RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308580.11

TMOD3-201, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD3, Length 8,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-201ENST00000308580 BPTFQ12830 3046 aa6.83□□□□□ -1.32
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TMOD3-201ENST00000308580 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.83□□□□□ -1.32
TMOD3-201ENST00000308580 MAST4O15021 2626 aa6.83□□□□□ -1.32
TMOD3-201ENST00000308580 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-201ENST00000308580 C22orf24Q9Y442 160 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-201ENST00000308580 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-201ENST00000308580 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
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TMOD3-201ENST00000308580 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.78□□□□□ -1.32
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TMOD3-201ENST00000308580 LINC00167Q96N53 147 aa6.78□□□□□ -1.32
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TMOD3-201ENST00000308580 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.77□□□□□ -1.33
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TMOD3-201ENST00000308580 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.74□□□□□ -1.33
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TMOD3-201ENST00000308580 PCOTHQ58A44 107 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD3-201ENST00000308580 CXCL6P80162 114 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD3-201ENST00000308580 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
TMOD3-201ENST00000308580 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD3-201ENST00000308580 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
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TMOD3-201ENST00000308580 PRR15LQ9BU68 103 aa6.72□□□□□ -1.33
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TMOD3-201ENST00000308580 H0Y9P7 68 aa6.7□□□□□ -1.34
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TMOD3-201ENST00000308580 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.67□□□□□ -1.34
TMOD3-201ENST00000308580 MGAQ8IWI9 3026 aa6.66□□□□□ -1.34
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TMOD3-201ENST00000308580 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.65□□□□□ -1.35
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TMOD3-201ENST00000308580 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
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TMOD3-201ENST00000308580 CRYGAP11844 174 aa6.64□□□□□ -1.35
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TMOD3-201ENST00000308580 KRTAP10-3P60369 221 aa6.63□□□□□ -1.35
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TMOD3-201ENST00000308580 KRTAP10-11P60412 298 aa6.61□□□□□ -1.35
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TMOD3-201ENST00000308580 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.59□□□□□ -1.35
TMOD3-201ENST00000308580 C1orf195Q5TG92 126 aa6.59□□□□□ -1.35
TMOD3-201ENST00000308580 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.59□□□□□ -1.36
TMOD3-201ENST00000308580 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa6.58□□□□□ -1.36
TMOD3-201ENST00000308580 K7EIL1 84 aa6.58□□□□□ -1.36
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