RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299259.10

COPS2-201, Transcript of COP9 signalosome subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene COPS2, Length 2,036 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2-201ENST00000299259 CLPSL2Q6UWE3 100 aa7.22□□□□□ -1.25
COPS2-201ENST00000299259 HIST1H4GQ99525 98 aa7.22□□□□□ -1.25
COPS2-201ENST00000299259 TRAV10A0A0B4J240 114 aa7.22□□□□□ -1.25
COPS2-201ENST00000299259 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.22□□□□□ -1.25
COPS2-201ENST00000299259 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7.22□□□□□ -1.25
COPS2-201ENST00000299259 ZFAND6Q6FIF0 208 aa7.22□□□□□ -1.25
COPS2-201ENST00000299259 LYPD5Q6UWN5 251 aa7.22□□□□□ -1.25
COPS2-201ENST00000299259 CEND1Q8N111 149 aa7.22□□□□□ -1.25
COPS2-201ENST00000299259 Q8N3U1 123 aa7.22□□□□□ -1.25
COPS2-201ENST00000299259 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.22□□□□□ -1.25
COPS2-201ENST00000299259 A6NDN8 102 aa7.21□□□□□ -1.26
COPS2-201ENST00000299259 ANGP03950 147 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
COPS2-201ENST00000299259 C10orf126Q8N4M7 172 aa7.21□□□□□ -1.26
COPS2-201ENST00000299259 FXYD2P54710 66 aa7.2□□□□□ -1.26
COPS2-201ENST00000299259 SS18Q15532 418 aa7.2□□□□□ -1.26
COPS2-201ENST00000299259 LINC00269Q8N2A0 174 aa7.2□□□□□ -1.26
COPS2-201ENST00000299259 TM2D2Q9BX73 214 aa7.2□□□□□ -1.26
COPS2-201ENST00000299259 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
COPS2-201ENST00000299259 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa7.2□□□□□ -1.26
COPS2-201ENST00000299259 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.2□□□□□ -1.26
COPS2-201ENST00000299259 B9D2Q9BPU9 175 aa7.2□□□□□ -1.26
COPS2-201ENST00000299259 A0A0J9YXY3 114 aa7.19□□□□□ -1.26
COPS2-201ENST00000299259 NDUFA1O15239 70 aa7.19□□□□□ -1.26
COPS2-201ENST00000299259 CCL25O15444 150 aa7.19□□□□□ -1.26
COPS2-201ENST00000299259 PTTG1IPP53801 180 aa7.19□□□□□ -1.26
COPS2-201ENST00000299259 REG3AQ06141 175 aa7.19□□□□□ -1.26
COPS2-201ENST00000299259 TMEM238C9JI98 176 aa7.18□□□□□ -1.26
COPS2-201ENST00000299259 K7EP13 123 aa7.18□□□□□ -1.26
COPS2-201ENST00000299259 XCL1P47992 114 aa7.18□□□□□ -1.26
COPS2-201ENST00000299259 A0A087WZ39 114 aa7.18□□□□□ -1.26
COPS2-201ENST00000299259 WFDC10BQ8IUB3 73 aa7.18□□□□□ -1.26
COPS2-201ENST00000299259 C15orf53Q8NAA6 179 aa7.18□□□□□ -1.26
COPS2-201ENST00000299259 TAX1BP3O14907 124 aa7.17□□□□□ -1.26
COPS2-201ENST00000299259 Q6ZVH6 145 aa7.17□□□□□ -1.26
COPS2-201ENST00000299259 C5orf38Q86SI9 138 aa7.17□□□□□ -1.26
COPS2-201ENST00000299259 Q9H8V8 135 aa7.17□□□□□ -1.26
COPS2-201ENST00000299259 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
COPS2-201ENST00000299259 COX11Q9Y6N1 276 aa7.17□□□□□ -1.26
COPS2-201ENST00000299259 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.16□□□□□ -1.26
COPS2-201ENST00000299259 A6NJY4 79 aa7.16□□□□□ -1.26
COPS2-201ENST00000299259 IGHV3-30P01768 117 aa7.16□□□□□ -1.26
COPS2-201ENST00000299259 IGHV3-33P01772 117 aa7.16□□□□□ -1.26
COPS2-201ENST00000299259 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa7.16□□□□□ -1.26
COPS2-201ENST00000299259 ESRGQ1W209 222 aa7.16□□□□□ -1.26
COPS2-201ENST00000299259 COX7B2Q8TF08 81 aa7.16□□□□□ -1.26
COPS2-201ENST00000299259 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
COPS2-201ENST00000299259 KLK12Q9UKR0 248 aa7.16□□□□□ -1.26
COPS2-201ENST00000299259 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa7.15□□□□□ -1.26
COPS2-201ENST00000299259 K7ERJ3 54 aa7.15□□□□□ -1.26
COPS2-201ENST00000299259 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.15□□□□□ -1.26
COPS2-201ENST00000299259 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
COPS2-201ENST00000299259 LITAFQ99732 161 aa7.15□□□□□ -1.26
COPS2-201ENST00000299259 PRR34Q9NV39 138 aa7.15□□□□□ -1.26
COPS2-201ENST00000299259 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.15□□□□□ -1.26
COPS2-201ENST00000299259 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
COPS2-201ENST00000299259 COL7A1Q02388 2944 aa7.15□□□□□ -1.27
COPS2-201ENST00000299259 TIMM17BO60830 172 aa7.15□□□□□ -1.27
COPS2-201ENST00000299259 CRPP02741 224 aa7.15□□□□□ -1.27
COPS2-201ENST00000299259 COX7A2LO14548 114 aa7.14□□□□□ -1.27
COPS2-201ENST00000299259 SMIM13P0DJ93 91 aa7.14□□□□□ -1.27
COPS2-201ENST00000299259 HERV-K104P63124 156 aa7.14□□□□□ -1.27
COPS2-201ENST00000299259 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.14□□□□□ -1.27
COPS2-201ENST00000299259 RAB37Q96AX2 223 aa7.13□□□□□ -1.27
COPS2-201ENST00000299259 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.13□□□□□ -1.27
COPS2-201ENST00000299259 SPANXCQ9NY87 97 aa7.13□□□□□ -1.27
COPS2-201ENST00000299259 A0A1B0GWB2 263 aa7.13□□□□□ -1.27
COPS2-201ENST00000299259 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
COPS2-201ENST00000299259 MIAQ16674 131 aa7.13□□□□□ -1.27
COPS2-201ENST00000299259 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa7.13□□□□□ -1.27
COPS2-201ENST00000299259 FOXI1Q12951 378 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS2-201ENST00000299259 LINC01556Q5JQF7 62 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS2-201ENST00000299259 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS2-201ENST00000299259 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS2-201ENST00000299259 ENHOQ6UWT2 76 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS2-201ENST00000299259 UBE2WQ96B02 151 aa7.12□□□□□ -1.27
COPS2-201ENST00000299259 C9orf118A6NHY6 69 aa7.11□□□□□ -1.27
COPS2-201ENST00000299259 IGLL5B9A064 214 aa7.11□□□□□ -1.27
COPS2-201ENST00000299259 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
COPS2-201ENST00000299259 MALP21145 153 aa7.11□□□□□ -1.27
COPS2-201ENST00000299259 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
COPS2-201ENST00000299259 SFTA2Q6UW10 78 aa7.11□□□□□ -1.27
COPS2-201ENST00000299259 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa7.11□□□□□ -1.27
COPS2-201ENST00000299259 GAGE12HA6NDE8 117 aa7.11□□□□□ -1.27
COPS2-201ENST00000299259 PRSS2P07478 247 aa7.11□□□□□ -1.27
COPS2-201ENST00000299259 Q8IZM0 81 aa7.11□□□□□ -1.27
COPS2-201ENST00000299259 STAB2Q8WWQ8 2551 aa7.11□□□□□ -1.27
COPS2-201ENST00000299259 DNAH10OSP0CZ25 163 aa7.1□□□□□ -1.27
COPS2-201ENST00000299259 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.1□□□□□ -1.27
COPS2-201ENST00000299259 A4D1N5 150 aa7.1□□□□□ -1.27
COPS2-201ENST00000299259 H3BUT2 72 aa7.1□□□□□ -1.27
COPS2-201ENST00000299259 APOMO95445 188 aa7.1□□□□□ -1.27
COPS2-201ENST00000299259 CCL18P55774 89 aa7.1□□□□□ -1.27
COPS2-201ENST00000299259 DAND5Q8N907 189 aa7.1□□□□□ -1.27
COPS2-201ENST00000299259 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
COPS2-201ENST00000299259 LINC00588Q9Y4M8 146 aa7.1□□□□□ -1.27
COPS2-201ENST00000299259 IFITM1P13164 125 aa7.09□□□□□ -1.27
COPS2-201ENST00000299259 NPC2P61916 151 aa7.09□□□□□ -1.27
COPS2-201ENST00000299259 VAMP3Q15836 100 aa7.09□□□□□ -1.27
COPS2-201ENST00000299259 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.09□□□□□ -1.27
COPS2-201ENST00000299259 A0A0U1RRA0 63 aa7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.4 ms