RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.48□□□□□ -1.37
ATG4B-210ENST00000428861 VPREB1P12018 145 aa6.48□□□□□ -1.37
ATG4B-210ENST00000428861 COX17Q14061 63 aa6.48□□□□□ -1.37
ATG4B-210ENST00000428861 SMIM13P0DJ93 91 aa6.47□□□□□ -1.37
ATG4B-210ENST00000428861 DIRC1Q969H9 104 aa6.47□□□□□ -1.37
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF861PO60384 105 aa6.46□□□□□ -1.38
ATG4B-210ENST00000428861 LINC00158P58513 81 aa6.46□□□□□ -1.38
ATG4B-210ENST00000428861 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.46□□□□□ -1.38
ATG4B-210ENST00000428861 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4B-210ENST00000428861 BCE1O60756 84 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4B-210ENST00000428861 DPM2O94777 84 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4B-210ENST00000428861 IGKV2D-28P01615 120 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4B-210ENST00000428861 SFTA2Q6UW10 78 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4B-210ENST00000428861 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4B-210ENST00000428861 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4B-210ENST00000428861 LEPROTO15243 131 aa6.44□□□□□ -1.38
ATG4B-210ENST00000428861 IGKCP01834 107 aa6.44□□□□□ -1.38
ATG4B-210ENST00000428861 PLNP26678 52 aa6.44□□□□□ -1.38
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.44□□□□□ -1.38
ATG4B-210ENST00000428861 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.44□□□□□ -1.38
ATG4B-210ENST00000428861 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.43□□□□□ -1.38
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM238C9JI98 176 aa6.43□□□□□ -1.38
ATG4B-210ENST00000428861 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.43□□□□□ -1.38
ATG4B-210ENST00000428861 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.43□□□□□ -1.38
ATG4B-210ENST00000428861 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.43□□□□□ -1.38
ATG4B-210ENST00000428861 J3QQQ9 107 aa6.42□□□□□ -1.38
ATG4B-210ENST00000428861 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
ATG4B-210ENST00000428861 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
ATG4B-210ENST00000428861 DAND5Q8N907 189 aa6.42□□□□□ -1.38
ATG4B-210ENST00000428861 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.41□□□□□ -1.38
ATG4B-210ENST00000428861 M0R378 163 aa6.41□□□□□ -1.38
ATG4B-210ENST00000428861 HERV-K104P63124 156 aa6.41□□□□□ -1.38
ATG4B-210ENST00000428861 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.41□□□□□ -1.38
ATG4B-210ENST00000428861 C3orf79P0CE67 100 aa6.4□□□□□ -1.38
ATG4B-210ENST00000428861 LINC01545Q5VT33 79 aa6.4□□□□□ -1.38
ATG4B-210ENST00000428861 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.4□□□□□ -1.38
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM126AQ9H061 195 aa6.4□□□□□ -1.38
ATG4B-210ENST00000428861 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.39□□□□□ -1.39
ATG4B-210ENST00000428861 E9PLD3 99 aa6.39□□□□□ -1.39
ATG4B-210ENST00000428861 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
ATG4B-210ENST00000428861 HERVK_113P61574 105 aa6.39□□□□□ -1.39
ATG4B-210ENST00000428861 PRLHP81277 87 aa6.39□□□□□ -1.39
ATG4B-210ENST00000428861 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.39□□□□□ -1.39
ATG4B-210ENST00000428861 LRP2P98164 4655 aa6.39□□□□□ -1.39
ATG4B-210ENST00000428861 A0A087X002 238 aa6.38□□□□□ -1.39
ATG4B-210ENST00000428861 NCR3O14931 201 aa6.38□□□□□ -1.39
ATG4B-210ENST00000428861 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
ATG4B-210ENST00000428861 ATP6V1G1O75348 118 aa6.38□□□□□ -1.39
ATG4B-210ENST00000428861 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
ATG4B-210ENST00000428861 PET117Q6UWS5 81 aa6.38□□□□□ -1.39
ATG4B-210ENST00000428861 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.37□□□□□ -1.39
ATG4B-210ENST00000428861 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.37□□□□□ -1.39
ATG4B-210ENST00000428861 A0A0J9YXY3 114 aa6.37□□□□□ -1.39
ATG4B-210ENST00000428861 NMUP48645 174 aa6.37□□□□□ -1.39
ATG4B-210ENST00000428861 UBE2AP49459 152 aa6.37□□□□□ -1.39
ATG4B-210ENST00000428861 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.37□□□□□ -1.39
ATG4B-210ENST00000428861 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.37□□□□□ -1.39
ATG4B-210ENST00000428861 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.37□□□□□ -1.39
ATG4B-210ENST00000428861 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.37□□□□□ -1.39
ATG4B-210ENST00000428861 LINC00587B1AMM8 73 aa6.36□□□□□ -1.39
ATG4B-210ENST00000428861 KRTDAPP60985 99 aa6.36□□□□□ -1.39
ATG4B-210ENST00000428861 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.36□□□□□ -1.39
ATG4B-210ENST00000428861 S100A1P23297 94 aa6.35□□□□□ -1.39
ATG4B-210ENST00000428861 LITAFQ99732 161 aa6.35□□□□□ -1.39
ATG4B-210ENST00000428861 LPAP08519 4548 aa6.35□□□□□ -1.39
ATG4B-210ENST00000428861 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
ATG4B-210ENST00000428861 SPRR1AP35321 89 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4B-210ENST00000428861 NPC2P61916 151 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4B-210ENST00000428861 PRYO14603 147 aa6.33□□□□□ -1.4
ATG4B-210ENST00000428861 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.33□□□□□ -1.4
ATG4B-210ENST00000428861 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
ATG4B-210ENST00000428861 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.32□□□□□ -1.4
ATG4B-210ENST00000428861 ATOH7Q8N100 152 aa6.32□□□□□ -1.4
ATG4B-210ENST00000428861 CRYGAP11844 174 aa6.31□□□□□ -1.4
ATG4B-210ENST00000428861 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.31□□□□□ -1.4
ATG4B-210ENST00000428861 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.31□□□□□ -1.4
ATG4B-210ENST00000428861 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.3□□□□□ -1.4
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF815PA8K554 130 aa6.3□□□□□ -1.4
ATG4B-210ENST00000428861 NDUFC2O95298 119 aa6.3□□□□□ -1.4
ATG4B-210ENST00000428861 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.3□□□□□ -1.4
ATG4B-210ENST00000428861 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.3□□□□□ -1.4
ATG4B-210ENST00000428861 IGLV6-57P01721 117 aa6.29□□□□□ -1.4
ATG4B-210ENST00000428861 DDTP30046 118 aa6.29□□□□□ -1.4
ATG4B-210ENST00000428861 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.29□□□□□ -1.4
ATG4B-210ENST00000428861 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.29□□□□□ -1.4
ATG4B-210ENST00000428861 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.29□□□□□ -1.4
ATG4B-210ENST00000428861 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.29□□□□□ -1.4
ATG4B-210ENST00000428861 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
ATG4B-210ENST00000428861 B5MCH6 92 aa6.28□□□□□ -1.4
ATG4B-210ENST00000428861 TIMM17BO60830 172 aa6.28□□□□□ -1.4
ATG4B-210ENST00000428861 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.28□□□□□ -1.4
ATG4B-210ENST00000428861 SPRR4Q96PI1 79 aa6.28□□□□□ -1.4
ATG4B-210ENST00000428861 C20orf202A1L168 122 aa6.27□□□□□ -1.41
ATG4B-210ENST00000428861 ERC2-IT1O76042 136 aa6.27□□□□□ -1.41
ATG4B-210ENST00000428861 TSPAN13O95857 204 aa6.27□□□□□ -1.41
ATG4B-210ENST00000428861 PCP2Q8IVA1 136 aa6.27□□□□□ -1.41
ATG4B-210ENST00000428861 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.27□□□□□ -1.41
ATG4B-210ENST00000428861 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.26□□□□□ -1.41
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