RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637887.1

ARID1B-231, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

TSL 5

Gene ARID1B, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-231	ENST00000637887	NXPH4	O95158	308 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	MSMB	P08118	114 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	CD24	P25063	80 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	ESRG	Q1W209	222 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	ORMDL3	Q8N138	153 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	C20orf197	Q8N268	126 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887		A0A1W2PPR1	153 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	LINC01546	A6NGU7	62 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	SH2D1A	O60880	128 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	IGHV3-33	P01772	117 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	TRGV3	P03979	118 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	UBE2A	P49459	152 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	ZNF138	P52744	262 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	KRTAP12-2	P59991	146 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	SFTA2	Q6UW10	78 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	CNFN	Q9BYD5	112 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887		U3KQK5	164 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887		M0R3E3	92 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	COX7A2L	O14548	114 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	PPP1R17	O96001	155 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	3.86	□□□□□ -1.79	3e-6	■□□□□ 9
ARID1B-231	ENST00000637887	CXCL6	P80162	114 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887		Q1RN00	199 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887		Q1T7F1	81 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	SPTA1	P02549	2419 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	ABCA4	P78363	2273 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887		A6NDX4	124 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	ZNF815P	A8K554	130 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887		H0Y9J4	135 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	C19orf84	I3L1E1	186 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	COX6B1	P14854	86 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	CRIP1	P50238	77 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	MP68	P56378	58 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887		Q6ZRP5	223 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	PRR34	Q9NV39	138 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887		S4R3C0	116 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	BSN	Q9UPA5	3926 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887		G3V318	75 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887		H3BUX3	64 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	IGHV3-23	P01764	117 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887		Q8N377	158 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	DIRC1	Q969H9	104 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		3.85	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	ATM	Q13315	3056 aa		3.84	□□□□□ -1.79
ARID1B-231	ENST00000637887	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		3.84	□□□□□ -1.8
ARID1B-231	ENST00000637887	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		3.84	□□□□□ -1.8
ARID1B-231	ENST00000637887		D6R8Y8	96 aa		3.84	□□□□□ -1.8
ARID1B-231	ENST00000637887		F8VRH5	84 aa		3.84	□□□□□ -1.8
ARID1B-231	ENST00000637887		F8WEM9	126 aa		3.84	□□□□□ -1.8
ARID1B-231	ENST00000637887	IGHV3-30	P01768	117 aa		3.84	□□□□□ -1.8
ARID1B-231	ENST00000637887	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		3.84	□□□□□ -1.8
ARID1B-231	ENST00000637887	BLCAP	P62952	87 aa		3.84	□□□□□ -1.8
ARID1B-231	ENST00000637887	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		3.84	□□□□□ -1.8
ARID1B-231	ENST00000637887	GPHB5	Q86YW7	130 aa		3.84	□□□□□ -1.8
ARID1B-231	ENST00000637887	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.8
ARID1B-231	ENST00000637887	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		3.84	□□□□□ -1.8
ARID1B-231	ENST00000637887	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		3.84	□□□□□ -1.8
ARID1B-231	ENST00000637887	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ARID1B-231	ENST00000637887	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
ARID1B-231	ENST00000637887	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ARID1B-231	ENST00000637887	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ARID1B-231	ENST00000637887	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ARID1B-231	ENST00000637887	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ARID1B-231	ENST00000637887	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ARID1B-231	ENST00000637887	TMEM223	A0PJW6	202 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ARID1B-231	ENST00000637887	DNAL4	O96015	105 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ARID1B-231	ENST00000637887	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
ARID1B-231	ENST00000637887	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ARID1B-231	ENST00000637887	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		3.83	□□□□□ -1.8
ARID1B-231	ENST00000637887	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		3.83	□□□□□ -1.8

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