RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552197.5

SLC38A1-210, Transcript of solute carrier family 38 member 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC38A1, Length 2,599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A1-210ENST00000552197 Q8IZM0 81 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC38A1-210ENST00000552197 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SLC38A1-210ENST00000552197 APOMO95445 188 aa7.38□□□□□ -1.23
SLC38A1-210ENST00000552197 SMIM13P0DJ93 91 aa7.38□□□□□ -1.23
SLC38A1-210ENST00000552197 CKS1BP61024 79 aa7.38□□□□□ -1.23
SLC38A1-210ENST00000552197 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SLC38A1-210ENST00000552197 CFAP161Q6P656 301 aa7.38□□□□□ -1.23
SLC38A1-210ENST00000552197 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.38□□□□□ -1.23
SLC38A1-210ENST00000552197 HERV-K104P63124 156 aa7.38□□□□□ -1.23
SLC38A1-210ENST00000552197 KIAA0087Q14695 138 aa7.38□□□□□ -1.23
SLC38A1-210ENST00000552197 C6orf223Q8N319 242 aa7.38□□□□□ -1.23
SLC38A1-210ENST00000552197 DNAH10Q8IVF4 4471 aa7.38□□□□□ -1.23
SLC38A1-210ENST00000552197 A6NDN8 102 aa7.37□□□□□ -1.23
SLC38A1-210ENST00000552197 K7ERJ3 54 aa7.37□□□□□ -1.23
SLC38A1-210ENST00000552197 RAB37Q96AX2 223 aa7.37□□□□□ -1.23
SLC38A1-210ENST00000552197 PFN2P35080 140 aa7.37□□□□□ -1.23
SLC38A1-210ENST00000552197 SPAG11BQ08648 103 aa7.37□□□□□ -1.23
SLC38A1-210ENST00000552197 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.37□□□□□ -1.23
SLC38A1-210ENST00000552197 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa7.36□□□□□ -1.23
SLC38A1-210ENST00000552197 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SLC38A1-210ENST00000552197 TIMM17BO60830 172 aa7.35□□□□□ -1.23
SLC38A1-210ENST00000552197 LINC00158P58513 81 aa7.35□□□□□ -1.23
SLC38A1-210ENST00000552197 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.35□□□□□ -1.23
SLC38A1-210ENST00000552197 SPANXCQ9NY87 97 aa7.35□□□□□ -1.23
SLC38A1-210ENST00000552197 VPS13DQ5THJ4 4388 aa7.35□□□□□ -1.23
SLC38A1-210ENST00000552197 TAX1BP3O14907 124 aa7.35□□□□□ -1.23
SLC38A1-210ENST00000552197 MUC7Q8TAX7 377 aa7.35□□□□□ -1.23
SLC38A1-210ENST00000552197 A4D1N5 150 aa7.34□□□□□ -1.23
SLC38A1-210ENST00000552197 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SLC38A1-210ENST00000552197 CASC10Q5T4H9 136 aa7.34□□□□□ -1.23
SLC38A1-210ENST00000552197 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.34□□□□□ -1.23
SLC38A1-210ENST00000552197 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.34□□□□□ -1.23
SLC38A1-210ENST00000552197 A6NJY4 79 aa7.34□□□□□ -1.23
SLC38A1-210ENST00000552197 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.34□□□□□ -1.23
SLC38A1-210ENST00000552197 C10orf25Q5T742 122 aa7.34□□□□□ -1.23
SLC38A1-210ENST00000552197 C15orf56Q8N910 161 aa7.34□□□□□ -1.23
SLC38A1-210ENST00000552197 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SLC38A1-210ENST00000552197 ERG28Q9UKR5 140 aa7.34□□□□□ -1.23
SLC38A1-210ENST00000552197 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SLC38A1-210ENST00000552197 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.33□□□□□ -1.24
SLC38A1-210ENST00000552197 SFTA2Q6UW10 78 aa7.33□□□□□ -1.24
SLC38A1-210ENST00000552197 CXCL5P42830 114 aa7.32□□□□□ -1.24
SLC38A1-210ENST00000552197 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.32□□□□□ -1.24
SLC38A1-210ENST00000552197 COX11Q9Y6N1 276 aa7.32□□□□□ -1.24
SLC38A1-210ENST00000552197 LECT2O14960 151 aa7.32□□□□□ -1.24
SLC38A1-210ENST00000552197 CFC1BP0CG36 223 aa7.32□□□□□ -1.24
SLC38A1-210ENST00000552197 CFC1P0CG37 223 aa7.32□□□□□ -1.24
SLC38A1-210ENST00000552197 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.32□□□□□ -1.24
SLC38A1-210ENST00000552197 RMI2Q96E14 147 aa7.32□□□□□ -1.24
SLC38A1-210ENST00000552197 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SLC38A1-210ENST00000552197 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa7.31□□□□□ -1.24
SLC38A1-210ENST00000552197 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.31□□□□□ -1.24
SLC38A1-210ENST00000552197 M0R2N4 97 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A1-210ENST00000552197 IFITM1P13164 125 aa7.3□□□□□ -1.24
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SLC38A1-210ENST00000552197 H3BUT2 72 aa7.3□□□□□ -1.24
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SLC38A1-210ENST00000552197 C9orf118A6NHY6 69 aa7.28□□□□□ -1.24
SLC38A1-210ENST00000552197 H7C2G1 150 aa7.28□□□□□ -1.24
SLC38A1-210ENST00000552197 PSCAO43653 123 aa7.28□□□□□ -1.24
SLC38A1-210ENST00000552197 Q6ZRU5 148 aa7.28□□□□□ -1.24
SLC38A1-210ENST00000552197 SVIPQ8NHG7 77 aa7.28□□□□□ -1.24
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SLC38A1-210ENST00000552197 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
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SLC38A1-210ENST00000552197 COX17Q14061 63 aa7.27□□□□□ -1.25
SLC38A1-210ENST00000552197 TTC32Q5I0X7 151 aa7.27□□□□□ -1.25
SLC38A1-210ENST00000552197 COPS9Q8WXC6 57 aa7.27□□□□□ -1.25
SLC38A1-210ENST00000552197 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.27□□□□□ -1.25
SLC38A1-210ENST00000552197 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.26□□□□□ -1.25
SLC38A1-210ENST00000552197 LY6G6CO95867 125 aa7.26□□□□□ -1.25
SLC38A1-210ENST00000552197 WFDC2Q14508 124 aa7.26□□□□□ -1.25
SLC38A1-210ENST00000552197 VAMP3Q15836 100 aa7.26□□□□□ -1.25
SLC38A1-210ENST00000552197 C2orf48Q96LS8 159 aa7.26□□□□□ -1.25
SLC38A1-210ENST00000552197 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.26□□□□□ -1.25
SLC38A1-210ENST00000552197 A0A0B4J2C4 111 aa7.25□□□□□ -1.25
SLC38A1-210ENST00000552197 TSPAN13O95857 204 aa7.25□□□□□ -1.25
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SLC38A1-210ENST00000552197 SYCNQ0VAF6 134 aa7.25□□□□□ -1.25
SLC38A1-210ENST00000552197 DNAH2Q9P225 4427 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC38A1-210ENST00000552197 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC38A1-210ENST00000552197 Q1RN00 199 aa7.24□□□□□ -1.25
SLC38A1-210ENST00000552197 A0A1W2PPM0 123 aa7.23□□□□□ -1.25
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SLC38A1-210ENST00000552197 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SLC38A1-210ENST00000552197 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.22□□□□□ -1.25
SLC38A1-210ENST00000552197 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SLC38A1-210ENST00000552197 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.22□□□□□ -1.25
SLC38A1-210ENST00000552197 CARD19Q96LW7 228 aa7.22□□□□□ -1.25
SLC38A1-210ENST00000552197 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.22□□□□□ -1.25
SLC38A1-210ENST00000552197 IGKV2D-28P01615 120 aa7.22□□□□□ -1.25
SLC38A1-210ENST00000552197 FABP2P12104 132 aa7.22□□□□□ -1.25
SLC38A1-210ENST00000552197 UBE2V1Q13404 147 aa7.22□□□□□ -1.25
SLC38A1-210ENST00000552197 GAGE2EQ4V326 116 aa7.22□□□□□ -1.25
SLC38A1-210ENST00000552197 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.22□□□□□ -1.25
SLC38A1-210ENST00000552197 PSMB2P49721 201 aa7.21□□□□□ -1.26
SLC38A1-210ENST00000552197 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
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