RNA–Protein interactions for RNA: YFR049W

YMR31, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene YMR31, Length 372 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR31	YFR049W	RFX1	P48743	811 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	RSC1	P53236	928 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	YAP1802	P53309	568 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	FCP1	Q03254	732 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	2.93	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	MFB1	Q04922	465 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	HOF1	Q05080	669 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	ADY4	Q05955	493 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	THI22	Q06490	572 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	GRC3	Q07845	632 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	SUL2	Q12325	893 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	2.93	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	YOR111W	Q99210	232 aa		2.93	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	HOM3	P10869	527 aa		2.92	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	VPS33	P20795	691 aa		2.92	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	YCR015C	P25616	317 aa		2.92	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	DCG1	P32460	244 aa		2.92	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	CBF2	P32504	956 aa		2.92	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	PXA2	P34230	853 aa		2.92	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	ESL2	P36168	1195 aa		2.92	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	YIR042C	P40586	236 aa		2.92	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	AMA1	P50082	593 aa		2.92	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	MUP1	P50276	574 aa		2.92	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	FDC1	Q03034	503 aa		2.92	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	DLT1	Q04216	342 aa		2.92	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	ARP9	Q05123	467 aa		2.92	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	DFG16	Q99234	619 aa		2.92	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	MET3	P08536	511 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	TY2A-F	P0CX61	438 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	PRP28	P23394	588 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	PRE8	P23639	250 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	TY2A-C	P25383	438 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	SGF29	P25554	259 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	PEP3	P27801	918 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	2.91	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	NTH1	P32356	751 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.91	□□□□□ -1.94	RIP-Chip
YMR31	YFR049W	SWI3	P32591	825 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	DSS4	P32601	143 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	YBL029W	P38201	376 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	YBR225W	P38321	900 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	2.91	□□□□□ -1.94	not detected
YMR31	YFR049W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	CIR1	P42940	261 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	REG1	Q00816	1014 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	STP3	Q05937	343 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	2.91	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	AIM6	Q07716	390 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	ENT4	Q07872	247 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	TMA16	Q08687	178 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	TY2A-B	Q12260	438 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	SCM3	Q12334	223 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YMR31	YFR049W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	BIK1	P11709	440 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	RED1	P14291	827 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	OPI1	P21957	404 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	MRP20	P32387	263 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	BYE1	P36106	594 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	LNP1	P38878	278 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	REV7	P38927	245 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	NPR2	P39923	615 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	LRO1	P40345	661 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	BAP3	P41815	604 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	IRC6	P43615	237 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	COS12	P53053	380 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	TAM41	P53230	385 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	YPL071C	Q02864	156 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YMR31	YFR049W	ERO1	Q03103	563 aa		2.9	□□□□□ -1.95

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