RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470980.1

GREB1-208, Transcript of growth regulating estrogen receptor binding 1, humanhuman

TSL 3

Gene GREB1, Length 833 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1-208ENST00000470980 A0A087WZ39 114 aa6.3□□□□□ -1.4
GREB1-208ENST00000470980 COX7A2LO14548 114 aa6.3□□□□□ -1.4
GREB1-208ENST00000470980 CKS1BP61024 79 aa6.3□□□□□ -1.4
GREB1-208ENST00000470980 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.3□□□□□ -1.4
GREB1-208ENST00000470980 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.3□□□□□ -1.4
GREB1-208ENST00000470980 ENHOQ6UWT2 76 aa6.3□□□□□ -1.4
GREB1-208ENST00000470980 HIST1H4GQ99525 98 aa6.3□□□□□ -1.4
GREB1-208ENST00000470980 PRR34Q9NV39 138 aa6.3□□□□□ -1.4
GREB1-208ENST00000470980 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.29□□□□□ -1.4
GREB1-208ENST00000470980 NUPR2A6NF83 97 aa6.29□□□□□ -1.4
GREB1-208ENST00000470980 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.29□□□□□ -1.4
GREB1-208ENST00000470980 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.29□□□□□ -1.4
GREB1-208ENST00000470980 COX7B2Q8TF08 81 aa6.29□□□□□ -1.4
GREB1-208ENST00000470980 SIGMAR1Q99720 223 aa6.29□□□□□ -1.4
GREB1-208ENST00000470980 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.29□□□□□ -1.4
GREB1-208ENST00000470980 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
GREB1-208ENST00000470980 KMT2AQ03164 3969 aa6.28□□□□□ -1.4
GREB1-208ENST00000470980 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.28□□□□□ -1.4
GREB1-208ENST00000470980 A0A0J9YXY3 114 aa6.28□□□□□ -1.4
GREB1-208ENST00000470980 NDUFA1O15239 70 aa6.28□□□□□ -1.4
GREB1-208ENST00000470980 MALP21145 153 aa6.28□□□□□ -1.4
GREB1-208ENST00000470980 GCSHP23434 173 aa6.28□□□□□ -1.4
GREB1-208ENST00000470980 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
GREB1-208ENST00000470980 MIAQ16674 131 aa6.28□□□□□ -1.4
GREB1-208ENST00000470980 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.28□□□□□ -1.4
GREB1-208ENST00000470980 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.28□□□□□ -1.4
GREB1-208ENST00000470980 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.28□□□□□ -1.4
GREB1-208ENST00000470980 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.28□□□□□ -1.4
GREB1-208ENST00000470980 Q9H8V8 135 aa6.28□□□□□ -1.4
GREB1-208ENST00000470980 PRSS2P07478 247 aa6.27□□□□□ -1.41
GREB1-208ENST00000470980 FOXI1Q12951 378 aa6.27□□□□□ -1.41
GREB1-208ENST00000470980 TAL2Q16559 108 aa6.27□□□□□ -1.41
GREB1-208ENST00000470980 APLNQ9ULZ1 77 aa6.27□□□□□ -1.41
GREB1-208ENST00000470980 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.26□□□□□ -1.41
GREB1-208ENST00000470980 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
GREB1-208ENST00000470980 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.26□□□□□ -1.41
GREB1-208ENST00000470980 CEND1Q8N111 149 aa6.26□□□□□ -1.41
GREB1-208ENST00000470980 UPK3BQ9BT76 320 aa6.26□□□□□ -1.41
GREB1-208ENST00000470980 COX11Q9Y6N1 276 aa6.26□□□□□ -1.41
GREB1-208ENST00000470980 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.26□□□□□ -1.41
GREB1-208ENST00000470980 APOMO95445 188 aa6.25□□□□□ -1.41
GREB1-208ENST00000470980 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
GREB1-208ENST00000470980 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
GREB1-208ENST00000470980 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.25□□□□□ -1.41
GREB1-208ENST00000470980 Q9HAA7 133 aa6.25□□□□□ -1.41
GREB1-208ENST00000470980 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
GREB1-208ENST00000470980 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.24□□□□□ -1.41
GREB1-208ENST00000470980 A6NDN8 102 aa6.24□□□□□ -1.41
GREB1-208ENST00000470980 FXYD2P54710 66 aa6.24□□□□□ -1.41
GREB1-208ENST00000470980 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.24□□□□□ -1.41
GREB1-208ENST00000470980 Q8IZM0 81 aa6.24□□□□□ -1.41
GREB1-208ENST00000470980 TM2D2Q9BX73 214 aa6.24□□□□□ -1.41
GREB1-208ENST00000470980 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.23□□□□□ -1.41
GREB1-208ENST00000470980 TIMM17BO60830 172 aa6.23□□□□□ -1.41
GREB1-208ENST00000470980 SFTA2Q6UW10 78 aa6.23□□□□□ -1.41
GREB1-208ENST00000470980 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.23□□□□□ -1.41
GREB1-208ENST00000470980 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.23□□□□□ -1.41
GREB1-208ENST00000470980 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.23□□□□□ -1.41
GREB1-208ENST00000470980 A0A0U1RRA0 63 aa6.22□□□□□ -1.41
GREB1-208ENST00000470980 SPAG11BQ08648 103 aa6.22□□□□□ -1.41
GREB1-208ENST00000470980 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.22□□□□□ -1.41
GREB1-208ENST00000470980 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.22□□□□□ -1.41
GREB1-208ENST00000470980 RMI2Q96E14 147 aa6.22□□□□□ -1.41
GREB1-208ENST00000470980 LITAFQ99732 161 aa6.22□□□□□ -1.41
GREB1-208ENST00000470980 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.22□□□□□ -1.41
GREB1-208ENST00000470980 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.22□□□□□ -1.41
GREB1-208ENST00000470980 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
GREB1-208ENST00000470980 SMIM13P0DJ93 91 aa6.21□□□□□ -1.42
GREB1-208ENST00000470980 CXCL5P42830 114 aa6.21□□□□□ -1.42
GREB1-208ENST00000470980 KIAA0087Q14695 138 aa6.21□□□□□ -1.42
GREB1-208ENST00000470980 C2orf82Q6UX34 121 aa6.21□□□□□ -1.42
GREB1-208ENST00000470980 Q6ZVH6 145 aa6.21□□□□□ -1.42
GREB1-208ENST00000470980 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.21□□□□□ -1.42
GREB1-208ENST00000470980 TMEM126AQ9H061 195 aa6.21□□□□□ -1.42
GREB1-208ENST00000470980 HERC2O95714 4834 aa6.21□□□□□ -1.42
GREB1-208ENST00000470980 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.2□□□□□ -1.42
GREB1-208ENST00000470980 LY6G6CO95867 125 aa6.2□□□□□ -1.42
GREB1-208ENST00000470980 LINC00158P58513 81 aa6.2□□□□□ -1.42
GREB1-208ENST00000470980 NPC2P61916 151 aa6.2□□□□□ -1.42
GREB1-208ENST00000470980 DAND5Q8N907 189 aa6.2□□□□□ -1.42
GREB1-208ENST00000470980 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.2□□□□□ -1.42
GREB1-208ENST00000470980 K7ERJ3 54 aa6.19□□□□□ -1.42
GREB1-208ENST00000470980 IFITM1P13164 125 aa6.19□□□□□ -1.42
GREB1-208ENST00000470980 PFN2P35080 140 aa6.19□□□□□ -1.42
GREB1-208ENST00000470980 C6orf223Q8N319 242 aa6.19□□□□□ -1.42
GREB1-208ENST00000470980 RAB37Q96AX2 223 aa6.19□□□□□ -1.42
GREB1-208ENST00000470980 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.19□□□□□ -1.42
GREB1-208ENST00000470980 ERG28Q9UKR5 140 aa6.19□□□□□ -1.42
GREB1-208ENST00000470980 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.18□□□□□ -1.42
GREB1-208ENST00000470980 TAX1BP3O14907 124 aa6.18□□□□□ -1.42
GREB1-208ENST00000470980 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.18□□□□□ -1.42
GREB1-208ENST00000470980 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.18□□□□□ -1.42
GREB1-208ENST00000470980 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.18□□□□□ -1.42
GREB1-208ENST00000470980 COPS9Q8WXC6 57 aa6.18□□□□□ -1.42
GREB1-208ENST00000470980 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.17□□□□□ -1.42
GREB1-208ENST00000470980 TTC32Q5I0X7 151 aa6.17□□□□□ -1.42
GREB1-208ENST00000470980 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.17□□□□□ -1.42
GREB1-208ENST00000470980 C15orf56Q8N910 161 aa6.17□□□□□ -1.42
GREB1-208ENST00000470980 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.17□□□□□ -1.42
GREB1-208ENST00000470980 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.3 ms