RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472760.1

PRPF40A-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF40A, Length 243 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-208ENST00000472760 C9orf62Q8N4C0 152 aa-1.09□□□□□ -2.58
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PRPF40A-208ENST00000472760 REV3LO60673 3130 aa-1.37□□□□□ -2.63
PRPF40A-208ENST00000472760 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP-1.37□□□□□ -2.63
PRPF40A-208ENST00000472760 ATP10BO94823 1461 aa-1.37□□□□□ -2.63
PRPF40A-208ENST00000472760 QSER1Q2KHR3 1735 aa-1.38□□□□□ -2.63
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PRPF40A-208ENST00000472760 SMIM11AP58511 58 aa-1.39□□□□□ -2.63
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PRPF40A-208ENST00000472760 KNL1Q8NG31 2342 aa-1.39□□□□□ -2.63
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