Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40■■■■□ 3.99
Sdc2P43407 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Sdc2P43407 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Sdc2P43407 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Sdc2P43407 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Sdc2P43407 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Sdc2P43407 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
Sdc2P43407 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Sdc2P43407 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
Sdc2P43407 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Sdc2P43407 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
Sdc2P43407 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Sdc2P43407 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Sdc2P43407 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Sdc2P43407 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Sdc2P43407 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Sdc2P43407 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Sdc2P43407 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Sdc2P43407 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Sdc2P43407 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Sdc2P43407 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Sdc2P43407 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Sdc2P43407 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Sdc2P43407 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Sdc2P43407 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Sdc2P43407 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Sdc2P43407 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Sdc2P43407 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Sdc2P43407 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Sdc2P43407 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Sdc2P43407 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Sdc2P43407 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Sdc2P43407 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Sdc2P43407 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
Sdc2P43407 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Sdc2P43407 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Sdc2P43407 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Sdc2P43407 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Sdc2P43407 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Sdc2P43407 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Sdc2P43407 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Sdc2P43407 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Sdc2P43407 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Sdc2P43407 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Sdc2P43407 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Sdc2P43407 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Sdc2P43407 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Sdc2P43407 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Sdc2P43407 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Sdc2P43407 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Sdc2P43407 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Sdc2P43407 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Sdc2P43407 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Sdc2P43407 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Sdc2P43407 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Sdc2P43407 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Sdc2P43407 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Sdc2P43407 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Sdc2P43407 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Sdc2P43407 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Sdc2P43407 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Sdc2P43407 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Sdc2P43407 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Sdc2P43407 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Sdc2P43407 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Sdc2P43407 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Sdc2P43407 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Sdc2P43407 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Sdc2P43407 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Sdc2P43407 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Sdc2P43407 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Sdc2P43407 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Sdc2P43407 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Sdc2P43407 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Sdc2P43407 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Sdc2P43407 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Sdc2P43407 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Sdc2P43407 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Sdc2P43407 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Sdc2P43407 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Sdc2P43407 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Sdc2P43407 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Sdc2P43407 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
Sdc2P43407 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Sdc2P43407 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Sdc2P43407 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Sdc2P43407 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Sdc2P43407 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Sdc2P43407 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Sdc2P43407 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Sdc2P43407 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Sdc2P43407 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Sdc2P43407 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Sdc2P43407 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Sdc2P43407 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Sdc2P43407 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Sdc2P43407 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Sdc2P43407 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Sdc2P43407 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Sdc2P43407 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms