RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617928.4

CYFIP1-208, Transcript of cytoplasmic FMR1 interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CYFIP1, Length 6,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1-208ENST00000617928 PCOTHQ58A44 107 aa6.22□□□□□ -1.41
CYFIP1-208ENST00000617928 PCDH15Q96QU1 1955 aa6.22□□□□□ -1.41
CYFIP1-208ENST00000617928 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.22□□□□□ -1.41
CYFIP1-208ENST00000617928 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa6.22□□□□□ -1.41
CYFIP1-208ENST00000617928 SPG11Q96JI7 2443 aa6.22□□□□□ -1.41
CYFIP1-208ENST00000617928 MUC7Q8TAX7 377 aa6.21□□□□□ -1.41
CYFIP1-208ENST00000617928 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.21□□□□□ -1.42
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
CYFIP1-208ENST00000617928 SBSPONQ8IVN8 264 aa6.21□□□□□ -1.42
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.21□□□□□ -1.42
CYFIP1-208ENST00000617928 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.21□□□□□ -1.42
CYFIP1-208ENST00000617928 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.21□□□□□ -1.42
CYFIP1-208ENST00000617928 A0A087WVE0 104 aa6.2□□□□□ -1.42
CYFIP1-208ENST00000617928 LIMD2Q9BT23 127 aa6.2□□□□□ -1.42
CYFIP1-208ENST00000617928 MDFIQ99750 246 aa6.2□□□□□ -1.42
CYFIP1-208ENST00000617928 EXPH5Q8NEV8 1989 aa6.2□□□□□ -1.42
CYFIP1-208ENST00000617928 Q8N814 137 aa6.2□□□□□ -1.42
CYFIP1-208ENST00000617928 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
CYFIP1-208ENST00000617928 Q6JHZ5 121 aa6.19□□□□□ -1.42
CYFIP1-208ENST00000617928 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa6.19□□□□□ -1.42
CYFIP1-208ENST00000617928 F8WDY8 70 aa6.19□□□□□ -1.42
CYFIP1-208ENST00000617928 PRLHP81277 87 aa6.19□□□□□ -1.42
CYFIP1-208ENST00000617928 FHL3Q13643 280 aa6.19□□□□□ -1.42
CYFIP1-208ENST00000617928 A0A087WSZ3 146 aa6.18□□□□□ -1.42
CYFIP1-208ENST00000617928 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.17□□□□□ -1.42
CYFIP1-208ENST00000617928 A0A087WYN8 130 aa6.17□□□□□ -1.42
CYFIP1-208ENST00000617928 FAM229AH3BQW9 127 aa6.17□□□□□ -1.42
CYFIP1-208ENST00000617928 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.17□□□□□ -1.42
CYFIP1-208ENST00000617928 BEAN1Q3B7T3 259 aa6.17□□□□□ -1.42
CYFIP1-208ENST00000617928 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.16□□□□□ -1.42
CYFIP1-208ENST00000617928 IGKV2-30P06310 120 aa6.16□□□□□ -1.42
CYFIP1-208ENST00000617928 PCNX3Q9H6A9 2034 aa6.16□□□□□ -1.42
CYFIP1-208ENST00000617928 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC00575Q6W349 94 aa6.16□□□□□ -1.42
CYFIP1-208ENST00000617928 IGIPA6NJ69 53 aa6.16□□□□□ -1.42
CYFIP1-208ENST00000617928 Q6ZRU5 148 aa6.16□□□□□ -1.42
CYFIP1-208ENST00000617928 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
CYFIP1-208ENST00000617928 HCG22E2RYF7 251 aa6.15□□□□□ -1.43
CYFIP1-208ENST00000617928 A0A1W2PPR1 153 aa6.15□□□□□ -1.43
CYFIP1-208ENST00000617928 H0Y9P7 68 aa6.15□□□□□ -1.43
CYFIP1-208ENST00000617928 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
CYFIP1-208ENST00000617928 Q6ZSN1 163 aa6.14□□□□□ -1.43
CYFIP1-208ENST00000617928 CDIP1Q9H305 208 aa6.14□□□□□ -1.43
CYFIP1-208ENST00000617928 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.14□□□□□ -1.43
CYFIP1-208ENST00000617928 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.14□□□□□ -1.43
CYFIP1-208ENST00000617928 C22orf24Q9Y442 160 aa6.14□□□□□ -1.43
CYFIP1-208ENST00000617928 PLXNB1O43157 2135 aa6.13□□□□□ -1.43
CYFIP1-208ENST00000617928 A8MTW9 85 aa6.13□□□□□ -1.43
CYFIP1-208ENST00000617928 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
CYFIP1-208ENST00000617928 J3QL48 77 aa6.13□□□□□ -1.43
CYFIP1-208ENST00000617928 HCFC1P51610 2035 aa6.13□□□□□ -1.43
CYFIP1-208ENST00000617928 CXCL6P80162 114 aa6.13□□□□□ -1.43
CYFIP1-208ENST00000617928 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.12□□□□□ -1.43
CYFIP1-208ENST00000617928 C16orf90A8MZG2 172 aa6.12□□□□□ -1.43
CYFIP1-208ENST00000617928 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa6.11□□□□□ -1.43
CYFIP1-208ENST00000617928 CD164Q04900 197 aa6.11□□□□□ -1.43
CYFIP1-208ENST00000617928 MOBPQ13875 183 aa6.11□□□□□ -1.43
CYFIP1-208ENST00000617928 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
CYFIP1-208ENST00000617928 Q8N2B8 174 aa6.1□□□□□ -1.43
CYFIP1-208ENST00000617928 ZNF580Q9UK33 172 aa6.1□□□□□ -1.43
CYFIP1-208ENST00000617928 IGF2RP11717 2491 aa6.1□□□□□ -1.43
CYFIP1-208ENST00000617928 A0A1B0GUV1 79 aa6.1□□□□□ -1.43
CYFIP1-208ENST00000617928 CRYGAP11844 174 aa6.1□□□□□ -1.43
CYFIP1-208ENST00000617928 hDV103S1A0JD37 113 aa6.1□□□□□ -1.43
CYFIP1-208ENST00000617928 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.1□□□□□ -1.43
CYFIP1-208ENST00000617928 CNFNQ9BYD5 112 aa6.1□□□□□ -1.43
CYFIP1-208ENST00000617928 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.09□□□□□ -1.43
CYFIP1-208ENST00000617928 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.09□□□□□ -1.43
CYFIP1-208ENST00000617928 Q8N3U1 123 aa6.08□□□□□ -1.44
CYFIP1-208ENST00000617928 NAV3Q8IVL0 2385 aa6.08□□□□□ -1.44
CYFIP1-208ENST00000617928 CHTF8P0CG12 524 aa6.08□□□□□ -1.44
CYFIP1-208ENST00000617928 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
CYFIP1-208ENST00000617928 ABCA2Q9BZC7 2435 aa6.07□□□□□ -1.44
CYFIP1-208ENST00000617928 PTPRSQ13332 1948 aa6.07□□□□□ -1.44
CYFIP1-208ENST00000617928 RTL8CO15255 209 aa6.07□□□□□ -1.44
CYFIP1-208ENST00000617928 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.07□□□□□ -1.44
CYFIP1-208ENST00000617928 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.07□□□□□ -1.44
CYFIP1-208ENST00000617928 AMELXQ99217 191 aa6.07□□□□□ -1.44
CYFIP1-208ENST00000617928 MUC4Q99102 2169 aa6.06□□□□□ -1.44
CYFIP1-208ENST00000617928 CEP295Q9C0D2 2601 aa6.06□□□□□ -1.44
CYFIP1-208ENST00000617928 Q9UF83 564 aa6.06□□□□□ -1.44
CYFIP1-208ENST00000617928 KIAA0087Q14695 138 aa6.06□□□□□ -1.44
CYFIP1-208ENST00000617928 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa6.06□□□□□ -1.44
CYFIP1-208ENST00000617928 CCDC168Q8NDH2 2452 aa6.05□□□□□ -1.44
CYFIP1-208ENST00000617928 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CYFIP1-208ENST00000617928 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.05□□□□□ -1.44
CYFIP1-208ENST00000617928 AGRNO00468 2067 aa6.05□□□□□ -1.44
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC00315P59091 139 aa6.05□□□□□ -1.44
CYFIP1-208ENST00000617928 NAV2Q8IVL1 2488 aa6.05□□□□□ -1.44
CYFIP1-208ENST00000617928 LRP4O75096 1905 aa6.04□□□□□ -1.44
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC00167Q96N53 147 aa6.04□□□□□ -1.44
CYFIP1-208ENST00000617928 EML5Q05BV3 1969 aa6.04□□□□□ -1.44
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC00310P59036 64 aa6.04□□□□□ -1.44
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.04□□□□□ -1.44
CYFIP1-208ENST00000617928 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.04□□□□□ -1.44
CYFIP1-208ENST00000617928 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa6.03□□□□□ -1.44
CYFIP1-208ENST00000617928 C8orf87E5RJ46 101 aa6.03□□□□□ -1.44
CYFIP1-208ENST00000617928 ADAMTS20P59510 1910 aa6.03□□□□□ -1.44
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.03□□□□□ -1.44
CYFIP1-208ENST00000617928 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms