RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437322.2

USP27X-AS1-201, Transcript of USP27X antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP27X-AS1, Length 2,175 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CLEC2BQ92478 149 aa12.36□□□□□ -0.43
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa12.36□□□□□ -0.43
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C9orf66Q5T8R8 295 aa12.35□□□□□ -0.43
USP27X-AS1-201ENST00000437322 WFDC10AQ9H1F0 79 aa12.35□□□□□ -0.43
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RBMY1CP0DJD4 496 aa12.35□□□□□ -0.43
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FAM110AQ9BQ89 295 aa12.35□□□□□ -0.43
USP27X-AS1-201ENST00000437322 A8MZ25 164 aa12.34□□□□□ -0.43
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C19orf73Q9NVV2 129 aa12.34□□□□□ -0.43
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa12.33□□□□□ -0.44
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa12.33□□□□□ -0.44
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa12.33□□□□□ -0.44
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NDUFA1O15239 70 aa12.33□□□□□ -0.44
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TIRAPP58753 221 aa12.33□□□□□ -0.44
USP27X-AS1-201ENST00000437322 STAB1Q9NY15 2570 aa12.33□□□□□ -0.44
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NPC2P61916 151 aa12.32□□□□□ -0.44
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C3orf56Q8N813 242 aa12.32□□□□□ -0.44
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DNAJC30Q96LL9 226 aa12.31□□□□□ -0.44
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ACYP1P07311 99 aa12.3□□□□□ -0.44
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
USP27X-AS1-201ENST00000437322 INSP01308 110 aa12.3□□□□□ -0.44
USP27X-AS1-201ENST00000437322 Q6ZSN1 163 aa12.3□□□□□ -0.44
USP27X-AS1-201ENST00000437322 WFDC9Q8NEX5 89 aa12.3□□□□□ -0.44
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LINC00467Q9BRT7 94 aa12.3□□□□□ -0.44
USP27X-AS1-201ENST00000437322 XCL2Q9UBD3 114 aa12.3□□□□□ -0.44
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
USP27X-AS1-201ENST00000437322 Q9UF83 564 aa12.29□□□□□ -0.44
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa12.29□□□□□ -0.44
USP27X-AS1-201ENST00000437322 HTN1P15515 57 aa12.29□□□□□ -0.44
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TMEM101Q96IK0 257 aa12.29□□□□□ -0.44
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZNF415Q09FC8 603 aa12.28□□□□□ -0.44
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LINC00308Q8TCZ7 52 aa12.28□□□□□ -0.44
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IMUPQ9GZP8 106 aa12.28□□□□□ -0.44
USP27X-AS1-201ENST00000437322 COL6A5A8TX70 2615 aa12.27□□□□□ -0.44
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa12.27□□□□□ -0.45
USP27X-AS1-201ENST00000437322 COX7A2LO14548 114 aa12.27□□□□□ -0.45
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IGHV3-53P01767 116 aa12.27□□□□□ -0.45
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SHISA2Q6UWI4 295 aa12.27□□□□□ -0.45
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DAND5Q8N907 189 aa12.26□□□□□ -0.45
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LINC01587Q99440 93 aa12.26□□□□□ -0.45
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PRM2P04554 102 aa12.26□□□□□ -0.45
USP27X-AS1-201ENST00000437322 COPS9Q8WXC6 57 aa12.26□□□□□ -0.45
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MEIG1Q5JSS6 88 aa12.25□□□□□ -0.45
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa12.25□□□□□ -0.45
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C1orf158Q8N1D5 194 aa12.24□□□□□ -0.45
USP27X-AS1-201ENST00000437322 HERVK_113P63121 156 aa12.23□□□□□ -0.45
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa12.23□□□□□ -0.45
USP27X-AS1-201ENST00000437322 Q9H8V8 135 aa12.23□□□□□ -0.45
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RS1O15537 224 aa12.22□□□□□ -0.45
USP27X-AS1-201ENST00000437322 WIPF1O43516 503 aa12.22□□□□□ -0.45
USP27X-AS1-201ENST00000437322 COX6A2Q02221 97 aa12.22□□□□□ -0.45
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C11orf72Q8NBR9 251 aa12.22□□□□□ -0.45
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CHCHD5Q9BSY4 110 aa12.22□□□□□ -0.45
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PPDPFQ9H3Y8 114 aa12.22□□□□□ -0.45
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa12.22□□□□□ -0.45
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRACP01848 142 aa12.22□□□□□ -0.45
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LINC00242Q5T6M2 205 aa12.21□□□□□ -0.45
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa12.21□□□□□ -0.45
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SDIM1Q6ZPB5 146 aa12.2□□□□□ -0.46
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LINC00643Q86TS7 51 aa12.2□□□□□ -0.46
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TMEM126AQ9H061 195 aa12.2□□□□□ -0.46
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NACAE9PAV3 2078 aa12.2□□□□□ -0.46
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa12.19□□□□□ -0.46
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SMIM20Q8N5G0 67 aa12.19□□□□□ -0.46
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SMIM1B2RUZ4 78 aa12.18□□□□□ -0.46
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
USP27X-AS1-201ENST00000437322 OXLD1Q5BKU9 147 aa12.18□□□□□ -0.46
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FAM222AQ5U5X8 452 aa12.18□□□□□ -0.46
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa12.18□□□□□ -0.46
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SMCR5Q8TEV8 140 aa12.17□□□□□ -0.46
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa12.16□□□□□ -0.46
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa12.16□□□□□ -0.46
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa12.16□□□□□ -0.46
USP27X-AS1-201ENST00000437322 HERV-K104P63124 156 aa12.16□□□□□ -0.46
USP27X-AS1-201ENST00000437322 BAALC-AS2P0C853 105 aa12.15□□□□□ -0.46
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C22orf24Q9Y442 160 aa12.15□□□□□ -0.46
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DNHD1Q96M86 4753 aa12.15□□□□□ -0.46
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CMYA5Q8N3K9 4069 aa12.15□□□□□ -0.46
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ATP5G1P05496 136 aa12.14□□□□□ -0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 F5H768 121 aa12.13□□□□□ -0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CXCL5P42830 114 aa12.13□□□□□ -0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 A0A0U1RRA0 63 aa12.13□□□□□ -0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IL17DQ8TAD2 202 aa12.13□□□□□ -0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LINC00694P0DN24 101 aa12.12□□□□□ -0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 INAFM2P0DMQ5 153 aa12.12□□□□□ -0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C5orf38Q86SI9 138 aa12.12□□□□□ -0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FAM218AQ96MZ4 157 aa12.11□□□□□ -0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa12.11□□□□□ -0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KRTAP10-11P60412 298 aa12.11□□□□□ -0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C3orf22Q8N5N4 141 aa12.11□□□□□ -0.47
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C16orf74Q96GX8 76 aa12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms