RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551155.1

CS-224, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-224ENST00000551155 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-224ENST00000551155 XAGE1AQ9HD64 81 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-224ENST00000551155 FAM168BA1KXE4 195 aa5.84□□□□□ -1.47
CS-224ENST00000551155 C20orf202A1L168 122 aa5.84□□□□□ -1.47
CS-224ENST00000551155 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
CS-224ENST00000551155 KRTDAPP60985 99 aa5.84□□□□□ -1.47
CS-224ENST00000551155 NDUFA12Q9UI09 145 aa5.84□□□□□ -1.47
CS-224ENST00000551155 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa5.84□□□□□ -1.47
CS-224ENST00000551155 DNAH8Q96JB1 4490 aa5.84□□□□□ -1.48
CS-224ENST00000551155 E9PLD3 99 aa5.83□□□□□ -1.48
CS-224ENST00000551155 J3QQQ9 107 aa5.83□□□□□ -1.48
CS-224ENST00000551155 M0QXV9 152 aa5.83□□□□□ -1.48
CS-224ENST00000551155 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CS-224ENST00000551155 NMUP48645 174 aa5.83□□□□□ -1.48
CS-224ENST00000551155 LINC00158P58513 81 aa5.83□□□□□ -1.48
CS-224ENST00000551155 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
CS-224ENST00000551155 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
CS-224ENST00000551155 UBE2BP63146 152 aa5.82□□□□□ -1.48
CS-224ENST00000551155 PRR3P79522 188 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
CS-224ENST00000551155 MEIG1Q5JSS6 88 aa5.82□□□□□ -1.48
CS-224ENST00000551155 HIST3H2BBQ8N257 126 aa5.82□□□□□ -1.48
CS-224ENST00000551155 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa5.82□□□□□ -1.48
CS-224ENST00000551155 TP73-AS1Q9UF72 201 aa5.82□□□□□ -1.48
CS-224ENST00000551155 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
CS-224ENST00000551155 RPL24P83731 157 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
CS-224ENST00000551155 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa5.81□□□□□ -1.48
CS-224ENST00000551155 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa5.81□□□□□ -1.48
CS-224ENST00000551155 C22orf24Q9Y442 160 aa5.81□□□□□ -1.48
CS-224ENST00000551155 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
CS-224ENST00000551155 NKAPP1Q8N9T2 125 aa5.8□□□□□ -1.48
CS-224ENST00000551155 HIST1H2BLQ99880 126 aa5.8□□□□□ -1.48
CS-224ENST00000551155 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa5.8□□□□□ -1.48
CS-224ENST00000551155 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa5.79□□□□□ -1.48
CS-224ENST00000551155 SMIM13P0DJ93 91 aa5.79□□□□□ -1.48
CS-224ENST00000551155 TSPEAR-AS2P59090 65 aa5.79□□□□□ -1.48
CS-224ENST00000551155 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
CS-224ENST00000551155 A0A0U1RRA0 63 aa5.78□□□□□ -1.48
CS-224ENST00000551155 C1orf137Q5JT78 98 aa5.78□□□□□ -1.48
CS-224ENST00000551155 SPINK6Q6UWN8 80 aa5.78□□□□□ -1.48
CS-224ENST00000551155 C5orf52A6NGY3 159 aa5.77□□□□□ -1.49
CS-224ENST00000551155 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa5.77□□□□□ -1.49
CS-224ENST00000551155 LINC00167Q96N53 147 aa5.77□□□□□ -1.49
CS-224ENST00000551155 FAT1Q14517 4588 aa5.77□□□□□ -1.49
CS-224ENST00000551155 OXTP01178 125 aa5.76□□□□□ -1.49
CS-224ENST00000551155 VPREB1P12018 145 aa5.76□□□□□ -1.49
CS-224ENST00000551155 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
CS-224ENST00000551155 MIEN1Q9BRT3 115 aa5.76□□□□□ -1.49
CS-224ENST00000551155 A0A0J9YXY3 114 aa5.75□□□□□ -1.49
CS-224ENST00000551155 RPL37AP8A6NKH3 93 aa5.75□□□□□ -1.49
CS-224ENST00000551155 ZNF815PA8K554 130 aa5.75□□□□□ -1.49
CS-224ENST00000551155 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
CS-224ENST00000551155 HSBP1L1C9JCN9 74 aa5.75□□□□□ -1.49
CS-224ENST00000551155 IGLV7-43P04211 117 aa5.75□□□□□ -1.49
CS-224ENST00000551155 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.75□□□□□ -1.49
CS-224ENST00000551155 BOD1L2Q8IYS8 172 aa5.75□□□□□ -1.49
CS-224ENST00000551155 ATOH7Q8N100 152 aa5.75□□□□□ -1.49
CS-224ENST00000551155 PCLOQ9Y6V0 5065 aa5.75□□□□□ -1.49
CS-224ENST00000551155 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-224ENST00000551155 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-224ENST00000551155 GAGE10A6NGK3 116 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-224ENST00000551155 M0R378 163 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-224ENST00000551155 TIMM17BO60830 172 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-224ENST00000551155 REG3GQ6UW15 175 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-224ENST00000551155 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-224ENST00000551155 ARL17AQ8IVW1 177 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-224ENST00000551155 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa5.73□□□□□ -1.49
CS-224ENST00000551155 DAND5Q8N907 189 aa5.73□□□□□ -1.49
CS-224ENST00000551155 DIRC1Q969H9 104 aa5.73□□□□□ -1.49
CS-224ENST00000551155 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.72□□□□□ -1.49
CS-224ENST00000551155 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa5.72□□□□□ -1.49
CS-224ENST00000551155 BCE1O60756 84 aa5.72□□□□□ -1.49
CS-224ENST00000551155 NDUFC2O95298 119 aa5.72□□□□□ -1.49
CS-224ENST00000551155 SCGB1D1O95968 90 aa5.72□□□□□ -1.49
CS-224ENST00000551155 IGKV2D-28P01615 120 aa5.72□□□□□ -1.49
CS-224ENST00000551155 S100A12P80511 92 aa5.72□□□□□ -1.49
CS-224ENST00000551155 ANKRD39Q53RE8 183 aa5.72□□□□□ -1.49
CS-224ENST00000551155 SCGB1D4Q6XE38 83 aa5.72□□□□□ -1.49
CS-224ENST00000551155 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa5.71□□□□□ -1.5
CS-224ENST00000551155 ZNF861PO60384 105 aa5.71□□□□□ -1.5
CS-224ENST00000551155 RPL28P46779 137 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
CS-224ENST00000551155 Q8NDZ9 215 aa5.71□□□□□ -1.5
CS-224ENST00000551155 COPS9Q8WXC6 57 aa5.71□□□□□ -1.5
CS-224ENST00000551155 ABCA13Q86UQ4 5058 aa5.71□□□□□ -1.5
CS-224ENST00000551155 TMEM238C9JI98 176 aa5.7□□□□□ -1.5
CS-224ENST00000551155 NCR3O14931 201 aa5.7□□□□□ -1.5
CS-224ENST00000551155 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa5.7□□□□□ -1.5
CS-224ENST00000551155 TTTY13Q9BZ97 58 aa5.7□□□□□ -1.5
CS-224ENST00000551155 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
CS-224ENST00000551155 H0Y9J4 135 aa5.69□□□□□ -1.5
CS-224ENST00000551155 UBE2AP49459 152 aa5.69□□□□□ -1.5
CS-224ENST00000551155 Q6ZVH6 145 aa5.69□□□□□ -1.5
CS-224ENST00000551155 LINC00308Q8TCZ7 52 aa5.69□□□□□ -1.5
CS-224ENST00000551155 LINC01600Q96MT4 127 aa5.69□□□□□ -1.5
CS-224ENST00000551155 LITAFQ99732 161 aa5.69□□□□□ -1.5
CS-224ENST00000551155 SPANXDQ9BXN6 97 aa5.69□□□□□ -1.5
CS-224ENST00000551155 TMEM126AQ9H061 195 aa5.69□□□□□ -1.5
CS-224ENST00000551155 SPANXCQ9NY87 97 aa5.69□□□□□ -1.5
CS-224ENST00000551155 PRYO14603 147 aa5.68□□□□□ -1.5
CS-224ENST00000551155 IFITM1P13164 125 aa5.68□□□□□ -1.5
CS-224ENST00000551155 NPC2P61916 151 aa5.68□□□□□ -1.5
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