RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa4.04□□□□□ -1.76
LMO3-201ENST00000261169 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa4.04□□□□□ -1.76
LMO3-201ENST00000261169 NDUFA1O15239 70 aa4.04□□□□□ -1.76
LMO3-201ENST00000261169 CDK2AP2O75956 126 aa4.04□□□□□ -1.76
LMO3-201ENST00000261169 INSL3P51460 131 aa4.04□□□□□ -1.76
LMO3-201ENST00000261169 MIAQ16674 131 aa4.04□□□□□ -1.76
LMO3-201ENST00000261169 TM2D2Q9BX73 214 aa4.04□□□□□ -1.76
LMO3-201ENST00000261169 U3KQK5 164 aa4.04□□□□□ -1.76
LMO3-201ENST00000261169 KALRNO60229 2985 aa4.04□□□□□ -1.76
LMO3-201ENST00000261169 RBX1P62877 108 aa4.04□□□□□ -1.76
LMO3-201ENST00000261169 RPL32P62910 135 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
LMO3-201ENST00000261169 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
LMO3-201ENST00000261169 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa4.04□□□□□ -1.76
LMO3-201ENST00000261169 G3V4G9 280 aa4.04□□□□□ -1.76
LMO3-201ENST00000261169 POM121L12Q8N7R1 296 aa4.04□□□□□ -1.76
LMO3-201ENST00000261169 A0A096LNJ9 63 aa4.03□□□□□ -1.76
LMO3-201ENST00000261169 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa4.03□□□□□ -1.76
LMO3-201ENST00000261169 TMEM223A0PJW6 202 aa4.03□□□□□ -1.76
LMO3-201ENST00000261169 TRIAP1O43715 76 aa4.03□□□□□ -1.76
LMO3-201ENST00000261169 MT-ATP8P03928 68 aa4.03□□□□□ -1.76
LMO3-201ENST00000261169 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
LMO3-201ENST00000261169 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
LMO3-201ENST00000261169 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
LMO3-201ENST00000261169 H0YGX0 51 aa4.03□□□□□ -1.76
LMO3-201ENST00000261169 C11orf45Q8TAV5 145 aa4.03□□□□□ -1.76
LMO3-201ENST00000261169 LINC00308Q8TCZ7 52 aa4.03□□□□□ -1.76
LMO3-201ENST00000261169 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa4.02□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 A0A1B0GX51 115 aa4.02□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa4.02□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 RMI2Q96E14 147 aa4.02□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 ODF3Q96PU9 254 aa4.02□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 COL12A1Q99715 3063 aa4.02□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 SCXQ7RTU7 201 aa4.02□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 HIGD2AQ9BW72 106 aa4.02□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa4.02□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 C9orf85Q96MD7 179 aa4.02□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 SPANXCQ9NY87 97 aa4.02□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 LINC00694P0DN24 101 aa4.01□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 TIRAPP58753 221 aa4.01□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 C6orf99Q4VX62 202 aa4.01□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 SMIM20Q8N5G0 67 aa4.01□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 COL6A5A8TX70 2615 aa4.01□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 USP34Q70CQ2 3546 aa4.01□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa4.01□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 Q6ZSN1 163 aa4.01□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 CNFNQ9BYD5 112 aa4.01□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 RETNQ9HD89 108 aa4.01□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 Q9UF83 564 aa4.01□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 IGIPA6NJ69 53 aa4.01□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 CLUHP3Q96NS8 147 aa4.01□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 H3BT86 120 aa4□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 NDUFS5O43920 106 aa4□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 TSPEAR-AS2P59090 65 aa4□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 PRR3P79522 188 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 DIRC1Q969H9 104 aa4□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa4□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 BAHCC1Q9P281 2608 aa4□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa4□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa4□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 IGKV2D-28P01615 120 aa4□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 NREPQ16612 68 aa4□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 SDIM1Q6ZPB5 146 aa4□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 C1orf158Q8N1D5 194 aa4□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 A0A0B4J2C4 111 aa4□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa4□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 BRI3O95415 125 aa4□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 HILS1P60008 231 aa4□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 RBM3P98179 157 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa4□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa3.99□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 RNF183Q96D59 192 aa3.99□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP3.99□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 LINC00242Q5T6M2 205 aa3.99□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 SPATA25Q9BR10 227 aa3.99□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 M0R2N4 97 aa3.99□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 COX6A2Q02221 97 aa3.99□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa3.98□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa3.98□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 FLNCQ14315 2725 aa3.98□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 PCSK5Q92824 1860 aa3.98□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 LYRM9A8MSI8 78 aa3.98□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa3.98□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 UBE2AP49459 152 aa3.98□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 UBE2D1P51668 147 aa3.98□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa3.98□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa3.98□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa3.98□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 LRCOL1A6NCL2 159 aa3.97□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 COX7BP24311 80 aa3.97□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 CXCL5P42830 114 aa3.97□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 Q6ZQY7 126 aa3.97□□□□□ -1.77
LMO3-201ENST00000261169 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.3 ms