RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550159.5

CS-218, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 646 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-218ENST00000550159 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-218ENST00000550159 IGIPA6NJ69 53 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-218ENST00000550159 H0Y8G0 127 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-218ENST00000550159 COX7A2LO14548 114 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-218ENST00000550159 RTL8CO15255 209 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-218ENST00000550159 CDK2AP2O75956 126 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-218ENST00000550159 XCL1P47992 114 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-218ENST00000550159 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
CS-218ENST00000550159 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-218ENST00000550159 PRSS2P07478 247 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-218ENST00000550159 PLNP26678 52 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-218ENST00000550159 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-218ENST00000550159 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-218ENST00000550159 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CS-218ENST00000550159 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-218ENST00000550159 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-218ENST00000550159 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-218ENST00000550159 HERVK_113P61574 105 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-218ENST00000550159 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CS-218ENST00000550159 Q6ZR54 194 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-218ENST00000550159 BAALCQ8WXS3 180 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-218ENST00000550159 CST9LQ9H4G1 147 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-218ENST00000550159 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CS-218ENST00000550159 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
CS-218ENST00000550159 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-218ENST00000550159 KRTDAPP60985 99 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-218ENST00000550159 ENHOQ6UWT2 76 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-218ENST00000550159 LINC00469Q8N7U9 141 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-218ENST00000550159 AMELXQ99217 191 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-218ENST00000550159 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 UBE2D1P51668 147 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 PET117Q6UWS5 81 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 Q8N3U1 123 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 MYCBP2O75592 4640 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 C16orf90A8MZG2 172 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 F8VRH5 84 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 DPM2O94777 84 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 TMEM170BQ5T4T1 132 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 F8WDY8 70 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 CKS1BP61024 79 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 SFTA2Q6UW10 78 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 OR10D4PQ8NGN7 298 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 A0A096LNJ9 63 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 hDV102S1A0JD36 115 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 IGKCP01834 107 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 C5orf38Q86SI9 138 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 A0A0J9YXV3 536 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 NUPR1O60356 82 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 INAFM2P0DMQ5 153 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 IGLC3P0DOY3 106 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 ORAOV1Q8WV07 137 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 A0A087WZ39 114 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 C5orf52A6NGY3 159 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 USP17L23D6RBM5 183 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 SCGB1D1O95968 90 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 CXCL5P42830 114 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 LINC00310P59036 64 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 FOXI1Q12951 378 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.4□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 LINC00587B1AMM8 73 aa6.4□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 SPAG11BQ08648 103 aa6.4□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.4□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.4□□□□□ -1.38
CS-218ENST00000550159 FAT1Q14517 4588 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-218ENST00000550159 A0A087WTM6 91 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-218ENST00000550159 C11orf86A6NJI1 115 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-218ENST00000550159 EPM2AB3EWF7 344 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-218ENST00000550159 LECT2O14960 151 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-218ENST00000550159 NDUFA1O15239 70 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-218ENST00000550159 C3orf79P0CE67 100 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-218ENST00000550159 GCSHP23434 173 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-218ENST00000550159 ODF1Q14990 250 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-218ENST00000550159 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-218ENST00000550159 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-218ENST00000550159 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.39□□□□□ -1.39
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CS-218ENST00000550159 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-218ENST00000550159 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CS-218ENST00000550159 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.38□□□□□ -1.39
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