RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 LINC00308Q8TCZ7 52 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGEF1-202ENST00000380828 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGEF1-202ENST00000380828 SRRM5B3KS81 715 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM215AQ9Y5M1 114 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGEF1-202ENST00000380828 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGEF1-202ENST00000380828 K7EIM0 57 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGEF1-202ENST00000380828 RTL8CO15255 209 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGEF1-202ENST00000380828 PDE6HQ13956 83 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGEF1-202ENST00000380828 LINC01006Q8NI28 216 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGEF1-202ENST00000380828 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGEF1-202ENST00000380828 CDK2AP2O75956 126 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGEF1-202ENST00000380828 ORMDL1Q9P0S3 153 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHV3-11P01762 117 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM104AQ969W3 186 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGEF1-202ENST00000380828 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHV1-2P23083 117 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 LINC00612Q8N6U2 182 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 LY6G6DO95868 133 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 LINC00315P59091 139 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 F8P00451 2351 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 F8W735 103 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 LY6EQ16553 131 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 LINC00242Q5T6M2 205 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 FLNCQ14315 2725 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 LYNX1G3V0Z9 82 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 LYNX1P0DP58 116 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 DEFB1P60022 68 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 IGLV1-44P01699 117 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 HIVEP2P31629 2446 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 FN1P02751 2386 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 LINC00158P58513 81 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 SMIM11BQ8TCY0 68 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 FBN2P35556 2912 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 ALMS1Q8TCU4 4167 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 GAFA1Q96PS6 74 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 CHTF8P0CG12 524 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 Q8NDZ9 215 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 LINC00208Q96KT6 92 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 DPM3Q9P2X0 92 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 SUMO4Q6EEV6 95 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 Q6ZQT0 140 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 C10orf25Q5T742 122 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 FASNP49327 2511 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHV3-53P01767 116 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 APCP25054 2843 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A087WW49 117 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 KLK9Q9UKQ9 250 aa4.46□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 DNAH1Q9P2D7 4330 aa4.46□□□□□ -1.69
RABGEF1-202ENST00000380828 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
RABGEF1-202ENST00000380828 A8MWP4 228 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGEF1-202ENST00000380828 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGEF1-202ENST00000380828 LCE6AA0A183 80 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGEF1-202ENST00000380828 NDUFAF8A1L188 74 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGEF1-202ENST00000380828 IGKV4-1P06312 121 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGEF1-202ENST00000380828 C8orf17Q9NRJ1 99 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGEF1-202ENST00000380828 ACANP16112 2415 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGEF1-202ENST00000380828 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGEF1-202ENST00000380828 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGEF1-202ENST00000380828 IGKV2D-28P01615 120 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGEF1-202ENST00000380828 ATP6V0E1O15342 81 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGEF1-202ENST00000380828 SPAG11AQ6PDA7 123 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGEF1-202ENST00000380828 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
RABGEF1-202ENST00000380828 DEFB113Q30KQ7 82 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGEF1-202ENST00000380828 LUZP6Q538Z0 58 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGEF1-202ENST00000380828 SMIM29Q86T20 159 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1-202ENST00000380828 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A096LNT2 108 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1-202ENST00000380828 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1-202ENST00000380828 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1-202ENST00000380828 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1-202ENST00000380828 KRTAP10-9P60411 292 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGEF1-202ENST00000380828 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
RABGEF1-202ENST00000380828 TRGV2A0A075B6R0 118 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGEF1-202ENST00000380828 NDUFA4O00483 81 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGEF1-202ENST00000380828 SPAG11BQ08648 103 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGEF1-202ENST00000380828 PLAC8Q9NZF1 115 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGEF1-202ENST00000380828 H0YGX0 51 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGEF1-202ENST00000380828 LINC00528Q8N1L1 170 aa4.43□□□□□ -1.7
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