RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM231CP0DMU5 169 aa19.12■□□□□ 0.65
CAPNS1-201ENST00000246533 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
CAPNS1-201ENST00000246533 I3L3M4 83 aa19.11■□□□□ 0.65
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF56Q15929 161 aa19.11■□□□□ 0.65
CAPNS1-201ENST00000246533 C20orf203Q8NBC4 194 aa19.11■□□□□ 0.65
CAPNS1-201ENST00000246533 MRAPQ8TCY5 172 aa19.11■□□□□ 0.65
CAPNS1-201ENST00000246533 EDA2RQ9HAV5 297 aa19.11■□□□□ 0.65
CAPNS1-201ENST00000246533 SPINK8P0C7L1 97 aa19.1■□□□□ 0.65
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF688P0C7X2 276 aa19.1■□□□□ 0.65
CAPNS1-201ENST00000246533 CARD19Q96LW7 228 aa19.1■□□□□ 0.65
CAPNS1-201ENST00000246533 DNAH9Q9NYC9 4486 aa19.09■□□□□ 0.65
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CAPNS1-201ENST00000246533 FAM74A4Q5TZK3 123 aa19.08■□□□□ 0.64
CAPNS1-201ENST00000246533 ERG28Q9UKR5 140 aa19.08■□□□□ 0.64
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
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CAPNS1-201ENST00000246533 SLC25A20O43772 301 aa19.03■□□□□ 0.64
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CAPNS1-201ENST00000246533 MUSTN1Q8IVN3 82 aa19■□□□□ 0.63
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CAPNS1-201ENST00000246533 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa18.98■□□□□ 0.63
CAPNS1-201ENST00000246533 C19orf73Q9NVV2 129 aa18.98■□□□□ 0.63
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAV25A0A0B4J276 109 aa18.98■□□□□ 0.63
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CAPNS1-201ENST00000246533 C9JAW5 83 aa18.96■□□□□ 0.63
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CAPNS1-201ENST00000246533 SPANXA1Q9NS26 97 aa18.91■□□□□ 0.62
CAPNS1-201ENST00000246533 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa18.9■□□□□ 0.62
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CAPNS1-201ENST00000246533 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa18.88■□□□□ 0.61
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CAPNS1-201ENST00000246533 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
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CAPNS1-201ENST00000246533 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa18.86■□□□□ 0.61
CAPNS1-201ENST00000246533 B9D2Q9BPU9 175 aa18.86■□□□□ 0.61
CAPNS1-201ENST00000246533 MAP6D1Q9H9H5 199 aa18.86■□□□□ 0.61
CAPNS1-201ENST00000246533 MIAQ16674 131 aa18.85■□□□□ 0.61
CAPNS1-201ENST00000246533 IFITM1P13164 125 aa18.84■□□□□ 0.61
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CAPNS1-201ENST00000246533 DEFB131AP59861 70 aa18.84■□□□□ 0.61
CAPNS1-201ENST00000246533 NDUFA12Q9UI09 145 aa18.84■□□□□ 0.61
CAPNS1-201ENST00000246533 A8MZ25 164 aa18.83■□□□□ 0.6
CAPNS1-201ENST00000246533 H3BT86 120 aa18.83■□□□□ 0.6
CAPNS1-201ENST00000246533 Q6Q795 121 aa18.83■□□□□ 0.6
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM104AQ969W3 186 aa18.83■□□□□ 0.6
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIAP1O43715 76 aa18.82■□□□□ 0.6
CAPNS1-201ENST00000246533 SNCGO76070 127 aa18.82■□□□□ 0.6
CAPNS1-201ENST00000246533 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
CAPNS1-201ENST00000246533 ICOSQ9Y6W8 199 aa18.82■□□□□ 0.6
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