RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W TY1B-GR2Q12269 1755 aa13.74□□□□□ -0.21
PRP4YPR178W TY1B-OLQ12273 1755 aa13.74□□□□□ -0.21
PRP4YPR178W TY1B-PLQ12414 1755 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
PRP4YPR178W DNF1P32660 1571 aa13.73□□□□□ -0.21
PRP4YPR178W PRS1P32895 427 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
PRP4YPR178W NUP159P40477 1460 aa13.71□□□□□ -0.21
PRP4YPR178W GEA2P39993 1459 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
PRP4YPR178W SRB8P25648 1427 aa13.68□□□□□ -0.22
PRP4YPR178W TY1B-BRQ12193 1756 aa13.68□□□□□ -0.22
PRP4YPR178W TY1B-GR3Q12316 1755 aa13.68□□□□□ -0.22
PRP4YPR178W TY1B-ORQ92393 1755 aa13.68□□□□□ -0.22
PRP4YPR178W ESC1Q03661 1658 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
PRP4YPR178W YBT1P32386 1661 aa13.67□□□□□ -0.22
PRP4YPR178W IRC20Q06554 1556 aa13.64□□□□□ -0.23
PRP4YPR178W CDC25P04821 1589 aa13.63□□□□□ -0.23
PRP4YPR178W NOP7P53261 605 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
PRP4YPR178W MHP1P43638 1398 aa13.59□□□□□ -0.23
PRP4YPR178W TFA1P36100 482 aa13.57□□□□□ -0.24
PRP4YPR178W GCN2P15442 1659 aa13.56□□□□□ -0.24
PRP4YPR178W YLR419WQ06698 1435 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
PRP4YPR178W TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
PRP4YPR178W TY1B-ER2Q03619 1755 aa13.55□□□□□ -0.24
PRP4YPR178W TY1B-MR1Q04214 1755 aa13.55□□□□□ -0.24
PRP4YPR178W TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
PRP4YPR178W TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
PRP4YPR178W TY1B-NL1Q12112 1755 aa13.55□□□□□ -0.24
PRP4YPR178W TY1B-GR1Q12141 1755 aa13.55□□□□□ -0.24
PRP4YPR178W TY1B-BLQ12490 1755 aa13.55□□□□□ -0.24
PRP4YPR178W LEU3P08638 886 aa13.53□□□□□ -0.24
PRP4YPR178W PSD2P53037 1138 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
PRP4YPR178W GDB1Q06625 1536 aa13.53□□□□□ -0.24
PRP4YPR178W CKB1P43639 278 aa13.52□□□□□ -0.25
PRP4YPR178W PDR5P33302 1511 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
PRP4YPR178W BUD21Q08492 214 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
PRP4YPR178W BFR2Q06631 534 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
PRP4YPR178W ARO1P08566 1588 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
PRP4YPR178W MMS1Q06211 1407 aa13.47□□□□□ -0.25
PRP4YPR178W PAF1P38351 445 aa13.46□□□□□ -0.25
PRP4YPR178W NTE1Q04958 1679 aa13.4□□□□□ -0.26
PRP4YPR178W RPO21P04050 1733 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
PRP4YPR178W IQG1Q12280 1495 aa13.39□□□□□ -0.27
PRP4YPR178W MET10P39692 1035 aa13.38□□□□□ -0.27
PRP4YPR178W ORC1P54784 914 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
PRP4YPR178W PDR12Q02785 1511 aa13.36□□□□□ -0.27
PRP4YPR178W NUP157P40064 1391 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
PRP4YPR178W TY3B-IQ7LHG5 1498 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
PRP4YPR178W PDS5Q04264 1277 aa13.33□□□□□ -0.27
PRP4YPR178W YSP2Q06681 1438 aa13.33□□□□□ -0.28
PRP4YPR178W RPA190P10964 1664 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
PRP4YPR178W CFT1Q06632 1357 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
PRP4YPR178W LTE1P07866 1435 aa13.27□□□□□ -0.29
PRP4YPR178W RAV1P47104 1357 aa13.23□□□□□ -0.29
PRP4YPR178W RTC1Q08281 1341 aa13.23□□□□□ -0.29
PRP4YPR178W BUD3P25558 1636 aa13.23□□□□□ -0.29
PRP4YPR178W SCT1P32784 759 aa13.21□□□□□ -0.29
PRP4YPR178W YOR093CQ12275 1648 aa13.21□□□□□ -0.3
PRP4YPR178W SPO14P36126 1683 aa13.2□□□□□ -0.3
PRP4YPR178W RPP0P05317 312 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
PRP4YPR178W RPC31P17890 251 aa13.17□□□□□ -0.3
PRP4YPR178W TAF5P38129 798 aa13.17□□□□□ -0.3
PRP4YPR178W CDC45Q08032 650 aa13.17□□□□□ -0.3
PRP4YPR178W NST1P53935 1240 aa13.16□□□□□ -0.3
PRP4YPR178W ESL2P36168 1195 aa13.15□□□□□ -0.3
PRP4YPR178W KIP3P53086 805 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
PRP4YPR178W BNR1P40450 1375 aa13.15□□□□□ -0.3
PRP4YPR178W VPS27P40343 622 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
PRP4YPR178W IME2P32581 645 aa13.13□□□□□ -0.31
PRP4YPR178W CAB3P36076 571 aa13.12□□□□□ -0.31
PRP4YPR178W DRS2P39524 1355 aa13.1□□□□□ -0.31
PRP4YPR178W YPR148CQ06523 435 aa13.1□□□□□ -0.31
PRP4YPR178W FPR3P38911 411 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PRP4YPR178W FUN12P39730 1002 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PRP4YPR178W PDR11P40550 1411 aa13.07□□□□□ -0.32
PRP4YPR178W IOC4Q04213 475 aa13.07□□□□□ -0.32
PRP4YPR178W RVB2Q12464 471 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
PRP4YPR178W CLC1P17891 233 aa13.06□□□□□ -0.32
PRP4YPR178W OPY1P38271 328 aa13.06□□□□□ -0.32
PRP4YPR178W CHC1P22137 1653 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
PRP4YPR178W YRB30P53107 440 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
PRP4YPR178W YFR016CP43597 1233 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
PRP4YPR178W EAF7P53911 425 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
PRP4YPR178W EBP2P36049 427 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
PRP4YPR178W SPE2P21182 396 aa12.99□□□□□ -0.33
PRP4YPR178W YRF1-1P0CX20 1796 aa12.99□□□□□ -0.33
PRP4YPR178W YRF1-5P0CX21 1796 aa12.99□□□□□ -0.33
PRP4YPR178W YRF1-8P0CX22 1796 aa12.99□□□□□ -0.33
PRP4YPR178W YDL144CQ07589 356 aa12.98□□□□□ -0.33
PRP4YPR178W VMR1P38735 1592 aa12.97□□□□□ -0.33
PRP4YPR178W MET5P47169 1442 aa12.96□□□□□ -0.33
PRP4YPR178W ABP1P15891 592 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
PRP4YPR178W RTG3P38165 486 aa12.94□□□□□ -0.34
PRP4YPR178W YIR014WP40570 242 aa12.94□□□□□ -0.34
PRP4YPR178W SEC7P11075 2009 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
PRP4YPR178W IML1P47170 1584 aa12.91□□□□□ -0.34
PRP4YPR178W MTC1P47018 478 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
PRP4YPR178W SUI2P20459 304 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
PRP4YPR178W FKH1P40466 484 aa12.89□□□□□ -0.35
PRP4YPR178W DOP1Q03921 1698 aa12.87□□□□□ -0.35
PRP4YPR178W NAB6Q03735 1134 aaKnown RBP RIP-Chip data12.87□□□□□ -0.35not detected
PRP4YPR178W NUP192P47054 1683 aa12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.5 ms