RNA–Protein interactions for RNA: YLR117C

CLF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene CLF1, Length 2,064 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CLF1	YLR117C	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	DGR2	P32330	852 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	SRP101	P32916	621 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	DOM34	P33309	386 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	NAT2	P37293	288 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	YPK3	P38070	525 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	SLX1	P38324	304 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	TSC10	P38342	320 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	AKR1	P39010	764 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	ZRG8	P40021	1076 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	NMA2	P53204	395 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	CDA1	Q06702	301 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	ACM1	Q08981	209 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	ICL2	Q12031	575 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	YRM1	Q12340	786 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	MER1	P16523	270 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	RRT12	P25381	491 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	PEX3	P28795	441 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	TRM2	P33753	639 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	YHL050C	P38721	697 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	DMA1	P38823	416 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	RCY1	P39531	840 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	SEO1	P39709	593 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	JLP2	P40206	208 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	YJL070C	P40361	888 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	PCI8	P40512	444 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	DIE2	P50076	525 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	RSC4	Q02206	625 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	LAM6	Q08001	693 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	SLM3	Q12093	417 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	BMT6	Q12291	365 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	FMP16	Q12497	93 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	ATG11	Q12527	1178 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	URA3	P03962	267 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	PBS2	P08018	668 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	MRPL33	P20084	86 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	HXT2	P23585	541 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	NPP1	P25353	742 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	HEM3	P28789	327 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	XRS2	P33301	854 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	NIC96	P34077	839 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	YKL050C	P35736	922 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	TDP1	P38319	544 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	SPC97	P38863	823 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	CST6	P40535	587 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	MMM1	P41800	426 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	FET5	P43561	622 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	ASE1	P50275	885 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	YPL034W	Q03083	165 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	NSE5	Q03718	556 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	YMR018W	Q04364	514 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	PEX10	Q05568	337 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	YPR202W	Q08993	238 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	ENT1	Q12518	454 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	NUC1	P08466	329 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	CMK2	P22517	447 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	PKC1	P24583	1151 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	YBL010C	P32788	280 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	TAF14	P35189	244 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	GEF1	P37020	779 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
CLF1	YLR117C	ERG7	P38604	731 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	STL1	P39932	569 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	MNT3	P40549	630 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	YGR210C	P42942	411 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	NUP84	P52891	726 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	CGR1	P53188	120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	YGR021W	P53212	290 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	ZDS2	P54786	942 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	MUK1	Q02866	612 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	DLT1	Q04216	342 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLF1	YLR117C	EST2	Q06163	884 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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