RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 SMR3AQ99954 134 aa2.8□□□□□ -1.96
CAPNS1-210ENST00000590211 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
CAPNS1-210ENST00000590211 CSMD2Q7Z408 3487 aa2.8□□□□□ -1.96
CAPNS1-210ENST00000590211 SORL1Q92673 2214 aa2.79□□□□□ -1.96
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1W2PPM0 123 aa2.79□□□□□ -1.96
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM223A0PJW6 202 aa2.79□□□□□ -1.96
CAPNS1-210ENST00000590211 J3QQQ9 107 aa2.79□□□□□ -1.96
CAPNS1-210ENST00000590211 K7EP34 96 aa2.79□□□□□ -1.96
CAPNS1-210ENST00000590211 LEPROTO15243 131 aa2.79□□□□□ -1.96
CAPNS1-210ENST00000590211 CCL25O15444 150 aa2.79□□□□□ -1.96
CAPNS1-210ENST00000590211 PRM2P04554 102 aa2.79□□□□□ -1.96
CAPNS1-210ENST00000590211 FABP2P12104 132 aa2.79□□□□□ -1.96
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
CAPNS1-210ENST00000590211 INSL3P51460 131 aa2.79□□□□□ -1.96
CAPNS1-210ENST00000590211 Q6ZR54 194 aa2.79□□□□□ -1.96
CAPNS1-210ENST00000590211 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
CAPNS1-210ENST00000590211 OR5A1Q8NGJ0 315 aa2.79□□□□□ -1.96
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNRF2Q8NHG8 242 aa2.79□□□□□ -1.96
CAPNS1-210ENST00000590211 AMELXQ99217 191 aa2.79□□□□□ -1.96
CAPNS1-210ENST00000590211 CHCHD7Q9BUK0 85 aa2.79□□□□□ -1.96
CAPNS1-210ENST00000590211 TIMM21Q9BVV7 248 aa2.79□□□□□ -1.96
CAPNS1-210ENST00000590211 WFDC10AQ9H1F0 79 aa2.79□□□□□ -1.96
CAPNS1-210ENST00000590211 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
CAPNS1-210ENST00000590211 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa2.79□□□□□ -1.96
CAPNS1-210ENST00000590211 SPCS1Q9Y6A9 102 aa2.79□□□□□ -1.96
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
CAPNS1-210ENST00000590211 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa2.78□□□□□ -1.96
CAPNS1-210ENST00000590211 TRGV2A0A075B6R0 118 aa2.78□□□□□ -1.96
CAPNS1-210ENST00000590211 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A0J9YY99 117 aa2.78□□□□□ -1.96
CAPNS1-210ENST00000590211 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa2.78□□□□□ -1.96
CAPNS1-210ENST00000590211 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa2.78□□□□□ -1.96
CAPNS1-210ENST00000590211 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM238C9JI98 176 aa2.78□□□□□ -1.96
CAPNS1-210ENST00000590211 K7ERJ3 54 aa2.78□□□□□ -1.96
CAPNS1-210ENST00000590211 UBE2L6O14933 153 aa2.78□□□□□ -1.96
CAPNS1-210ENST00000590211 PSPHP1O15172 72 aa2.78□□□□□ -1.96
CAPNS1-210ENST00000590211 TSPEAR-AS2P59090 65 aa2.78□□□□□ -1.96
CAPNS1-210ENST00000590211 KRTAP10-3P60369 221 aa2.78□□□□□ -1.96
CAPNS1-210ENST00000590211 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
CAPNS1-210ENST00000590211 C12orf74Q32Q52 190 aa2.78□□□□□ -1.96
CAPNS1-210ENST00000590211 C6orf99Q4VX62 202 aa2.78□□□□□ -1.96
CAPNS1-210ENST00000590211 Q6ZTI0 123 aa2.78□□□□□ -1.96
CAPNS1-210ENST00000590211 Q6ZUT4 128 aa2.78□□□□□ -1.96
CAPNS1-210ENST00000590211 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
CAPNS1-210ENST00000590211 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 WNK1Q9H4A3 2382 aa2.77□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa2.77□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa2.77□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa2.77□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 SMIM9A6NGZ8 99 aa2.77□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 IGLL5B9A064 214 aa2.77□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 K7EP13 123 aa2.77□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 NDUFS5O43920 106 aa2.77□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa2.77□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 UBE2AP49459 152 aa2.77□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 UBE2D3P61077 147 aa2.77□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 UBE2D2P62837 147 aa2.77□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 HERVK_113P63121 156 aa2.77□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 LYRM7Q5U5X0 104 aa2.77□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC25A29Q8N8R3 303 aa2.77□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 GTSF1LQ9H1H1 148 aa2.77□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 DNHD1Q96M86 4753 aa2.77□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa2.76□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 APOMO95445 188 aa2.76□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 IGHV3-30P01768 117 aa2.76□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 TLX1NBP0CAT3 122 aa2.76□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa2.76□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 UBE2D1P51668 147 aa2.76□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 DSCR10P59022 87 aa2.76□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 LCE1FQ5T754 118 aa2.76□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa2.76□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 SBSPONQ8IVN8 264 aa2.76□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 ZANQ9Y493 2812 aa2.76□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 SONP18583 2426 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa2.75□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa2.75□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1B0GVX0 72 aa2.75□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 K7ERU9 68 aa2.75□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 SPINK8P0C7L1 97 aa2.75□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 LINC00694P0DN24 101 aa2.75□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 ZFAND6Q6FIF0 208 aa2.75□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa2.75□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 C10orf126Q8N4M7 172 aa2.75□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 LINC00612Q8N6U2 182 aa2.75□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 C15orf56Q8N910 161 aa2.75□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 SPANXDQ9BXN6 97 aa2.75□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 SPANXCQ9NY87 97 aa2.75□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 NDUFA12Q9UI09 145 aa2.75□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 CBY1Q9Y3M2 126 aa2.75□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 MGAM2Q2M2H8 2515 aa2.75□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 HIVEP2P31629 2446 aa2.74□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa2.74□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A0B4J2C4 111 aa2.74□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa2.74□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 F8W1H4 67 aa2.74□□□□□ -1.97
CAPNS1-210ENST00000590211 NDUFA1O15239 70 aa2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.3 ms