RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437322.2

USP27X-AS1-201, Transcript of USP27X antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP27X-AS1, Length 2,175 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa11.83□□□□□ -0.52
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SS18Q15532 418 aa11.83□□□□□ -0.52
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TENM3Q9P273 2699 aa11.82□□□□□ -0.52
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CCKP06307 115 aa11.82□□□□□ -0.52
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LINC01561Q8N1V8 128 aa11.82□□□□□ -0.52
USP27X-AS1-201ENST00000437322 OR13C6PQ8NH95 151 aa11.82□□□□□ -0.52
USP27X-AS1-201ENST00000437322 UPK3BQ9BT76 320 aa11.82□□□□□ -0.52
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SLPIP03973 132 aa11.81□□□□□ -0.52
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa11.8□□□□□ -0.52
USP27X-AS1-201ENST00000437322 USP17L23D6RBM5 183 aa11.8□□□□□ -0.52
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TMEM258P61165 79 aa11.8□□□□□ -0.52
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PRO0255Q9UI72 69 aa11.8□□□□□ -0.52
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C6orf226Q5I0X4 101 aa11.79□□□□□ -0.52
USP27X-AS1-201ENST00000437322 S100A7L2Q5SY68 101 aa11.79□□□□□ -0.52
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CYSTM1Q9H1C7 97 aa11.79□□□□□ -0.52
USP27X-AS1-201ENST00000437322 A0A087WVE0 104 aa11.79□□□□□ -0.52
USP27X-AS1-201ENST00000437322 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa11.79□□□□□ -0.52
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GYPEP15421 78 aa11.78□□□□□ -0.52
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa11.78□□□□□ -0.52
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
USP27X-AS1-201ENST00000437322 Q8IZM0 81 aa11.77□□□□□ -0.53
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MRAPQ8TCY5 172 aa11.77□□□□□ -0.53
USP27X-AS1-201ENST00000437322 HTN3P15516 51 aa11.77□□□□□ -0.53
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
USP27X-AS1-201ENST00000437322 Q8N814 137 aa11.75□□□□□ -0.53
USP27X-AS1-201ENST00000437322 A0A0J9YWU9 116 aa11.75□□□□□ -0.53
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LYPD5Q6UWN5 251 aa11.75□□□□□ -0.53
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TM2D3Q9BRN9 247 aa11.75□□□□□ -0.53
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa11.74□□□□□ -0.53
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DPH3Q96FX2 82 aa11.74□□□□□ -0.53
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NDUFC2O95298 119 aa11.74□□□□□ -0.53
USP27X-AS1-201ENST00000437322 A0A1B0GUV1 79 aa11.73□□□□□ -0.53
USP27X-AS1-201ENST00000437322 A0A096LPF7 62 aa11.71□□□□□ -0.53
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa11.71□□□□□ -0.53
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C5orf47Q569G3 176 aa11.71□□□□□ -0.53
USP27X-AS1-201ENST00000437322 XCL1P47992 114 aa11.71□□□□□ -0.54
USP27X-AS1-201ENST00000437322 Q6ZTC4 211 aa11.7□□□□□ -0.54
USP27X-AS1-201ENST00000437322 COX17Q14061 63 aa11.69□□□□□ -0.54
USP27X-AS1-201ENST00000437322 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C11orf45Q8TAV5 145 aa11.68□□□□□ -0.54
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa11.67□□□□□ -0.54
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PRR3P79522 188 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KIAA0087Q14695 138 aa11.67□□□□□ -0.54
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GHRHP01286 108 aa11.66□□□□□ -0.54
USP27X-AS1-201ENST00000437322 UBL5Q9BZL1 73 aa11.65□□□□□ -0.54
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa11.64□□□□□ -0.55
USP27X-AS1-201ENST00000437322 BCE1O60756 84 aa11.63□□□□□ -0.55
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa11.63□□□□□ -0.55
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ENHOQ6UWT2 76 aa11.63□□□□□ -0.55
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CD164L2Q6UWJ8 174 aa11.62□□□□□ -0.55
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DSCR8Q96T75 97 aa11.62□□□□□ -0.55
USP27X-AS1-201ENST00000437322 OXTP01178 125 aa11.62□□□□□ -0.55
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LINC00575Q6W349 94 aa11.62□□□□□ -0.55
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa11.61□□□□□ -0.55
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa11.61□□□□□ -0.55
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa11.61□□□□□ -0.55
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa11.61□□□□□ -0.55
USP27X-AS1-201ENST00000437322 H3BNG1 76 aa11.61□□□□□ -0.55
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C6orf99Q4VX62 202 aa11.61□□□□□ -0.55
USP27X-AS1-201ENST00000437322 B9D2Q9BPU9 175 aa11.61□□□□□ -0.55
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DNAH9Q9NYC9 4486 aa11.61□□□□□ -0.55
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CLPSL2Q6UWE3 100 aa11.6□□□□□ -0.55
USP27X-AS1-201ENST00000437322 Q6ZQT0 140 aa11.6□□□□□ -0.55
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
USP27X-AS1-201ENST00000437322 COL7A1Q02388 2944 aa11.59□□□□□ -0.55
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RBM3P98179 157 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa11.58□□□□□ -0.56
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C6orf223Q8N319 242 aa11.58□□□□□ -0.56
USP27X-AS1-201ENST00000437322 Q8NDZ9 215 aa11.58□□□□□ -0.56
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MUC7Q8TAX7 377 aa11.58□□□□□ -0.56
USP27X-AS1-201ENST00000437322 STAB2Q8WWQ8 2551 aa11.58□□□□□ -0.56
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LELP1Q5T871 98 aa11.57□□□□□ -0.56
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LINC00269Q8N2A0 174 aa11.57□□□□□ -0.56
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRAV10A0A0B4J240 114 aa11.55□□□□□ -0.56
USP27X-AS1-201ENST00000437322 H3BQ85 93 aa11.55□□□□□ -0.56
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRAV7A0A075B6U4 112 aa11.54□□□□□ -0.56
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PDE6GP18545 87 aa11.53□□□□□ -0.56
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C20orf197Q8N268 126 aa11.53□□□□□ -0.56
USP27X-AS1-201ENST00000437322 Q8N3U1 123 aa11.53□□□□□ -0.56
USP27X-AS1-201ENST00000437322 REG3AQ06141 175 aa11.52□□□□□ -0.56
USP27X-AS1-201ENST00000437322 Q5XG85 94 aa11.52□□□□□ -0.56
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IGLV6-57P01721 117 aa11.52□□□□□ -0.57
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa11.51□□□□□ -0.57
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa11.5□□□□□ -0.57
USP27X-AS1-201ENST00000437322 EPM2AB3EWF7 344 aa11.5□□□□□ -0.57
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ANGP03950 147 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FAM236CP0DP71 79 aa11.5□□□□□ -0.57
USP27X-AS1-201ENST00000437322 Q6ZVQ6 151 aa11.5□□□□□ -0.57
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa11.49□□□□□ -0.57
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ESRGQ1W209 222 aa11.49□□□□□ -0.57
USP27X-AS1-201ENST00000437322 M0R2N4 97 aa11.48□□□□□ -0.57
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CXCL6P80162 114 aa11.48□□□□□ -0.57
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C4orf26Q17RF5 130 aa11.48□□□□□ -0.57
USP27X-AS1-201ENST00000437322 H7BZZ5 65 aa11.47□□□□□ -0.57
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C10orf25Q5T742 122 aa11.47□□□□□ -0.57
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KLKP1Q107X0 134 aa11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.2 ms