RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 GAGE2AQ6NT46 116 aa9.86□□□□□ -0.83
NISCH-212ENST00000488380 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
NISCH-212ENST00000488380 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
NISCH-212ENST00000488380 TEX15Q9BXT5 2789 aa9.86□□□□□ -0.83
NISCH-212ENST00000488380 H3BUA1 57 aa9.86□□□□□ -0.83
NISCH-212ENST00000488380 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
NISCH-212ENST00000488380 SPINK13Q1W4C9 94 aa9.86□□□□□ -0.83
NISCH-212ENST00000488380 C2CD3Q4AC94 2353 aa9.86□□□□□ -0.83
NISCH-212ENST00000488380 USP24Q9UPU5 2620 aa9.86□□□□□ -0.83
NISCH-212ENST00000488380 B4DSR2 109 aa9.85□□□□□ -0.83
NISCH-212ENST00000488380 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
NISCH-212ENST00000488380 PROK1P58294 105 aa9.85□□□□□ -0.83
NISCH-212ENST00000488380 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa9.85□□□□□ -0.83
NISCH-212ENST00000488380 KNCNA6PVL3 124 aa9.85□□□□□ -0.83
NISCH-212ENST00000488380 BAALC-AS2P0C853 105 aa9.85□□□□□ -0.83
NISCH-212ENST00000488380 DCANP1Q8TF63 244 aa9.85□□□□□ -0.83
NISCH-212ENST00000488380 NOTCH3Q9UM47 2321 aa9.84□□□□□ -0.83
NISCH-212ENST00000488380 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
NISCH-212ENST00000488380 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
NISCH-212ENST00000488380 PSMB8P28062 276 aa9.84□□□□□ -0.83
NISCH-212ENST00000488380 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
NISCH-212ENST00000488380 LINC00526Q96FQ7 95 aa9.84□□□□□ -0.83
NISCH-212ENST00000488380 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
NISCH-212ENST00000488380 J3KT08 172 aa9.83□□□□□ -0.84
NISCH-212ENST00000488380 C9orf85Q96MD7 179 aa9.83□□□□□ -0.84
NISCH-212ENST00000488380 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa9.83□□□□□ -0.84
NISCH-212ENST00000488380 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa9.83□□□□□ -0.84
NISCH-212ENST00000488380 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa9.82□□□□□ -0.84
NISCH-212ENST00000488380 hADV29S1A0JD25 119 aa9.82□□□□□ -0.84
NISCH-212ENST00000488380 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa9.82□□□□□ -0.84
NISCH-212ENST00000488380 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa9.82□□□□□ -0.84
NISCH-212ENST00000488380 TLN2Q9Y4G6 2542 aa9.82□□□□□ -0.84
NISCH-212ENST00000488380 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa9.81□□□□□ -0.84
NISCH-212ENST00000488380 COX7A2LO14548 114 aa9.81□□□□□ -0.84
NISCH-212ENST00000488380 C5orf47Q569G3 176 aa9.81□□□□□ -0.84
NISCH-212ENST00000488380 Q9UF83 564 aa9.81□□□□□ -0.84
NISCH-212ENST00000488380 Q8N2B8 174 aa9.81□□□□□ -0.84
NISCH-212ENST00000488380 Q9H8V8 135 aa9.81□□□□□ -0.84
NISCH-212ENST00000488380 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa9.8□□□□□ -0.84
NISCH-212ENST00000488380 COX7CP15954 63 aa9.8□□□□□ -0.84
NISCH-212ENST00000488380 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
NISCH-212ENST00000488380 SYNJ2BPP57105 145 aa9.8□□□□□ -0.84
NISCH-212ENST00000488380 TIRAPP58753 221 aa9.8□□□□□ -0.84
NISCH-212ENST00000488380 LINC00308Q8TCZ7 52 aa9.8□□□□□ -0.84
NISCH-212ENST00000488380 Q9HAA7 133 aa9.8□□□□□ -0.84
NISCH-212ENST00000488380 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa9.8□□□□□ -0.84
NISCH-212ENST00000488380 MYO9AB2RTY4 2548 aa9.8□□□□□ -0.84
NISCH-212ENST00000488380 A0A096LNT2 108 aa9.79□□□□□ -0.84
NISCH-212ENST00000488380 SMIM9A6NGZ8 99 aa9.79□□□□□ -0.84
NISCH-212ENST00000488380 FAM104AQ969W3 186 aa9.79□□□□□ -0.84
NISCH-212ENST00000488380 AKAP9Q99996 3911 aa9.79□□□□□ -0.84
NISCH-212ENST00000488380 SDIM1Q6ZPB5 146 aa9.79□□□□□ -0.84
NISCH-212ENST00000488380 NAV2Q8IVL1 2488 aa9.79□□□□□ -0.84
NISCH-212ENST00000488380 PRM2P04554 102 aa9.79□□□□□ -0.84
NISCH-212ENST00000488380 K7EMT4 169 aa9.78□□□□□ -0.84
NISCH-212ENST00000488380 C18orf65Q6ZTR6 163 aa9.78□□□□□ -0.84
NISCH-212ENST00000488380 LINC01356Q8N9X3 169 aa9.78□□□□□ -0.84
NISCH-212ENST00000488380 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
NISCH-212ENST00000488380 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP10-9P60411 292 aa9.77□□□□□ -0.84
NISCH-212ENST00000488380 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa9.77□□□□□ -0.85
NISCH-212ENST00000488380 ATP5G1P05496 136 aa9.77□□□□□ -0.85
NISCH-212ENST00000488380 DEFB136Q30KP8 78 aa9.77□□□□□ -0.85
NISCH-212ENST00000488380 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa9.77□□□□□ -0.85
NISCH-212ENST00000488380 PEMTQ9UBM1 199 aa9.77□□□□□ -0.85
NISCH-212ENST00000488380 TRACP01848 142 aa9.77□□□□□ -0.85
NISCH-212ENST00000488380 NF1P21359 2839 aa9.76□□□□□ -0.85
NISCH-212ENST00000488380 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
NISCH-212ENST00000488380 LINC00467Q9BRT7 94 aa9.76□□□□□ -0.85
NISCH-212ENST00000488380 A0A1B0GX51 115 aa9.76□□□□□ -0.85
NISCH-212ENST00000488380 PRIMA1Q86XR5 153 aa9.76□□□□□ -0.85
NISCH-212ENST00000488380 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa9.76□□□□□ -0.85
NISCH-212ENST00000488380 SONP18583 2426 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
NISCH-212ENST00000488380 CR1P17927 2039 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-212ENST00000488380 NDUFA1O15239 70 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-212ENST00000488380 TIMM17BO60830 172 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-212ENST00000488380 DNAL4O96015 105 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-212ENST00000488380 INAFM2P0DMQ5 153 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-212ENST00000488380 OR13C6PQ8NH95 151 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-212ENST00000488380 EPG5Q9HCE0 2579 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-212ENST00000488380 ATOX1O00244 68 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-212ENST00000488380 FAM218AQ96MZ4 157 aa9.75□□□□□ -0.85
NISCH-212ENST00000488380 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
NISCH-212ENST00000488380 K7EQG2 157 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-212ENST00000488380 C5orf38Q86SI9 138 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-212ENST00000488380 CXCL5P42830 114 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-212ENST00000488380 COX6A2Q02221 97 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-212ENST00000488380 ZNF702PQ9H963 129 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-212ENST00000488380 CHD6Q8TD26 2715 aa9.74□□□□□ -0.85
NISCH-212ENST00000488380 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-212ENST00000488380 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-212ENST00000488380 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-212ENST00000488380 CHCHD7Q9BUK0 85 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-212ENST00000488380 CYSTM1Q9H1C7 97 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-212ENST00000488380 APCP25054 2843 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-212ENST00000488380 SLURP1P55000 103 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-212ENST00000488380 Q6ZSN1 163 aa9.73□□□□□ -0.85
NISCH-212ENST00000488380 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP9.73□□□□□ -0.852e-6■□□□□ 11.3
NISCH-212ENST00000488380 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
NISCH-212ENST00000488380 RBMY1CP0DJD4 496 aa9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.5 ms