RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 K7EP34 96 aa18.62■□□□□ 0.57
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HOXD8-201ENST00000313173 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
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HOXD8-201ENST00000313173 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa18.56■□□□□ 0.56
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HOXD8-201ENST00000313173 K7EIL1 84 aa18.44■□□□□ 0.54
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HOXD8-201ENST00000313173 DNHD1Q96M86 4753 aa18.39■□□□□ 0.53
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HOXD8-201ENST00000313173 XCL1P47992 114 aa18.37■□□□□ 0.53
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HOXD8-201ENST00000313173 C5orf38Q86SI9 138 aa18.37■□□□□ 0.53
HOXD8-201ENST00000313173 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa18.37■□□□□ 0.53
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HOXD8-201ENST00000313173 PRSS2P07478 247 aa18.36■□□□□ 0.53
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HOXD8-201ENST00000313173 TSPAN13O95857 204 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD8-201ENST00000313173 PRO1854Q9UHT4 67 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD8-201ENST00000313173 MEIG1Q5JSS6 88 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD8-201ENST00000313173 CD164L2Q6UWJ8 174 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD8-201ENST00000313173 MRAPQ8TCY5 172 aa18.31■□□□□ 0.52
HOXD8-201ENST00000313173 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
HOXD8-201ENST00000313173 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
HOXD8-201ENST00000313173 DAND5Q8N907 189 aa18.29■□□□□ 0.52
HOXD8-201ENST00000313173 NPC2P61916 151 aa18.28■□□□□ 0.52
HOXD8-201ENST00000313173 F8W1H4 67 aa18.27■□□□□ 0.52
HOXD8-201ENST00000313173 PRR34Q9NV39 138 aa18.27■□□□□ 0.51
HOXD8-201ENST00000313173 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXD8-201ENST00000313173 SFTA2Q6UW10 78 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXD8-201ENST00000313173 LINC00308Q8TCZ7 52 aa18.25■□□□□ 0.51
HOXD8-201ENST00000313173 A0A0U1RRA0 63 aa18.25■□□□□ 0.51
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