RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zbtb38Q3LR78 1197 aa7.57□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cdkl5Q3UTQ8 938 aa7.57□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ankrd40Q5SUE8 363 aa7.57□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hspa4Q61316 841 aa7.57□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kcna6Q61923 529 aa7.57□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ovgp1Q62010 721 aa7.57□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Drc7Q6V3W6 876 aa7.57□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Luc7l2Q7TNC4 392 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tcp11l1Q8BTG3 509 aa7.57□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Btn2a2A4QPC6 514 aa7.57□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pcdhb9E9Q5G2 828 aa7.57□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pla2g4bP0C871 782 aa7.57□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gpr182P43142 395 aa7.57□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tbx2Q60707 711 aa7.57□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Fam160b2Q80YR2 744 aa7.57□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PygbQ8CI94 843 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cd209bQ8CJ91 325 aa7.57□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kcnj14Q8JZN3 434 aa7.57□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 GptQ8QZR5 496 aa7.57□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mical1Q8VDP3 1048 aa7.57□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 BaatQ91X34 420 aa7.57□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 FAM186AQ9D9R9 1790 aa7.57□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm21680A0A0G2JGR8 267 aa7.57□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cplx2P84086 134 aa7.57□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Washc4Q3UMB9 1173 aa7.57□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 ErmnQ5EBJ4 281 aa7.57□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prdm4Q80V63 803 aa7.57□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc150Q8CDI7 1110 aa7.57□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Polr2dQ9D7M8 142 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cbx6Q9DBY5 414 aa7.57□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sipa1l3G3X9J0 1776 aa7.56□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Calcoco2A2A6M5 331 aa7.56□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Map7d2A2AG50 781 aa7.56□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hap1O35668 628 aa7.56□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Myo1aO88329 1043 aa7.56□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Dnajc2P54103 621 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Eif5P59325 429 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gabpb2P81069 414 aa7.56□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Necab1Q8BG18 352 aa7.56□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lmod1Q8BVA4 595 aa7.56□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ankk1Q8BZ25 745 aa7.56□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Alx1Q8C8B0 326 aa7.56□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Baiap2l1Q9DBJ3 514 aa7.56□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 EcsitQ9QZH6 435 aa7.56□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atp1a4Q9WV27 1032 aa7.56□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Crb1Q8VHS2 1405 aa7.56□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc191J3QQ27 883 aa7.56□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slc7a1Q09143 622 aa7.56□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lamb3Q61087 1168 aa7.56□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nlrp9aQ66X03 949 aa7.56□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ift122Q6NWV3 1182 aa7.56□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AbraQ8BUZ1 375 aa7.56□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 9230110C19RikQ8CC70 267 aa7.56□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tc2nQ91XT6 489 aa7.56□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Eaf2Q91ZD6 262 aa7.56□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trim11Q99PQ2 467 aa7.56□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Akap11E9Q777 1895 aa7.56□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Med23Q80YQ2 1367 aa7.56□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Nek1P51954 1203 aa7.55□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Arglu1Q3UL36 271 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Clca2Q8BG22 942 aa7.55□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc12Q8R344 166 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc47Q9D024 483 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Kdm3aQ6PCM1 1323 aa7.55□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rsrc2A2RTL5 376 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 UncxO08934 530 aa7.55□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ttll12Q3UDE2 639 aa7.55□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc34Q3UI66 367 aa7.55□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pex1Q5BL07 1284 aa7.55□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Usp49Q6P9L4 685 aa7.55□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Glis3Q6XP49 780 aa7.55□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Slitrk3Q810B9 980 aa7.55□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sptlc3Q8BG54 563 aa7.55□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Clic6Q8BHB9 596 aa7.55□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Iqcb1Q8BP00 598 aa7.55□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sirt2Q8VDQ8 389 aa7.55□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Smc1aQ9CU62 1233 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Suclg2Q9Z2I8 433 aa7.55□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Shank3Q4ACU6 1730 aa7.55□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ecm29Q6PDI5 1840 aa7.55□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 AfdnQ9QZQ1 1820 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm3409A0A0G2JE67 319 aa7.55□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 A0A1L1SQF0 893 aa7.55□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sdc2P43407 202 aa7.55□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Myo1bP46735 1107 aa7.55□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atp8a2P98200 1148 aa7.55□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Map9Q3TRR0 646 aa7.55□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyp7b1Q60991 507 aa7.55□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tmco3Q8BH01 678 aa7.55□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Evc2Q8K1G2 1220 aa7.55□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vps16Q920Q4 839 aa7.55□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Etnk1Q9D4V0 363 aa7.55□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 MicalclQ9D5U9 680 aa7.55□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Myh13B1AR69 1938 aa7.55□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PnnO35691 725 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cyp19a1P28649 503 aa7.54□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Foxp1P58462 705 aa7.54□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Psmb7P70195 277 aa7.54□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pla2g4fQ50L41 855 aa7.54□□□□□ -1.2
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Atp1a2Q6PIE5 1020 aa7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.5 ms