RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561293.5

MEIS3-212, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene MEIS3, Length 1,918 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-212ENST00000561293 SPINK8P0C7L1 97 aa13.77□□□□□ -0.21
MEIS3-212ENST00000561293 HAMPP81172 84 aa13.77□□□□□ -0.21
MEIS3-212ENST00000561293 UBE2V1Q13404 147 aa13.77□□□□□ -0.21
MEIS3-212ENST00000561293 C2orf91Q6ZV80 131 aa13.77□□□□□ -0.21
MEIS3-212ENST00000561293 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
MEIS3-212ENST00000561293 KRTAP10-1P60331 282 aa13.76□□□□□ -0.21
MEIS3-212ENST00000561293 HERVK_113P63121 156 aa13.76□□□□□ -0.21
MEIS3-212ENST00000561293 ANKRD39Q53RE8 183 aa13.76□□□□□ -0.21
MEIS3-212ENST00000561293 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa13.76□□□□□ -0.21
MEIS3-212ENST00000561293 KIAA1109Q2LD37 5005 aa13.76□□□□□ -0.21
MEIS3-212ENST00000561293 SPAG11BQ08648 103 aa13.76□□□□□ -0.21
MEIS3-212ENST00000561293 CFAP161Q6P656 301 aa13.76□□□□□ -0.21
MEIS3-212ENST00000561293 TOMM7Q9P0U1 55 aa13.76□□□□□ -0.21
MEIS3-212ENST00000561293 ODF1Q14990 250 aa13.75□□□□□ -0.21
MEIS3-212ENST00000561293 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa13.74□□□□□ -0.21
MEIS3-212ENST00000561293 PTTG1IPP53801 180 aa13.74□□□□□ -0.21
MEIS3-212ENST00000561293 C14orf177Q52M58 125 aa13.74□□□□□ -0.21
MEIS3-212ENST00000561293 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa13.74□□□□□ -0.21
MEIS3-212ENST00000561293 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
MEIS3-212ENST00000561293 TAX1BP3O14907 124 aa13.73□□□□□ -0.21
MEIS3-212ENST00000561293 C2orf82Q6UX34 121 aa13.73□□□□□ -0.21
MEIS3-212ENST00000561293 TP73-AS1Q9UF72 201 aa13.73□□□□□ -0.21
MEIS3-212ENST00000561293 HSD52Q0P140 79 aa13.72□□□□□ -0.21
MEIS3-212ENST00000561293 TMEM170BQ5T4T1 132 aa13.72□□□□□ -0.21
MEIS3-212ENST00000561293 SMIM1B2RUZ4 78 aa13.72□□□□□ -0.21
MEIS3-212ENST00000561293 IGKCP01834 107 aa13.72□□□□□ -0.21
MEIS3-212ENST00000561293 C10orf25Q5T742 122 aa13.72□□□□□ -0.21
MEIS3-212ENST00000561293 APOBP04114 4563 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
MEIS3-212ENST00000561293 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa13.71□□□□□ -0.21
MEIS3-212ENST00000561293 GCSHP23434 173 aa13.71□□□□□ -0.21
MEIS3-212ENST00000561293 Q6ZRU5 148 aa13.71□□□□□ -0.21
MEIS3-212ENST00000561293 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa13.7□□□□□ -0.22
MEIS3-212ENST00000561293 F8VRH5 84 aa13.7□□□□□ -0.22
MEIS3-212ENST00000561293 DPM2O94777 84 aa13.7□□□□□ -0.22
MEIS3-212ENST00000561293 APOMO95445 188 aa13.7□□□□□ -0.22
MEIS3-212ENST00000561293 A6NDN8 102 aa13.7□□□□□ -0.22
MEIS3-212ENST00000561293 KIAA0087Q14695 138 aa13.7□□□□□ -0.22
MEIS3-212ENST00000561293 FAM30AQ9NZY2 134 aa13.7□□□□□ -0.22
MEIS3-212ENST00000561293 CAMK2N2Q96S95 79 aa13.69□□□□□ -0.22
MEIS3-212ENST00000561293 HIGD1BQ9P298 99 aa13.69□□□□□ -0.22
MEIS3-212ENST00000561293 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa13.68□□□□□ -0.22
MEIS3-212ENST00000561293 CNBPP62633 177 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
MEIS3-212ENST00000561293 VAMP3Q15836 100 aa13.68□□□□□ -0.22
MEIS3-212ENST00000561293 PLNP26678 52 aa13.67□□□□□ -0.22
MEIS3-212ENST00000561293 NMUP48645 174 aa13.66□□□□□ -0.22
MEIS3-212ENST00000561293 SYCNQ0VAF6 134 aa13.66□□□□□ -0.22
MEIS3-212ENST00000561293 PANO1I0J062 215 aa13.66□□□□□ -0.22
MEIS3-212ENST00000561293 CARD19Q96LW7 228 aa13.66□□□□□ -0.22
MEIS3-212ENST00000561293 CHTF8P0CG12 524 aa13.65□□□□□ -0.22
MEIS3-212ENST00000561293 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
MEIS3-212ENST00000561293 C9orf163Q8N9P6 203 aa13.65□□□□□ -0.22
MEIS3-212ENST00000561293 H3BRM9 83 aa13.64□□□□□ -0.23
MEIS3-212ENST00000561293 Q6ZVH6 145 aa13.64□□□□□ -0.23
MEIS3-212ENST00000561293 DNAH8Q96JB1 4490 aa13.64□□□□□ -0.23
MEIS3-212ENST00000561293 PRSS2P07478 247 aa13.64□□□□□ -0.23
MEIS3-212ENST00000561293 C6orf226Q5I0X4 101 aa13.64□□□□□ -0.23
MEIS3-212ENST00000561293 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
MEIS3-212ENST00000561293 RYR1P21817 5038 aa13.62□□□□□ -0.23
MEIS3-212ENST00000561293 PCP2Q8IVA1 136 aa13.62□□□□□ -0.23
MEIS3-212ENST00000561293 COX7B2Q8TF08 81 aa13.62□□□□□ -0.23
MEIS3-212ENST00000561293 C6orf48Q9UBA6 75 aa13.62□□□□□ -0.23
MEIS3-212ENST00000561293 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa13.61□□□□□ -0.23
MEIS3-212ENST00000561293 SDIM1Q6ZPB5 146 aa13.61□□□□□ -0.23
MEIS3-212ENST00000561293 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
MEIS3-212ENST00000561293 HSPG2P98160 4391 aa13.61□□□□□ -0.23
MEIS3-212ENST00000561293 TMEM223A0PJW6 202 aa13.6□□□□□ -0.23
MEIS3-212ENST00000561293 CKS1BP61024 79 aa13.6□□□□□ -0.23
MEIS3-212ENST00000561293 Q8IZM0 81 aa13.6□□□□□ -0.23
MEIS3-212ENST00000561293 LINC01561Q8N1V8 128 aa13.6□□□□□ -0.23
MEIS3-212ENST00000561293 C9orf118A6NHY6 69 aa13.59□□□□□ -0.23
MEIS3-212ENST00000561293 NDUFA1O15239 70 aa13.59□□□□□ -0.23
MEIS3-212ENST00000561293 C2orf48Q96LS8 159 aa13.59□□□□□ -0.23
MEIS3-212ENST00000561293 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa13.58□□□□□ -0.23
MEIS3-212ENST00000561293 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa13.58□□□□□ -0.24
MEIS3-212ENST00000561293 TAL2Q16559 108 aa13.58□□□□□ -0.24
MEIS3-212ENST00000561293 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
MEIS3-212ENST00000561293 A0A096LNI7 61 aa13.57□□□□□ -0.24
MEIS3-212ENST00000561293 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa13.56□□□□□ -0.24
MEIS3-212ENST00000561293 TSPEAR-AS2P59090 65 aa13.56□□□□□ -0.24
MEIS3-212ENST00000561293 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
MEIS3-212ENST00000561293 XGP55808 180 aa13.55□□□□□ -0.24
MEIS3-212ENST00000561293 GAGE2BQ13066 116 aa13.55□□□□□ -0.24
MEIS3-212ENST00000561293 CBY1Q9Y3M2 126 aa13.55□□□□□ -0.24
MEIS3-212ENST00000561293 FAT1Q14517 4588 aa13.54□□□□□ -0.24
MEIS3-212ENST00000561293 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa13.53□□□□□ -0.24
MEIS3-212ENST00000561293 GAGE2EQ4V326 116 aa13.52□□□□□ -0.24
MEIS3-212ENST00000561293 Q6ZRP5 223 aa13.52□□□□□ -0.24
MEIS3-212ENST00000561293 GAGE2DQ9UEU5 116 aa13.52□□□□□ -0.24
MEIS3-212ENST00000561293 GAGE10A6NGK3 116 aa13.52□□□□□ -0.25
MEIS3-212ENST00000561293 SMIM13P0DJ93 91 aa13.52□□□□□ -0.25
MEIS3-212ENST00000561293 DPH3Q96FX2 82 aa13.52□□□□□ -0.25
MEIS3-212ENST00000561293 Q6ZSA8 131 aa13.51□□□□□ -0.25
MEIS3-212ENST00000561293 SCXQ7RTU7 201 aa13.51□□□□□ -0.25
MEIS3-212ENST00000561293 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
MEIS3-212ENST00000561293 CEND1Q8N111 149 aa13.51□□□□□ -0.25
MEIS3-212ENST00000561293 A0A0U1RRA0 63 aa13.49□□□□□ -0.25
MEIS3-212ENST00000561293 E9PLD3 99 aa13.49□□□□□ -0.25
MEIS3-212ENST00000561293 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa13.49□□□□□ -0.25
MEIS3-212ENST00000561293 TTTY13Q9BZ97 58 aa13.49□□□□□ -0.25
MEIS3-212ENST00000561293 PFN2P35080 140 aa13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms