RNA–Protein interactions for RNA: YBR273C

UBX7, Transcript of UBX (ubiquitin regulatory X) domain-containing protein, yeast

Gene UBX7, Length 1,311 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBX7	YBR273C	PEX15	Q08215	383 aa		5	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	HRT3	Q12347	344 aa		5	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	KCS1	Q12494	1050 aa		5	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	YLR278C	Q05854	1341 aa		5	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	STE6	P12866	1290 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	SNT1	P25357	1226 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	CDC20	P26309	610 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	URA10	P30402	227 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	PEX2	P32800	271 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	IXR1	P33417	597 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	SRB2	P34162	210 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	PEX5	P35056	612 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	TGL4	P36165	910 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	CTP1	P38152	299 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	YBL036C	P38197	257 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	YHR054C	P38780	354 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	RSC30	P38781	883 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	TDA11	P38854	504 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	YJL206C	P39529	758 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	STL1	P39932	569 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	PEP8	P40335	379 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	TAF1	P46677	1066 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	POL31	P46957	487 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	IML2	P47031	731 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	TAH11	P47112	604 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	RFX1	P48743	811 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	RPM2	Q02773	1202 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	HOS1	Q12214	470 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	RTP1	Q12751	981 aa		4.99	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	YAK1	P14680	807 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	TYR1	P20049	452 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	TSR4	P25040	408 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	YCR015C	P25616	317 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	RAD14	P28519	371 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	DGR2	P32330	852 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	AST1	P35183	429 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	KDX1	P36005	433 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	RIM2	P38127	377 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	TRM5	P38793	499 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	STN1	P38960	494 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	ALY2	P47029	1046 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	ZAP1	P47043	880 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	ALT1	P52893	592 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.98	□□□□□ -1.61	not detected
UBX7	YBR273C	SLD5	Q03406	294 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	YML020W	Q03722	664 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	THI21	Q08975	551 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	YPR202W	Q08993	238 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	GET4	Q12125	312 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	EMP46	Q12396	444 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	NKP1	Q12493	238 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	ATG11	Q12527	1178 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	RGS2	Q99188	309 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	IZH4	Q99393	312 aa		4.98	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	TY1A-DR4	O74302	440 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	TY1A-H	P0C2I4	478 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	ERR1	P0CX10	437 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	ERR2	P0CX11	437 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	TY1A-A	P0CX57	440 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	TY1A-PR1	P0CX58	440 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	TY1A-OR	P0CX59	440 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	TY1A-PR2	P0CX60	440 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	TY1A-DR5	P0CX65	440 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	TY1A-ER2	P0CX66	440 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	TY1A-GR3	P0CX67	440 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	TY1A-LR1	P0CX68	440 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	TY1A-MR2	P0CX69	440 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	WHI2	P12611	486 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
UBX7	YBR273C	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	SEC2	P17065	759 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	AMD2	P22580	549 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	VBA3	P25594	458 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	MSH2	P25847	964 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	TFC1	P32367	649 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	PHA2	P32452	334 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	SPR1	P32603	445 aa		4.97	□□□□□ -1.61
UBX7	YBR273C	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61

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