RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533873.1

ACER3-213, Transcript of alkaline ceramidase 3, human

TSL 2 BASIC

Gene ACER3, Length 929 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACER3-213	ENST00000533873	LECT2	O14960	151 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ACER3-213	ENST00000533873	TRAC	P01848	142 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ACER3-213	ENST00000533873	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
ACER3-213	ENST00000533873	HERVK_113	P61574	105 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ACER3-213	ENST00000533873	PMVK	Q15126	192 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ACER3-213	ENST00000533873	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ACER3-213	ENST00000533873	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ACER3-213	ENST00000533873	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACER3-213	ENST00000533873	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACER3-213	ENST00000533873	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACER3-213	ENST00000533873	EPM2A	B3EWF7	344 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACER3-213	ENST00000533873		F8VRH5	84 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACER3-213	ENST00000533873	SMKR1	H3BMG3	65 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACER3-213	ENST00000533873	TNFRSF6B	O95407	300 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACER3-213	ENST00000533873	PPP1R17	O96001	155 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACER3-213	ENST00000533873	KRTAP10-1	P60331	282 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACER3-213	ENST00000533873	LINC01620	Q4KN68	170 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACER3-213	ENST00000533873	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACER3-213	ENST00000533873	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACER3-213	ENST00000533873	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACER3-213	ENST00000533873		Q8N8P6	123 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACER3-213	ENST00000533873	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ACER3-213	ENST00000533873	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ACER3-213	ENST00000533873		A0A1B0GUV1	79 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACER3-213	ENST00000533873	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACER3-213	ENST00000533873	ACYP1	P07311	99 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACER3-213	ENST00000533873	COX7C	P15954	63 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACER3-213	ENST00000533873	TMEM258	P61165	79 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACER3-213	ENST00000533873	REG3A	Q06141	175 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACER3-213	ENST00000533873		Q1RN00	199 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACER3-213	ENST00000533873	ENHO	Q6UWT2	76 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACER3-213	ENST00000533873	C2orf82	Q6UX34	121 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACER3-213	ENST00000533873	LINC01600	Q96MT4	127 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACER3-213	ENST00000533873	PRR34	Q9NV39	138 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ACER3-213	ENST00000533873	USP17L23	D6RBM5	183 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ACER3-213	ENST00000533873		H3BT86	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ACER3-213	ENST00000533873		H7C423	109 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ACER3-213	ENST00000533873		I3L3M4	83 aa		4.53	□□□□□ -1.68
ACER3-213	ENST00000533873	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
ACER3-213	ENST00000533873	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	ATOX1	O00244	68 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	CFC1B	P0CG36	223 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	CFC1	P0CG37	223 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	CRYGA	P11844	174 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	MAL	P21145	153 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	PKD1	P98161	4303 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873		A0A0B4J2C4	111 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	CXCL5	P42830	114 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873		Q5VSD8	79 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.51	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	VCY	O14598	125 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	COX6C	P09669	75 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873		Q6ZSA8	131 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	LINC00643	Q86TS7	51 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	DPH3	Q96FX2	82 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	RNF185	Q96GF1	192 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	TSHB	P01222	138 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	HAMP	P81172	84 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873		H7C2G1	150 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	C4orf26	Q17RF5	130 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	TOMM6	Q96B49	74 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	hADV29S1	A0JD25	119 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	SEC61G	P60059	68 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	SS18	Q15532	418 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	SCX	Q7RTU7	201 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873		V9GYY9	64 aa		4.47	□□□□□ -1.69
ACER3-213	ENST00000533873	HSPG2	P98160	4391 aa		4.47	□□□□□ -1.69

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