RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 SMIM20Q8N5G0 67 aa18.02■□□□□ 0.48
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A087WYN8 130 aa18.02■□□□□ 0.47
CAPNS1-201ENST00000246533 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa18.02■□□□□ 0.47
CAPNS1-201ENST00000246533 FHL2Q14192 279 aa18.02■□□□□ 0.47
CAPNS1-201ENST00000246533 C9orf153Q5TBE3 101 aa18.02■□□□□ 0.47
CAPNS1-201ENST00000246533 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.47
CAPNS1-201ENST00000246533 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa18.01■□□□□ 0.47
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1B0GX51 115 aa18.01■□□□□ 0.47
CAPNS1-201ENST00000246533 DAD1P61803 113 aa18.01■□□□□ 0.47
CAPNS1-201ENST00000246533 LYRM9A8MSI8 78 aa18■□□□□ 0.47
CAPNS1-201ENST00000246533 RYR3Q15413 4870 aa18■□□□□ 0.47
CAPNS1-201ENST00000246533 HYDINQ4G0P3 5121 aa18■□□□□ 0.47
CAPNS1-201ENST00000246533 HTN3P15516 51 aa18■□□□□ 0.47
CAPNS1-201ENST00000246533 Q6JHZ5 121 aa18■□□□□ 0.47
CAPNS1-201ENST00000246533 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa17.99■□□□□ 0.47
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CAPNS1-201ENST00000246533 PAX4O43316 350 aa17.98■□□□□ 0.47
CAPNS1-201ENST00000246533 COX7CP15954 63 aa17.98■□□□□ 0.47
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa17.97■□□□□ 0.47
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CAPNS1-201ENST00000246533 C6orf226Q5I0X4 101 aa17.96■□□□□ 0.47
CAPNS1-201ENST00000246533 Q8IZM0 81 aa17.96■□□□□ 0.47
CAPNS1-201ENST00000246533 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa17.95■□□□□ 0.46
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CAPNS1-201ENST00000246533 SS18Q15532 418 aa17.94■□□□□ 0.46
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CAPNS1-201ENST00000246533 VPS13DQ5THJ4 4388 aa17.87■□□□□ 0.45
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC00846Q9NV44 126 aa17.86■□□□□ 0.45
CAPNS1-201ENST00000246533 CCKP06307 115 aa17.85■□□□□ 0.45
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CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa17.82■□□□□ 0.44
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CAPNS1-201ENST00000246533 GYPEP15421 78 aa17.8■□□□□ 0.44
CAPNS1-201ENST00000246533 XCL1P47992 114 aa17.8■□□□□ 0.44
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CAPNS1-201ENST00000246533 LCE6AA0A183 80 aa17.78■□□□□ 0.44
CAPNS1-201ENST00000246533 SERP2Q8N6R1 65 aa17.78■□□□□ 0.44
CAPNS1-201ENST00000246533 PRO0255Q9UI72 69 aa17.78■□□□□ 0.44
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CAPNS1-201ENST00000246533 CFAP161Q6P656 301 aa17.75■□□□□ 0.43
CAPNS1-201ENST00000246533 SLPIP03973 132 aa17.74■□□□□ 0.43
CAPNS1-201ENST00000246533 J3KT08 172 aa17.72■□□□□ 0.43
CAPNS1-201ENST00000246533 KIAA0087Q14695 138 aa17.71■□□□□ 0.43
CAPNS1-201ENST00000246533 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa17.7■□□□□ 0.42
CAPNS1-201ENST00000246533 USP17L23D6RBM5 183 aa17.7■□□□□ 0.42
CAPNS1-201ENST00000246533 LYPD5Q6UWN5 251 aa17.7■□□□□ 0.42
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM258P61165 79 aa17.69■□□□□ 0.42
CAPNS1-201ENST00000246533 H3BQ85 93 aa17.68■□□□□ 0.42
CAPNS1-201ENST00000246533 hADV29S1A0JD25 119 aa17.66■□□□□ 0.42
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CAPNS1-201ENST00000246533 UPK3BQ9BT76 320 aa17.64■□□□□ 0.41
CAPNS1-201ENST00000246533 UBL5Q9BZL1 73 aa17.63■□□□□ 0.41
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CAPNS1-201ENST00000246533 H3BNG1 76 aa17.6■□□□□ 0.41
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CAPNS1-201ENST00000246533 CLPSL2Q6UWE3 100 aa17.6■□□□□ 0.41
CAPNS1-201ENST00000246533 BCE1O60756 84 aa17.59■□□□□ 0.41
CAPNS1-201ENST00000246533 ESRGQ1W209 222 aa17.59■□□□□ 0.41
CAPNS1-201ENST00000246533 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa17.59■□□□□ 0.41
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CAPNS1-201ENST00000246533 DNAH2Q9P225 4427 aa17.58■□□□□ 0.41
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa17.58■□□□□ 0.4
CAPNS1-201ENST00000246533 C6orf99Q4VX62 202 aa17.58■□□□□ 0.4
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC00588Q9Y4M8 146 aa17.58■□□□□ 0.4
CAPNS1-201ENST00000246533 FRAS1Q86XX4 4008 aa17.56■□□□□ 0.4
CAPNS1-201ENST00000246533 ANGP03950 147 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
CAPNS1-201ENST00000246533 PDE6GP18545 87 aa17.56■□□□□ 0.4
CAPNS1-201ENST00000246533 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa17.56■□□□□ 0.4
CAPNS1-201ENST00000246533 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa17.55■□□□□ 0.4
CAPNS1-201ENST00000246533 RBM3P98179 157 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
CAPNS1-201ENST00000246533 C6orf223Q8N319 242 aa17.53■□□□□ 0.4
CAPNS1-201ENST00000246533 GHRHP01286 108 aa17.51■□□□□ 0.39
CAPNS1-201ENST00000246533 Q6ZQT0 140 aa17.51■□□□□ 0.39
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