RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 ZFAND6Q6FIF0 208 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 GAGE10A6NGK3 116 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 IGLL5B9A064 214 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM238C9JI98 176 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 K7EP34 96 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 KRTAP10-11P60412 298 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 GAGE6Q13070 117 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 NDUFA12Q9UI09 145 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 A8MZ25 164 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 FABP2P12104 132 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 DAD1P61803 113 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 CHCHD5Q9BSY4 110 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 CELA1Q9UNI1 258 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 PAX4O43316 350 aa5.71□□□□□ -1.49
PDE4D-208ENST00000502484 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa5.71□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 ATP5G1P05496 136 aa5.71□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 LITAFQ99732 161 aa5.71□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 SPCS1Q9Y6A9 102 aa5.71□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 SMIM1B2RUZ4 78 aa5.7□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 F5H768 121 aa5.7□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 NDUFA1O15239 70 aa5.7□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 SPART-AS1P0CW21 52 aa5.7□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 A0A1B0GUV1 79 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 RPL24P83731 157 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 SPANXDQ9BXN6 97 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 SPANXCQ9NY87 97 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 TIMM17BO60830 172 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 APOMO95445 188 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 CFC1BP0CG36 223 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 CFC1P0CG37 223 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 MUSTN1Q8IVN3 82 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa5.69□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 A0A096LPF7 62 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 A4D1N5 150 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa5.68□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 TSPAN13O95857 204 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 RBX1P62877 108 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 MIAQ16674 131 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 DEFB121Q5J5C9 76 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 Q9H8V8 135 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 TGP01266 2768 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 A0A0B4J2C4 111 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM262E9PQX1 116 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 K7EIL1 84 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 PRO1854Q9UHT4 67 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 SH2D6Q7Z4S9 175 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 MRAPQ8TCY5 172 aa5.66□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 COL7A1Q02388 2944 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 A0A087WZ39 114 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 PRSS2P07478 247 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 IFITM1P13164 125 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 HTN3P15516 51 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 HERV-K104P63124 156 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 RETNQ9HD89 108 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 ICOSQ9Y6W8 199 aa5.65□□□□□ -1.5
PDE4D-208ENST00000502484 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
PDE4D-208ENST00000502484 LCE2BO14633 110 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-208ENST00000502484 IGHV3-33P01772 117 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-208ENST00000502484 SS18Q15532 418 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-208ENST00000502484 COX7B2Q8TF08 81 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-208ENST00000502484 LELP1Q5T871 98 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-208ENST00000502484 LYRM7Q5U5X0 104 aa5.64□□□□□ -1.51
PDE4D-208ENST00000502484 H3BMG7 143 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-208ENST00000502484 DAND5Q8N907 189 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-208ENST00000502484 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-208ENST00000502484 H3BNG1 76 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-208ENST00000502484 NPC2P61916 151 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-208ENST00000502484 MEIG1Q5JSS6 88 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-208ENST00000502484 ARL17AQ8IVW1 177 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-208ENST00000502484 ERG28Q9UKR5 140 aa5.63□□□□□ -1.51
PDE4D-208ENST00000502484 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-208ENST00000502484 TENM3Q9P273 2699 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-208ENST00000502484 F8W1H4 67 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-208ENST00000502484 C5orf38Q86SI9 138 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-208ENST00000502484 LINC01561Q8N1V8 128 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-208ENST00000502484 LINC00269Q8N2A0 174 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-208ENST00000502484 LINC00308Q8TCZ7 52 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-208ENST00000502484 COPS9Q8WXC6 57 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-208ENST00000502484 PPDPFQ9H3Y8 114 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-208ENST00000502484 TOMM7Q9P0U1 55 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-208ENST00000502484 XCL1P47992 114 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-208ENST00000502484 SFTA2Q6UW10 78 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-208ENST00000502484 CLPSL2Q6UWE3 100 aa5.62□□□□□ -1.51
PDE4D-208ENST00000502484 Q8N3U1 123 aa5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.4 ms