RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
HOXD13-201ENST00000392539 LYPD5Q6UWN5 251 aa17.83■□□□□ 0.44
HOXD13-201ENST00000392539 C9orf153Q5TBE3 101 aa17.82■□□□□ 0.44
HOXD13-201ENST00000392539 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
HOXD13-201ENST00000392539 LINC00575Q6W349 94 aa17.81■□□□□ 0.44
HOXD13-201ENST00000392539 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
HOXD13-201ENST00000392539 COX7CP15954 63 aa17.79■□□□□ 0.44
HOXD13-201ENST00000392539 TENM1Q9UKZ4 2725 aa17.78■□□□□ 0.44
HOXD13-201ENST00000392539 ATOX1O00244 68 aa17.78■□□□□ 0.44
HOXD13-201ENST00000392539 OTOGQ6ZRI0 2925 aa17.77■□□□□ 0.44
HOXD13-201ENST00000392539 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa17.77■□□□□ 0.44
HOXD13-201ENST00000392539 IGLV6-57P01721 117 aa17.76■□□□□ 0.43
HOXD13-201ENST00000392539 hADV29S1A0JD25 119 aa17.75■□□□□ 0.43
HOXD13-201ENST00000392539 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
HOXD13-201ENST00000392539 C2orf48Q96LS8 159 aa17.75■□□□□ 0.43
HOXD13-201ENST00000392539 C3orf56Q8N813 242 aa17.74■□□□□ 0.43
HOXD13-201ENST00000392539 C6orf48Q9UBA6 75 aa17.74■□□□□ 0.43
HOXD13-201ENST00000392539 H3BNG1 76 aa17.72■□□□□ 0.43
HOXD13-201ENST00000392539 HECTD1Q9ULT8 2610 aa17.72■□□□□ 0.43
HOXD13-201ENST00000392539 CRYGAP11844 174 aa17.71■□□□□ 0.43
HOXD13-201ENST00000392539 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
HOXD13-201ENST00000392539 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa17.68■□□□□ 0.42
HOXD13-201ENST00000392539 WFDC10BQ8IUB3 73 aa17.67■□□□□ 0.42
HOXD13-201ENST00000392539 ATRQ13535 2644 aa17.66■□□□□ 0.42
HOXD13-201ENST00000392539 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa17.66■□□□□ 0.42
HOXD13-201ENST00000392539 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa17.65■□□□□ 0.42
HOXD13-201ENST00000392539 H3BQ85 93 aa17.65■□□□□ 0.42
HOXD13-201ENST00000392539 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa17.64■□□□□ 0.42
HOXD13-201ENST00000392539 RBM3P98179 157 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.42
HOXD13-201ENST00000392539 XAGE1AQ9HD64 81 aa17.64■□□□□ 0.42
HOXD13-201ENST00000392539 RETNQ9HD89 108 aa17.64■□□□□ 0.41
HOXD13-201ENST00000392539 DIRC1Q969H9 104 aa17.63■□□□□ 0.41
HOXD13-201ENST00000392539 CAMK2N2Q96S95 79 aa17.63■□□□□ 0.41
HOXD13-201ENST00000392539 HIVEP1P15822 2718 aa17.62■□□□□ 0.41
HOXD13-201ENST00000392539 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa17.62■□□□□ 0.41
HOXD13-201ENST00000392539 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa17.62■□□□□ 0.41
HOXD13-201ENST00000392539 A0A087WVE0 104 aa17.61■□□□□ 0.41
HOXD13-201ENST00000392539 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa17.61■□□□□ 0.41
HOXD13-201ENST00000392539 HIGD2BQ4VC39 106 aa17.61■□□□□ 0.41
HOXD13-201ENST00000392539 Q6ZQT0 140 aa17.6■□□□□ 0.41
HOXD13-201ENST00000392539 OXLD1Q5BKU9 147 aa17.6■□□□□ 0.41
HOXD13-201ENST00000392539 Q6ZQY7 126 aa17.59■□□□□ 0.41
HOXD13-201ENST00000392539 Q6ZTC4 211 aa17.59■□□□□ 0.41
HOXD13-201ENST00000392539 UBL5Q9BZL1 73 aa17.59■□□□□ 0.41
HOXD13-201ENST00000392539 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa17.59■□□□□ 0.41
HOXD13-201ENST00000392539 KRTAP10-11P60412 298 aa17.58■□□□□ 0.4
HOXD13-201ENST00000392539 SERP2Q8N6R1 65 aa17.58■□□□□ 0.4
HOXD13-201ENST00000392539 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa17.57■□□□□ 0.4
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
HOXD13-201ENST00000392539 USP17L23D6RBM5 183 aa17.55■□□□□ 0.4
HOXD13-201ENST00000392539 VPREB1P12018 145 aa17.55■□□□□ 0.4
HOXD13-201ENST00000392539 COX7BP24311 80 aa17.55■□□□□ 0.4
HOXD13-201ENST00000392539 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa17.55■□□□□ 0.4
HOXD13-201ENST00000392539 C15orf56Q8N910 161 aa17.54■□□□□ 0.4
HOXD13-201ENST00000392539 ESRGQ1W209 222 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXD13-201ENST00000392539 Q6ZRU5 148 aa17.53■□□□□ 0.4
HOXD13-201ENST00000392539 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
HOXD13-201ENST00000392539 DSCR8Q96T75 97 aa17.52■□□□□ 0.4
HOXD13-201ENST00000392539 M0R378 163 aa17.52■□□□□ 0.39
HOXD13-201ENST00000392539 GHRHP01286 108 aa17.52■□□□□ 0.39
HOXD13-201ENST00000392539 PDE6GP18545 87 aa17.52■□□□□ 0.39
HOXD13-201ENST00000392539 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.39
HOXD13-201ENST00000392539 RPS28P62857 69 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
HOXD13-201ENST00000392539 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXD13-201ENST00000392539 J3KT08 172 aa17.5■□□□□ 0.39
HOXD13-201ENST00000392539 UPK3BQ9BT76 320 aa17.49■□□□□ 0.39
HOXD13-201ENST00000392539 C1orf43Q9BWL3 253 aa17.49■□□□□ 0.39
HOXD13-201ENST00000392539 F8WDY8 70 aa17.48■□□□□ 0.39
HOXD13-201ENST00000392539 LINC01556Q5JQF7 62 aa17.48■□□□□ 0.39
HOXD13-201ENST00000392539 TMEM258P61165 79 aa17.45■□□□□ 0.38
HOXD13-201ENST00000392539 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa17.44■□□□□ 0.38
HOXD13-201ENST00000392539 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa17.44■□□□□ 0.38
HOXD13-201ENST00000392539 M0R2N4 97 aa17.43■□□□□ 0.38
HOXD13-201ENST00000392539 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa17.42■□□□□ 0.38
HOXD13-201ENST00000392539 C11orf45Q8TAV5 145 aa17.4■□□□□ 0.38
HOXD13-201ENST00000392539 CYSTM1Q9H1C7 97 aa17.4■□□□□ 0.38
HOXD13-201ENST00000392539 Q6ZRP5 223 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXD13-201ENST00000392539 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXD13-201ENST00000392539 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXD13-201ENST00000392539 Q6ZVQ6 151 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXD13-201ENST00000392539 LINC00528Q8N1L1 170 aa17.39■□□□□ 0.37
HOXD13-201ENST00000392539 SYCNQ0VAF6 134 aa17.38■□□□□ 0.37
HOXD13-201ENST00000392539 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
HOXD13-201ENST00000392539 HAMPP81172 84 aa17.33■□□□□ 0.37
HOXD13-201ENST00000392539 DNAH10OSP0CZ25 163 aa17.33■□□□□ 0.36
HOXD13-201ENST00000392539 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa17.33■□□□□ 0.36
HOXD13-201ENST00000392539 DPH3Q96FX2 82 aa17.32■□□□□ 0.36
HOXD13-201ENST00000392539 BCE1O60756 84 aa17.31■□□□□ 0.36
HOXD13-201ENST00000392539 CXCL6P80162 114 aa17.31■□□□□ 0.36
HOXD13-201ENST00000392539 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
HOXD13-201ENST00000392539 NKAPP1Q8N9T2 125 aa17.28■□□□□ 0.36
HOXD13-201ENST00000392539 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa17.27■□□□□ 0.35
HOXD13-201ENST00000392539 KCNQ1DNQ9H478 68 aa17.27■□□□□ 0.35
HOXD13-201ENST00000392539 TLX1NBP0CAT3 122 aa17.24■□□□□ 0.35
HOXD13-201ENST00000392539 CMYA5Q8N3K9 4069 aa17.24■□□□□ 0.35
HOXD13-201ENST00000392539 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa17.23■□□□□ 0.35
HOXD13-201ENST00000392539 C7orf33Q8WU49 177 aa17.23■□□□□ 0.35
HOXD13-201ENST00000392539 TENM3Q9P273 2699 aa17.22■□□□□ 0.35
HOXD13-201ENST00000392539 TRAV10A0A0B4J240 114 aa17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms