592911	GAGE10	A6NGK3	116 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMAD4-215	ENST00000592911	TAX1BP3	O14907	124 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMAD4-215	ENST00000592911	CKS2	P33552	79 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMAD4-215	ENST00000592911	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMAD4-215	ENST00000592911	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SMAD4-215	ENST00000592911	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMAD4-215	ENST00000592911	FA2H	Q7L5A8	372 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SMAD4-215	ENST00000592911	SMKR1	H3BMG3	65 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMAD4-215	ENST00000592911	TRIAP1	O43715	76 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMAD4-215	ENST00000592911	SERF1A	O75920	110 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMAD4-215	ENST00000592911	KRTDAP	P60985	99 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMAD4-215	ENST00000592911	LINC00167	Q96N53	147 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SMAD4-215	ENST00000592911	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMAD4-215	ENST00000592911		K7EMI3	77 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMAD4-215	ENST00000592911	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SMAD4-215	ENST00000592911	HERVK_113	P63121	156 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMAD4-215	ENST00000592911	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMAD4-215	ENST00000592911	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMAD4-215	ENST00000592911	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SMAD4-215	ENST00000592911		H3BRM9	83 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SMAD4-215	ENST00000592911	HSD52	Q0P140	79 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SMAD4-215	ENST00000592911	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SMAD4-215	ENST00000592911	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SMAD4-215	ENST00000592911	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SMAD4-215	ENST00000592911	AMELX	Q99217	191 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SMAD4-215	ENST00000592911	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SMAD4-215	ENST00000592911		V9GYV3	84 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SMAD4-215	ENST00000592911		K7EP34	96 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMAD4-215	ENST00000592911	SPINK1	P00995	79 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMAD4-215	ENST00000592911	C3orf79	P0CE67	100 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMAD4-215	ENST00000592911	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMAD4-215	ENST00000592911	VCX2	Q9H322	139 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMAD4-215	ENST00000592911	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SMAD4-215	ENST00000592911	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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