RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 CYB5AP00167 134 aa1.32□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 SEC11AP67812 179 aa1.32□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP1.32□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa1.32□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 COX7B2Q8TF08 81 aa1.32□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 TSLPQ969D9 159 aa1.32□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 RABAC1Q9UI14 185 aa1.32□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 ERVK-7P63135 1459 aa1.31□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 FAUP35544 74 aaKnown RBP1.31□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 TRGV9Q99603 122 aa1.31□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 PI4KAP42356 2102 aa1.31□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 PLIN4Q96Q06 1357 aa1.31□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 CCDC141Q6ZP82 1450 aa1.31□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 SHANK2Q9UPX8 1470 aa1.31□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 DNMBPQ6XZF7 1577 aa1.3□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa1.3□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 SERP2Q8N6R1 65 aa1.3□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM213BQ8TBF2 198 aa1.3□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 LINC00474Q9P2X8 69 aa1.3□□□□□ -2.2
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RABGGTB-205ENST00000462042 CACFD1Q9UGQ2 172 aa1.3□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 TOP2BQ02880 1626 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 KIF14Q15058 1648 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 NMBP08949 121 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 SPINK9Q5DT21 86 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 C10orf128Q5T292 105 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 C20orf78Q9BR46 151 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 MANBALQ9NQG1 85 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 FANCAO15360 1455 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 ATP10BO94823 1461 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 MLH3Q9UHC1 1453 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF462Q96JM2 2506 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 LRRC37A3O60309 1634 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 MYO3AQ8NEV4 1616 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 DOCK11Q5JSL3 2073 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 IGLC7A0M8Q6 106 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 APOC3P02656 99 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 COX6CP09669 75 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 TRAPPC2P0DI81 140 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 TRAPPC2BP0DI82 140 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM74A4Q5TZK3 123 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF720Q7Z2F6 126 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 PRO1854Q9UHT4 67 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 CCDC88BA6NC98 1476 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 UNC13BO14795 1591 aa1.28□□□□□ -2.2
RABGGTB-205ENST00000462042 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 UBE2D3P61077 147 aa1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 UBE2D2P62837 147 aa1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 ADIRFQ15847 76 aa1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 TDRG1Q3Y452 100 aa1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 ALKAL2Q6UX46 152 aa1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 UBR1Q8IWV7 1749 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 DIP2BQ9P265 1576 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 A0A0D9SG42 100 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF137PP52743 207 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 EDDM3BP56851 147 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 SMIM11AP58511 58 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 VMO1Q7Z5L0 202 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 Q96NJ1 140 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 ST20Q9HBF5 79 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 DYNLRB1Q9NP97 96 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 LENEPQ9Y5L5 61 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 SPCS1Q9Y6A9 102 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 MYOM1P52179 1685 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 PTPN23Q9H3S7 1636 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 BTAF1O14981 1849 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 TRAV22A0A0B4J277 110 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 H7BZZ5 65 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 FXYD6P3P58550 94 aa1.25□□□□□ -2.21
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RABGGTB-205ENST00000462042 V9GYV3 84 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 LTN1O94822 1766 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 SCN11AQ9UI33 1791 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 IQSEC2Q5JU85 1478 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 NLRP1Q9C000 1473 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 CLIP1P30622 1438 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 RGPD5Q99666 1765 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 COL4A6Q14031 1691 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 A0A0G2JND7 137 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 BCE1O60756 84 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 PPP1R17O96001 155 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 PMCHL1Q16048 86 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 Q5VV11 94 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-205ENST00000462042 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa1.24□□□□□ -2.21
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