RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
CNN3-202ENST00000394202 COX7B2Q8TF08 81 aa15.4■□□□□ 0.06
CNN3-202ENST00000394202 TM2D2Q9BX73 214 aa15.4■□□□□ 0.06
CNN3-202ENST00000394202 DNAH6Q9C0G6 4158 aa15.4■□□□□ 0.06
CNN3-202ENST00000394202 SMIM13P0DJ93 91 aa15.4■□□□□ 0.06
CNN3-202ENST00000394202 KIAA0087Q14695 138 aa15.4■□□□□ 0.06
CNN3-202ENST00000394202 C15orf56Q8N910 161 aa15.4■□□□□ 0.06
CNN3-202ENST00000394202 HYDINQ4G0P3 5121 aa15.39■□□□□ 0.05
CNN3-202ENST00000394202 GCSHP23434 173 aa15.39■□□□□ 0.05
CNN3-202ENST00000394202 H3BUT2 72 aa15.38■□□□□ 0.05
CNN3-202ENST00000394202 ZNF815PA8K554 130 aa15.38■□□□□ 0.05
CNN3-202ENST00000394202 CEND1Q8N111 149 aa15.38■□□□□ 0.05
CNN3-202ENST00000394202 NDUFA12Q9UI09 145 aa15.38■□□□□ 0.05
CNN3-202ENST00000394202 LECT2O14960 151 aa15.37■□□□□ 0.05
CNN3-202ENST00000394202 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
CNN3-202ENST00000394202 C6orf223Q8N319 242 aa15.37■□□□□ 0.05
CNN3-202ENST00000394202 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa15.36■□□□□ 0.05
CNN3-202ENST00000394202 FXYD2P54710 66 aa15.36■□□□□ 0.05
CNN3-202ENST00000394202 HIGD2BQ4VC39 106 aa15.36■□□□□ 0.05
CNN3-202ENST00000394202 APOMO95445 188 aa15.36■□□□□ 0.05
CNN3-202ENST00000394202 C2orf82Q6UX34 121 aa15.36■□□□□ 0.05
CNN3-202ENST00000394202 SACSQ9NZJ4 4579 aa15.36■□□□□ 0.05
CNN3-202ENST00000394202 K7EP34 96 aa15.35■□□□□ 0.05
CNN3-202ENST00000394202 WFDC2Q14508 124 aa15.35■□□□□ 0.05
CNN3-202ENST00000394202 C6orf226Q5I0X4 101 aa15.35■□□□□ 0.05
CNN3-202ENST00000394202 Q8IZM0 81 aa15.35■□□□□ 0.05
CNN3-202ENST00000394202 A0A1W2PPM0 123 aa15.35■□□□□ 0.05
CNN3-202ENST00000394202 RAB37Q96AX2 223 aa15.35■□□□□ 0.05
CNN3-202ENST00000394202 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
CNN3-202ENST00000394202 SPAG11BQ08648 103 aa15.34■□□□□ 0.05
CNN3-202ENST00000394202 USP17L23D6RBM5 183 aa15.33■□□□□ 0.05
CNN3-202ENST00000394202 PSCAO43653 123 aa15.33■□□□□ 0.05
CNN3-202ENST00000394202 PRSS2P07478 247 aa15.33■□□□□ 0.05
CNN3-202ENST00000394202 NDUFA1O15239 70 aa15.32■□□□□ 0.04
CNN3-202ENST00000394202 FABP2P12104 132 aa15.31■□□□□ 0.04
CNN3-202ENST00000394202 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
CNN3-202ENST00000394202 C10orf25Q5T742 122 aa15.29■□□□□ 0.04
CNN3-202ENST00000394202 CFAP161Q6P656 301 aa15.29■□□□□ 0.04
CNN3-202ENST00000394202 HIST1H4GQ99525 98 aa15.29■□□□□ 0.04
CNN3-202ENST00000394202 A0A0J9YXY3 114 aa15.29■□□□□ 0.04
CNN3-202ENST00000394202 OCIAD2Q56VL3 154 aa15.29■□□□□ 0.04
CNN3-202ENST00000394202 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
CNN3-202ENST00000394202 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
CNN3-202ENST00000394202 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
CNN3-202ENST00000394202 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa15.28■□□□□ 0.04
CNN3-202ENST00000394202 CKS1BP61024 79 aa15.28■□□□□ 0.04
CNN3-202ENST00000394202 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa15.28■□□□□ 0.04
CNN3-202ENST00000394202 SPCS1Q9Y6A9 102 aa15.28■□□□□ 0.04
CNN3-202ENST00000394202 SCGB1D4Q6XE38 83 aa15.27■□□□□ 0.04
CNN3-202ENST00000394202 LCE6AA0A183 80 aa15.26■□□□□ 0.03
CNN3-202ENST00000394202 LRCOL1A6NCL2 159 aa15.26■□□□□ 0.03
CNN3-202ENST00000394202 C1orf134Q5TEV5 83 aa15.26■□□□□ 0.03
CNN3-202ENST00000394202 SLPIP03973 132 aa15.25■□□□□ 0.03
CNN3-202ENST00000394202 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
CNN3-202ENST00000394202 K7ERJ3 54 aa15.25■□□□□ 0.03
CNN3-202ENST00000394202 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
CNN3-202ENST00000394202 FRAS1Q86XX4 4008 aa15.24■□□□□ 0.03
CNN3-202ENST00000394202 A0A0U1RRA0 63 aa15.23■□□□□ 0.03
CNN3-202ENST00000394202 A0A1B0GWB2 263 aa15.23■□□□□ 0.03
CNN3-202ENST00000394202 K7ERU9 68 aa15.23■□□□□ 0.03
CNN3-202ENST00000394202 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa15.23■□□□□ 0.03
CNN3-202ENST00000394202 LITAFQ99732 161 aa15.23■□□□□ 0.03
CNN3-202ENST00000394202 CXCL5P42830 114 aa15.22■□□□□ 0.03
CNN3-202ENST00000394202 HERV-K104P63124 156 aa15.22■□□□□ 0.03
CNN3-202ENST00000394202 Q6ZRU5 148 aa15.22■□□□□ 0.03
CNN3-202ENST00000394202 CAMK2N2Q96S95 79 aa15.22■□□□□ 0.03
CNN3-202ENST00000394202 DNAH17Q9UFH2 4485 aa15.21■□□□□ 0.03
CNN3-202ENST00000394202 C2orf48Q96LS8 159 aa15.2■□□□□ 0.02
CNN3-202ENST00000394202 DAND5Q8N907 189 aa15.2■□□□□ 0.02
CNN3-202ENST00000394202 C6orf48Q9UBA6 75 aa15.2■□□□□ 0.02
CNN3-202ENST00000394202 MEIG1Q5JSS6 88 aa15.19■□□□□ 0.02
CNN3-202ENST00000394202 PFN2P35080 140 aa15.18■□□□□ 0.02
CNN3-202ENST00000394202 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa15.17■□□□□ 0.02
CNN3-202ENST00000394202 A6NJY4 79 aa15.17■□□□□ 0.02
CNN3-202ENST00000394202 RTL8CO15255 209 aa15.17■□□□□ 0.02
CNN3-202ENST00000394202 RNF151Q2KHN1 245 aa15.17■□□□□ 0.02
CNN3-202ENST00000394202 SFTA2Q6UW10 78 aa15.17■□□□□ 0.02
CNN3-202ENST00000394202 ERG28Q9UKR5 140 aa15.17■□□□□ 0.02
CNN3-202ENST00000394202 SYCNQ0VAF6 134 aa15.16■□□□□ 0.02
CNN3-202ENST00000394202 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
CNN3-202ENST00000394202 A0A087WTM6 91 aa15.15■□□□□ 0.02
CNN3-202ENST00000394202 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
CNN3-202ENST00000394202 LINC00158P58513 81 aa15.14■□□□□ 0.01
CNN3-202ENST00000394202 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP15.14■□□□□ 0.01
CNN3-202ENST00000394202 TIMM17BO60830 172 aa15.13■□□□□ 0.01
CNN3-202ENST00000394202 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
CNN3-202ENST00000394202 TNP2Q05952 138 aa15.13■□□□□ 0.01
CNN3-202ENST00000394202 CARD19Q96LW7 228 aa15.13■□□□□ 0.01
CNN3-202ENST00000394202 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa15.12■□□□□ 0.01
CNN3-202ENST00000394202 TMEM238C9JI98 176 aa15.12■□□□□ 0.01
CNN3-202ENST00000394202 NPC2P61916 151 aa15.12■□□□□ 0.01
CNN3-202ENST00000394202 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
CNN3-202ENST00000394202 VPS25Q9BRG1 176 aa15.12■□□□□ 0.01
CNN3-202ENST00000394202 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa15.12■□□□□ 0.01
CNN3-202ENST00000394202 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa15.11■□□□□ 0.01
CNN3-202ENST00000394202 Q8N814 137 aa15.11■□□□□ 0.01
CNN3-202ENST00000394202 FAT2Q9NYQ8 4349 aa15.11■□□□□ 0.01
CNN3-202ENST00000394202 RYR2Q92736 4967 aa15.11■□□□□ 0.01
CNN3-202ENST00000394202 F8WDY8 70 aa15.11■□□□□ 0.01
CNN3-202ENST00000394202 C14orf177Q52M58 125 aa15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 144 ms