RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-205ENST00000450873 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-205ENST00000450873 Q8N3U1 123 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-205ENST00000450873 SMIM2Q9BVW6 85 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-205ENST00000450873 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-205ENST00000450873 DNAH11Q96DT5 4516 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-205ENST00000450873 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-205ENST00000450873 H7C423 109 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-205ENST00000450873 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-205ENST00000450873 LAGE3Q14657 143 aa7.15□□□□□ -1.27
RABGEF1-205ENST00000450873 KIAA1109Q2LD37 5005 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A1B0GUV1 79 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-205ENST00000450873 KLK12Q9UKR0 248 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-205ENST00000450873 F8VRH5 84 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-205ENST00000450873 PSMB2P49721 201 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-205ENST00000450873 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A1B0GX51 115 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-205ENST00000450873 ANGP03950 147 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-205ENST00000450873 PKD1P98161 4303 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-205ENST00000450873 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-205ENST00000450873 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-205ENST00000450873 K7EMI3 77 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-205ENST00000450873 UBE2D1P51668 147 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-205ENST00000450873 PKHD1P08F94 4074 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-205ENST00000450873 J3KT08 172 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-205ENST00000450873 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-205ENST00000450873 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-205ENST00000450873 UBE2WQ96B02 151 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-205ENST00000450873 RMI2Q96E14 147 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-205ENST00000450873 Q9HAA7 133 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-205ENST00000450873 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-205ENST00000450873 A4D1N5 150 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-205ENST00000450873 CRPP02741 224 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-205ENST00000450873 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-205ENST00000450873 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-205ENST00000450873 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-205ENST00000450873 C20orf203Q8NBC4 194 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM101Q96IK0 257 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-205ENST00000450873 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-205ENST00000450873 LINC00269Q8N2A0 174 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-205ENST00000450873 LINC01600Q96MT4 127 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-205ENST00000450873 PRR34Q9NV39 138 aa7.1□□□□□ -1.27
RABGEF1-205ENST00000450873 ENHOQ6UWT2 76 aa7.09□□□□□ -1.27
RABGEF1-205ENST00000450873 LINC01549A6NIU2 74 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGEF1-205ENST00000450873 MIAQ16674 131 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGEF1-205ENST00000450873 ORMDL2Q53FV1 153 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGEF1-205ENST00000450873 TIMM21Q9BVV7 248 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGEF1-205ENST00000450873 REG3AQ06141 175 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGEF1-205ENST00000450873 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGEF1-205ENST00000450873 PSCAO43653 123 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-205ENST00000450873 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-205ENST00000450873 TOMM6Q96B49 74 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-205ENST00000450873 IMUPQ9GZP8 106 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-205ENST00000450873 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-205ENST00000450873 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-205ENST00000450873 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC25A20O43772 301 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-205ENST00000450873 TNP2Q05952 138 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-205ENST00000450873 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.07□□□□□ -1.28
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RABGEF1-205ENST00000450873 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-205ENST00000450873 TCL1BO95988 128 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-205ENST00000450873 CLPSL2Q6UWE3 100 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-205ENST00000450873 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF815PA8K554 130 aa7.06□□□□□ -1.28
RABGEF1-205ENST00000450873 C9JAW5 83 aa7.06□□□□□ -1.28
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RABGEF1-205ENST00000450873 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.05□□□□□ -1.28
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RABGEF1-205ENST00000450873 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-205ENST00000450873 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-205ENST00000450873 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-205ENST00000450873 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-205ENST00000450873 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-205ENST00000450873 C2orf66Q6UXQ4 117 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-205ENST00000450873 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-205ENST00000450873 HERVK_113P61574 105 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-205ENST00000450873 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-205ENST00000450873 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-205ENST00000450873 BAALCQ8WXS3 180 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A087WTM6 91 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-205ENST00000450873 RYR1P21817 5038 aa7.02□□□□□ -1.28
RABGEF1-205ENST00000450873 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-205ENST00000450873 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-205ENST00000450873 C16orf90A8MZG2 172 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-205ENST00000450873 CDK2AP2O75956 126 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-205ENST00000450873 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-205ENST00000450873 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-205ENST00000450873 SS18Q15532 418 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-205ENST00000450873 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-205ENST00000450873 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-205ENST00000450873 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-205ENST00000450873 HSPG2P98160 4391 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-205ENST00000450873 IGIPA6NJ69 53 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-205ENST00000450873 CFC1BP0CG36 223 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-205ENST00000450873 CFC1P0CG37 223 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-205ENST00000450873 ATXN8Q156A1 80 aa7.01□□□□□ -1.29
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