RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 A0A087WYN8 130 aa15.65■□□□□ 0.1
PITX1-201ENST00000265340 WFDC9Q8NEX5 89 aa15.65■□□□□ 0.1
PITX1-201ENST00000265340 TMEM89A2RUT3 159 aa15.64■□□□□ 0.09
PITX1-201ENST00000265340 F6UB75 175 aa15.64■□□□□ 0.09
PITX1-201ENST00000265340 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa15.64■□□□□ 0.09
PITX1-201ENST00000265340 NCR3O14931 201 aa15.64■□□□□ 0.09
PITX1-201ENST00000265340 C6orf226Q5I0X4 101 aa15.64■□□□□ 0.09
PITX1-201ENST00000265340 ENHOQ6UWT2 76 aa15.64■□□□□ 0.09
PITX1-201ENST00000265340 H0YGX0 51 aa15.63■□□□□ 0.09
PITX1-201ENST00000265340 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP15.63■□□□□ 0.092e-8■□□□□ 11
PITX1-201ENST00000265340 A0A0U1RRA0 63 aa15.63■□□□□ 0.09
PITX1-201ENST00000265340 K7EMT4 169 aa15.63■□□□□ 0.09
PITX1-201ENST00000265340 RBM3P98179 157 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
PITX1-201ENST00000265340 F8WEM9 126 aa15.61■□□□□ 0.09
PITX1-201ENST00000265340 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa15.6■□□□□ 0.09
PITX1-201ENST00000265340 NDUFC1O43677 76 aa15.6■□□□□ 0.09
PITX1-201ENST00000265340 CRPP02741 224 aa15.6■□□□□ 0.09
PITX1-201ENST00000265340 C18orf65Q6ZTR6 163 aa15.6■□□□□ 0.09
PITX1-201ENST00000265340 ESM1Q9NQ30 184 aa15.59■□□□□ 0.09
PITX1-201ENST00000265340 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
PITX1-201ENST00000265340 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa15.57■□□□□ 0.08
PITX1-201ENST00000265340 RMI2Q96E14 147 aa15.57■□□□□ 0.08
PITX1-201ENST00000265340 UBE2E2Q96LR5 201 aa15.57■□□□□ 0.08
PITX1-201ENST00000265340 IL17DQ8TAD2 202 aa15.56■□□□□ 0.08
PITX1-201ENST00000265340 SS18Q15532 418 aa15.56■□□□□ 0.08
PITX1-201ENST00000265340 DEFB136Q30KP8 78 aa15.56■□□□□ 0.08
PITX1-201ENST00000265340 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa15.56■□□□□ 0.08
PITX1-201ENST00000265340 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
PITX1-201ENST00000265340 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa15.55■□□□□ 0.08
PITX1-201ENST00000265340 CHCHD7Q9BUK0 85 aa15.55■□□□□ 0.08
PITX1-201ENST00000265340 SNURFQ9Y675 71 aa15.55■□□□□ 0.08
PITX1-201ENST00000265340 JMJD1CQ15652 2540 aa15.55■□□□□ 0.08
PITX1-201ENST00000265340 SORL1Q92673 2214 aa15.54■□□□□ 0.08
PITX1-201ENST00000265340 PMAIP1Q13794 54 aa15.54■□□□□ 0.08
PITX1-201ENST00000265340 LINC00337Q8N6G1 96 aa15.54■□□□□ 0.08
PITX1-201ENST00000265340 SMIM11BQ8TCY0 68 aa15.54■□□□□ 0.08
PITX1-201ENST00000265340 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
PITX1-201ENST00000265340 LECT2O14960 151 aa15.53■□□□□ 0.08
PITX1-201ENST00000265340 ORMDL1Q9P0S3 153 aa15.53■□□□□ 0.08
PITX1-201ENST00000265340 UBL5Q9BZL1 73 aa15.52■□□□□ 0.08
PITX1-201ENST00000265340 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa15.52■□□□□ 0.07
PITX1-201ENST00000265340 SLURP1P55000 103 aa15.51■□□□□ 0.07
PITX1-201ENST00000265340 C1orf158Q8N1D5 194 aa15.51■□□□□ 0.07
PITX1-201ENST00000265340 COX6A2Q02221 97 aa15.5■□□□□ 0.07
PITX1-201ENST00000265340 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa15.49■□□□□ 0.07
PITX1-201ENST00000265340 IGKV2D-28P01615 120 aa15.49■□□□□ 0.07
PITX1-201ENST00000265340 SMIM1B2RUZ4 78 aa15.48■□□□□ 0.07
PITX1-201ENST00000265340 PRR15Q8IV56 129 aa15.48■□□□□ 0.07
PITX1-201ENST00000265340 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
PITX1-201ENST00000265340 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa15.47■□□□□ 0.07
PITX1-201ENST00000265340 K7EQG2 157 aa15.47■□□□□ 0.07
PITX1-201ENST00000265340 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa15.46■□□□□ 0.07
PITX1-201ENST00000265340 LINC00467Q9BRT7 94 aa15.46■□□□□ 0.07
PITX1-201ENST00000265340 Q6ZRU5 148 aa15.45■□□□□ 0.06
PITX1-201ENST00000265340 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa15.45■□□□□ 0.06
PITX1-201ENST00000265340 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa15.45■□□□□ 0.06
PITX1-201ENST00000265340 C2CD3Q4AC94 2353 aa15.45■□□□□ 0.06
PITX1-201ENST00000265340 SLPIP03973 132 aa15.44■□□□□ 0.06
PITX1-201ENST00000265340 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
PITX1-201ENST00000265340 LINC00242Q5T6M2 205 aa15.44■□□□□ 0.06
PITX1-201ENST00000265340 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
PITX1-201ENST00000265340 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa15.44■□□□□ 0.06
PITX1-201ENST00000265340 PLAC8L1A1L4L8 177 aa15.44■□□□□ 0.06
PITX1-201ENST00000265340 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
PITX1-201ENST00000265340 IGKV3-20P01619 116 aa15.43■□□□□ 0.06
PITX1-201ENST00000265340 C11orf72Q8NBR9 251 aa15.43■□□□□ 0.06
PITX1-201ENST00000265340 MPLKIPQ8TAP9 179 aa15.43■□□□□ 0.06
PITX1-201ENST00000265340 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa15.42■□□□□ 0.06
PITX1-201ENST00000265340 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
PITX1-201ENST00000265340 FAM229BQ4G0N7 80 aa15.42■□□□□ 0.06
PITX1-201ENST00000265340 C4orf3Q8WVX3 66 aa15.42■□□□□ 0.06
PITX1-201ENST00000265340 LINC00167Q96N53 147 aa15.42■□□□□ 0.06
PITX1-201ENST00000265340 TRAV10A0A0B4J240 114 aa15.42■□□□□ 0.06
PITX1-201ENST00000265340 C11orf44Q8N8P7 122 aa15.42■□□□□ 0.06
PITX1-201ENST00000265340 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa15.41■□□□□ 0.06
PITX1-201ENST00000265340 A0A1W2PRX2 142 aa15.4■□□□□ 0.06
PITX1-201ENST00000265340 MIFP14174 115 aa15.39■□□□□ 0.05
PITX1-201ENST00000265340 WNK1Q9H4A3 2382 aa15.39■□□□□ 0.05
PITX1-201ENST00000265340 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa15.38■□□□□ 0.05
PITX1-201ENST00000265340 CD164Q04900 197 aa15.37■□□□□ 0.05
PITX1-201ENST00000265340 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa15.37■□□□□ 0.05
PITX1-201ENST00000265340 PROK1P58294 105 aa15.36■□□□□ 0.05
PITX1-201ENST00000265340 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa15.36■□□□□ 0.05
PITX1-201ENST00000265340 SPINK13Q1W4C9 94 aa15.35■□□□□ 0.05
PITX1-201ENST00000265340 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa15.35■□□□□ 0.05
PITX1-201ENST00000265340 ESRGQ1W209 222 aa15.35■□□□□ 0.05
PITX1-201ENST00000265340 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa15.34■□□□□ 0.05
PITX1-201ENST00000265340 ATRQ13535 2644 aa15.34■□□□□ 0.05
PITX1-201ENST00000265340 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
PITX1-201ENST00000265340 LINC01006Q8NI28 216 aa15.33■□□□□ 0.04
PITX1-201ENST00000265340 DEFB131AP59861 70 aa15.32■□□□□ 0.04
PITX1-201ENST00000265340 Q9UF83 564 aa15.31■□□□□ 0.04
PITX1-201ENST00000265340 ERC2-IT1O76042 136 aa15.3■□□□□ 0.04
PITX1-201ENST00000265340 CCL18P55774 89 aa15.3■□□□□ 0.04
PITX1-201ENST00000265340 DEFB114Q30KQ6 69 aa15.29■□□□□ 0.04
PITX1-201ENST00000265340 TM2D3Q9BRN9 247 aa15.29■□□□□ 0.04
PITX1-201ENST00000265340 Q6ZTI0 123 aa15.28■□□□□ 0.04
PITX1-201ENST00000265340 RETNQ9HD89 108 aa15.28■□□□□ 0.04
PITX1-201ENST00000265340 CXCL6P80162 114 aa15.28■□□□□ 0.04
PITX1-201ENST00000265340 DYNLRB2Q8TF09 96 aa15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79 ms