RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 LINC00167Q96N53 147 aa12.74□□□□□ -0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 ORMDL1Q9P0S3 153 aa12.73□□□□□ -0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 NCR3O14931 201 aa12.72□□□□□ -0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A1B0GX51 115 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 LELP1Q5T871 98 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 Q6ZTC4 211 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 LINC00846Q9NV44 126 aa12.71□□□□□ -0.37
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM126AQ9H061 195 aa12.71□□□□□ -0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 C3orf22Q8N5N4 141 aa12.7□□□□□ -0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 Q8NDZ9 215 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 COL7A1Q02388 2944 aa12.69□□□□□ -0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A0J9YWU9 116 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 UQCRQO14949 82 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 SVIPQ8NHG7 77 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 DNAH3Q8TD57 4116 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 Q6JHZ5 121 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 Q8N814 137 aa12.68□□□□□ -0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 PRR34Q9NV39 138 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 C10orf25Q5T742 122 aa12.67□□□□□ -0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 C6orf223Q8N319 242 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 SPAG11BQ08648 103 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 LINC00526Q96FQ7 95 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 TENM2Q9NT68 2774 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 CCKP06307 115 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP1-201ENST00000357436 KLK12Q9UKR0 248 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 MUC7Q8TAX7 377 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 C2orf48Q96LS8 159 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 ENHOQ6UWT2 76 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 C9orf153Q5TBE3 101 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 ATOX1O00244 68 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 COX7CP15954 63 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 MDFIQ99750 246 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 LYSTQ99698 3801 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 SMIM20Q8N5G0 67 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 C6orf99Q4VX62 202 aa12.62□□□□□ -0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 LYPD5Q6UWN5 251 aa12.61□□□□□ -0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 S100A7L2Q5SY68 101 aa12.6□□□□□ -0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 WFDC10BQ8IUB3 73 aa12.59□□□□□ -0.39
SH3BP1-201ENST00000357436 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 LINC00575Q6W349 94 aa12.58□□□□□ -0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 IGLV6-57P01721 117 aa12.56□□□□□ -0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 CRYGAP11844 174 aa12.56□□□□□ -0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 K7EIL1 84 aa12.55□□□□□ -0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A087WVE0 104 aa12.55□□□□□ -0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 C6orf48Q9UBA6 75 aa12.54□□□□□ -0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 C11orf45Q8TAV5 145 aa12.54□□□□□ -0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa12.52□□□□□ -0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 H3BNG1 76 aa12.52□□□□□ -0.4
SH3BP1-201ENST00000357436 hADV29S1A0JD25 119 aa12.51□□□□□ -0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 ESRGQ1W209 222 aa12.51□□□□□ -0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 CSMD3Q7Z407 3707 aa12.51□□□□□ -0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 USP17L23D6RBM5 183 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 SERP2Q8N6R1 65 aa12.5□□□□□ -0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa12.49□□□□□ -0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 XAGE1AQ9HD64 81 aa12.48□□□□□ -0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 DNHD1Q96M86 4753 aa12.48□□□□□ -0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa12.47□□□□□ -0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 RBM3P98179 157 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa12.46□□□□□ -0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 Q6ZQT0 140 aa12.46□□□□□ -0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 UPK3BQ9BT76 320 aa12.45□□□□□ -0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa12.45□□□□□ -0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa12.44□□□□□ -0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 HIGD2BQ4VC39 106 aa12.44□□□□□ -0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 UBL5Q9BZL1 73 aa12.44□□□□□ -0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 CAMK2N2Q96S95 79 aa12.44□□□□□ -0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 CYSTM1Q9H1C7 97 aa12.44□□□□□ -0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 Q6ZQY7 126 aa12.42□□□□□ -0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 DIRC1Q969H9 104 aa12.42□□□□□ -0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa12.41□□□□□ -0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 C15orf56Q8N910 161 aa12.41□□□□□ -0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa12.41□□□□□ -0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 H3BQ85 93 aa12.41□□□□□ -0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 VPREB1P12018 145 aa12.41□□□□□ -0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 Q6ZRU5 148 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 DNAH9Q9NYC9 4486 aa12.4□□□□□ -0.42
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 M0R2N4 97 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 TM2D3Q9BRN9 247 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 PDE6GP18545 87 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 COX7BP24311 80 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 DSCR8Q96T75 97 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 M0R378 163 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 GHRHP01286 108 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.3 ms