Protein–RNA interactions for Protein: Q60991

Cyp7b1, 25-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp7b1Q60991 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41.51■■■■■ 4.24
Cyp7b1Q60991 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Cyp7b1Q60991 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Cyp7b1Q60991 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Cyp7b1Q60991 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Cyp7b1Q60991 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Cyp7b1Q60991 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
Cyp7b1Q60991 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Cyp7b1Q60991 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Cyp7b1Q60991 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
Cyp7b1Q60991 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Cyp7b1Q60991 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
Cyp7b1Q60991 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Cyp7b1Q60991 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Cyp7b1Q60991 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Cyp7b1Q60991 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Cyp7b1Q60991 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Cyp7b1Q60991 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Cyp7b1Q60991 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Cyp7b1Q60991 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Cyp7b1Q60991 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Cyp7b1Q60991 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Cyp7b1Q60991 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Cyp7b1Q60991 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Cyp7b1Q60991 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Cyp7b1Q60991 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Cyp7b1Q60991 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
Cyp7b1Q60991 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Cyp7b1Q60991 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cyp7b1Q60991 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Cyp7b1Q60991 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cyp7b1Q60991 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cyp7b1Q60991 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Cyp7b1Q60991 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cyp7b1Q60991 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Cyp7b1Q60991 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Cyp7b1Q60991 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cyp7b1Q60991 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Cyp7b1Q60991 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Cyp7b1Q60991 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Cyp7b1Q60991 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Cyp7b1Q60991 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Cyp7b1Q60991 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cyp7b1Q60991 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Cyp7b1Q60991 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cyp7b1Q60991 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Cyp7b1Q60991 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Cyp7b1Q60991 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cyp7b1Q60991 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cyp7b1Q60991 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cyp7b1Q60991 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Cyp7b1Q60991 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Cyp7b1Q60991 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cyp7b1Q60991 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Cyp7b1Q60991 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Cyp7b1Q60991 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cyp7b1Q60991 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cyp7b1Q60991 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cyp7b1Q60991 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Cyp7b1Q60991 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Cyp7b1Q60991 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Cyp7b1Q60991 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Cyp7b1Q60991 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Cyp7b1Q60991 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Cyp7b1Q60991 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Cyp7b1Q60991 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Cyp7b1Q60991 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Cyp7b1Q60991 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Cyp7b1Q60991 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Cyp7b1Q60991 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cyp7b1Q60991 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cyp7b1Q60991 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Cyp7b1Q60991 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Cyp7b1Q60991 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Cyp7b1Q60991 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Cyp7b1Q60991 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Cyp7b1Q60991 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Cyp7b1Q60991 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Cyp7b1Q60991 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Cyp7b1Q60991 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Cyp7b1Q60991 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Cyp7b1Q60991 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Cyp7b1Q60991 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Cyp7b1Q60991 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Cyp7b1Q60991 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Cyp7b1Q60991 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Cyp7b1Q60991 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Cyp7b1Q60991 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Cyp7b1Q60991 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Cyp7b1Q60991 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Cyp7b1Q60991 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Cyp7b1Q60991 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Cyp7b1Q60991 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Cyp7b1Q60991 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Cyp7b1Q60991 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Cyp7b1Q60991 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Cyp7b1Q60991 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Cyp7b1Q60991 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Cyp7b1Q60991 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Cyp7b1Q60991 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms