RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 LINC01561Q8N1V8 128 aa12.83□□□□□ -0.35
HOXD11-201ENST00000249504 MALP21145 153 aa12.82□□□□□ -0.36
HOXD11-201ENST00000249504 WFDC2Q14508 124 aa12.82□□□□□ -0.36
HOXD11-201ENST00000249504 SCGB1D4Q6XE38 83 aa12.82□□□□□ -0.36
HOXD11-201ENST00000249504 USP17L23D6RBM5 183 aa12.8□□□□□ -0.36
HOXD11-201ENST00000249504 M0R143 59 aa12.8□□□□□ -0.36
HOXD11-201ENST00000249504 Q8N814 137 aa12.8□□□□□ -0.36
HOXD11-201ENST00000249504 C15orf56Q8N910 161 aa12.8□□□□□ -0.36
HOXD11-201ENST00000249504 APOMO95445 188 aa12.79□□□□□ -0.36
HOXD11-201ENST00000249504 CFAP161Q6P656 301 aa12.79□□□□□ -0.36
HOXD11-201ENST00000249504 NDUFA12Q9UI09 145 aa12.79□□□□□ -0.36
HOXD11-201ENST00000249504 C14orf177Q52M58 125 aa12.78□□□□□ -0.36
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP10-2P60368 255 aa12.78□□□□□ -0.36
HOXD11-201ENST00000249504 HSD52Q0P140 79 aa12.78□□□□□ -0.36
HOXD11-201ENST00000249504 DNAH11Q96DT5 4516 aa12.77□□□□□ -0.36
HOXD11-201ENST00000249504 PKD1P98161 4303 aa12.77□□□□□ -0.37
HOXD11-201ENST00000249504 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa12.76□□□□□ -0.37
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HOXD11-201ENST00000249504 NDUFA1O15239 70 aa12.76□□□□□ -0.37
HOXD11-201ENST00000249504 TAL2Q16559 108 aa12.76□□□□□ -0.37
HOXD11-201ENST00000249504 COX7B2Q8TF08 81 aa12.76□□□□□ -0.37
HOXD11-201ENST00000249504 ORAOV1Q8WV07 137 aa12.76□□□□□ -0.37
HOXD11-201ENST00000249504 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa12.76□□□□□ -0.37
HOXD11-201ENST00000249504 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
HOXD11-201ENST00000249504 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
HOXD11-201ENST00000249504 C16orf90A8MZG2 172 aa12.74□□□□□ -0.37
HOXD11-201ENST00000249504 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP12.74□□□□□ -0.37
HOXD11-201ENST00000249504 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
HOXD11-201ENST00000249504 SFTA2Q6UW10 78 aa12.74□□□□□ -0.37
HOXD11-201ENST00000249504 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
HOXD11-201ENST00000249504 SNHG12Q9BXW3 62 aa12.74□□□□□ -0.37
HOXD11-201ENST00000249504 HERV-K104P63124 156 aa12.73□□□□□ -0.37
HOXD11-201ENST00000249504 HIGD2BQ4VC39 106 aa12.73□□□□□ -0.37
HOXD11-201ENST00000249504 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa12.72□□□□□ -0.37
HOXD11-201ENST00000249504 SPAG11BQ08648 103 aa12.72□□□□□ -0.37
HOXD11-201ENST00000249504 KIAA0087Q14695 138 aa12.72□□□□□ -0.37
HOXD11-201ENST00000249504 HIST1H4GQ99525 98 aa12.72□□□□□ -0.37
HOXD11-201ENST00000249504 TOMM7Q9P0U1 55 aa12.72□□□□□ -0.37
HOXD11-201ENST00000249504 A0A0J9YXY3 114 aa12.72□□□□□ -0.37
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM238C9JI98 176 aa12.72□□□□□ -0.37
HOXD11-201ENST00000249504 PRSS2P07478 247 aa12.72□□□□□ -0.37
HOXD11-201ENST00000249504 BATFQ16520 125 aa12.72□□□□□ -0.37
HOXD11-201ENST00000249504 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
HOXD11-201ENST00000249504 Q8IZM0 81 aa12.72□□□□□ -0.37
HOXD11-201ENST00000249504 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa12.71□□□□□ -0.38
HOXD11-201ENST00000249504 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP12.71□□□□□ -0.38
HOXD11-201ENST00000249504 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa12.71□□□□□ -0.38
HOXD11-201ENST00000249504 LINC00526Q96FQ7 95 aa12.7□□□□□ -0.38
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
HOXD11-201ENST00000249504 PKHD1P08F94 4074 aa12.69□□□□□ -0.38
HOXD11-201ENST00000249504 TIMM17BO60830 172 aa12.69□□□□□ -0.38
HOXD11-201ENST00000249504 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
HOXD11-201ENST00000249504 C6orf226Q5I0X4 101 aa12.69□□□□□ -0.38
HOXD11-201ENST00000249504 CEND1Q8N111 149 aa12.68□□□□□ -0.38
HOXD11-201ENST00000249504 C2orf48Q96LS8 159 aa12.68□□□□□ -0.38
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HOXD11-201ENST00000249504 DNAH5Q8TE73 4624 aa12.66□□□□□ -0.38
HOXD11-201ENST00000249504 F8WDY8 70 aa12.66□□□□□ -0.38
HOXD11-201ENST00000249504 SLPIP03973 132 aa12.66□□□□□ -0.38
HOXD11-201ENST00000249504 Q6ZVH6 145 aa12.66□□□□□ -0.38
HOXD11-201ENST00000249504 CKS1BP61024 79 aa12.65□□□□□ -0.38
HOXD11-201ENST00000249504 CNBPP62633 177 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
HOXD11-201ENST00000249504 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa12.65□□□□□ -0.38
HOXD11-201ENST00000249504 A6NDN8 102 aa12.64□□□□□ -0.39
HOXD11-201ENST00000249504 MEIG1Q5JSS6 88 aa12.64□□□□□ -0.39
HOXD11-201ENST00000249504 C2orf82Q6UX34 121 aa12.64□□□□□ -0.39
HOXD11-201ENST00000249504 CAMK2N2Q96S95 79 aa12.64□□□□□ -0.39
HOXD11-201ENST00000249504 PTTG1IPP53801 180 aa12.63□□□□□ -0.39
HOXD11-201ENST00000249504 SYCNQ0VAF6 134 aa12.63□□□□□ -0.39
HOXD11-201ENST00000249504 LITAFQ99732 161 aa12.63□□□□□ -0.39
HOXD11-201ENST00000249504 SPANXDQ9BXN6 97 aa12.63□□□□□ -0.39
HOXD11-201ENST00000249504 SPANXCQ9NY87 97 aa12.63□□□□□ -0.39
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa12.62□□□□□ -0.39
HOXD11-201ENST00000249504 A6NJY4 79 aa12.62□□□□□ -0.39
HOXD11-201ENST00000249504 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa12.62□□□□□ -0.39
HOXD11-201ENST00000249504 Q6ZRU5 148 aa12.62□□□□□ -0.39
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HOXD11-201ENST00000249504 FXYD2P54710 66 aa12.61□□□□□ -0.39
HOXD11-201ENST00000249504 C10orf25Q5T742 122 aa12.61□□□□□ -0.39
HOXD11-201ENST00000249504 COPS9Q8WXC6 57 aa12.61□□□□□ -0.39
HOXD11-201ENST00000249504 CARD19Q96LW7 228 aa12.61□□□□□ -0.39
HOXD11-201ENST00000249504 BIRC6Q9NR09 4857 aa12.61□□□□□ -0.39
HOXD11-201ENST00000249504 IFITM1P13164 125 aa12.6□□□□□ -0.39
HOXD11-201ENST00000249504 KRTAP10-1P60331 282 aa12.59□□□□□ -0.39
HOXD11-201ENST00000249504 RPL24P83731 157 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
HOXD11-201ENST00000249504 LINC01620Q4KN68 170 aa12.59□□□□□ -0.39
HOXD11-201ENST00000249504 LRP1BQ9NZR2 4599 aa12.58□□□□□ -0.39
HOXD11-201ENST00000249504 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa12.58□□□□□ -0.4
HOXD11-201ENST00000249504 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa12.58□□□□□ -0.4
HOXD11-201ENST00000249504 C6orf48Q9UBA6 75 aa12.58□□□□□ -0.4
HOXD11-201ENST00000249504 RNF151Q2KHN1 245 aa12.57□□□□□ -0.4
HOXD11-201ENST00000249504 C9orf163Q8N9P6 203 aa12.57□□□□□ -0.4
HOXD11-201ENST00000249504 SMIM13P0DJ93 91 aa12.57□□□□□ -0.4
HOXD11-201ENST00000249504 MUSTN1Q8IVN3 82 aa12.57□□□□□ -0.4
HOXD11-201ENST00000249504 ERG28Q9UKR5 140 aa12.57□□□□□ -0.4
HOXD11-201ENST00000249504 LINC00158P58513 81 aa12.55□□□□□ -0.4
HOXD11-201ENST00000249504 COX17Q14061 63 aa12.55□□□□□ -0.4
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