RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeastyeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CYK3YDL117W CCT5P40413 562 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W HPM1P40481 377 aa5.26□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W PAC11P40960 533 aa5.26□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W RAI1P53063 387 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W ATP25Q03153 612 aa5.26□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W DUS3Q06053 668 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W GPI13Q07830 1017 aa5.26□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W FMP40Q08968 688 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W PIN2Q12057 282 aa5.26□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W HUA2Q12134 243 aa5.26□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W YLR278CQ05854 1341 aa5.26□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W LYS2P07702 1392 aa5.26□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W RPP2BP02400 110 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W MET8P15807 274 aa5.26□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W SEC1P30619 724 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W CDC12P32468 407 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W PXL1P36166 706 aa5.26□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W ECM31P38122 312 aa5.26□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W PSY2P40164 858 aa5.26□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W TMA22P47089 198 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W PSP2P50109 593 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W YGR054WP53235 642 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W YGR111WP53265 400 aa5.26□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W FPK1P53739 893 aa5.26□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W SPP1Q03012 353 aa5.26□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W BNA7Q04066 261 aa5.26□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W UFO1Q04511 668 aa5.26□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W YDL114WQ07530 308 aa5.26□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W TAH18Q12181 623 aa5.26□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W FRT1Q99332 602 aa5.26□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W YOR093CQ12275 1648 aa5.25□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W SPO14P36126 1683 aa5.25□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W MRPL33P20084 86 aa5.25□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W MSB1P21339 1137 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W SRM1P21827 482 aa5.25□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W PRR1P28708 518 aa5.25□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W SBE22P38814 852 aa5.25□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W MSS4P38994 779 aa5.25□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W CIN5P40917 295 aa5.25□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W BRO1P48582 844 aa5.25□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W NAS6P50086 228 aa5.25□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W MNT2P53059 558 aa5.25□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W YNR029CP53729 429 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W CAF120P53836 1060 aa5.25□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W ARX1Q03862 593 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W YDR179W-AQ03983 463 aa5.25□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W SND1Q04007 877 aa5.25□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W PHO92Q06390 306 aa5.25□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W GRS2Q06817 618 aa5.25□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W SKM1Q12469 655 aa5.25□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W YCL001W-BQ96VH2 84 aa5.25□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W YOR1P53049 1477 aa5.25□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W KAR2P16474 682 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W PRP4P20053 465 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W YCR101CP25607 182 aa5.25□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W SQT1P35184 431 aa5.25□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W SPT10P35208 640 aa5.25□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W GRE3P38715 327 aaKnown RBP RIP-Chip data5.25□□□□□ -1.57not detected
CYK3YDL117W PRM9P39551 298 aa5.25□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W GID8P40208 455 aa5.25□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W PDS1P40316 373 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W FYV10P40492 516 aa5.25□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W REF2P42073 533 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W UBP6P43593 499 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W LSM8P47093 109 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W TAF4P50105 388 aa5.25□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W VAC7P53950 1165 aa5.25□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W PET117Q02771 107 aa5.25□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W PDR8Q06149 701 aa5.25□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W VAC14Q06708 880 aa5.25□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W YLR001CQ07895 862 aa5.25□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W GPN2Q08726 347 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W BAG7Q12128 409 aa5.25□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W OSW2Q12202 724 aa5.25□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W LAG2Q92325 660 aa5.25□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W KRE5P22023 1365 aa5.25□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W SNA3P14359 133 aa5.24□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W AEP2P22136 580 aa5.24□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W SPS22P25380 463 aa5.24□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W MEI5P32489 222 aa5.24□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W LRG1P35688 1017 aa5.24□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W MRPL37P36532 105 aa5.24□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W GRS1P38088 690 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W PTC4P38089 393 aa5.24□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W NPT1P39683 429 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W AIM2P39721 246 aa5.24□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W YJL181WP46987 611 aa5.24□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W BBC1P47068 1157 aa5.24□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W YJR141WP47172 347 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W HSH155P49955 971 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W YKE2P52553 114 aa5.24□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W MTO1P53070 669 aa5.24□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W ZPR1P53303 486 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W NSE5Q03718 556 aa5.24□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W CSI1Q04368 295 aa5.24□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W HFD1Q04458 532 aa5.24□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W VPS54Q12071 889 aa5.24□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W TMA7Q3E764 64 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
CYK3YDL117W CHO2P05374 869 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 78.2 ms