RNA–Protein interactions for RNA: YHR069C

RRP4, Transcript of Exosome non-catalytic core component, yeastyeast

Gene RRP4, Length 1,080 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP4YHR069C TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
RRP4YHR069C TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
RRP4YHR069C TY1B-NL1Q12112 1755 aa9.13□□□□□ -0.95
RRP4YHR069C TY1B-GR1Q12141 1755 aa9.13□□□□□ -0.95
RRP4YHR069C TY1B-BLQ12490 1755 aa9.13□□□□□ -0.95
RRP4YHR069C VTH1P40438 1549 aa9.08□□□□□ -0.96
RRP4YHR069C VTH2P40890 1549 aa9.08□□□□□ -0.96
RRP4YHR069C TSC11P40061 1430 aa9.07□□□□□ -0.96
RRP4YHR069C MET5P47169 1442 aa9.05□□□□□ -0.96
RRP4YHR069C TRM732Q03496 1420 aa9.04□□□□□ -0.96
RRP4YHR069C NTE1Q04958 1679 aa9.03□□□□□ -0.96
RRP4YHR069C SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
RRP4YHR069C RPO21P04050 1733 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
RRP4YHR069C YRF1-1P0CX20 1796 aa9.01□□□□□ -0.97
RRP4YHR069C YRF1-5P0CX21 1796 aa9.01□□□□□ -0.97
RRP4YHR069C YRF1-8P0CX22 1796 aa9.01□□□□□ -0.97
RRP4YHR069C SNT2P53127 1403 aa8.98□□□□□ -0.97
RRP4YHR069C MLP2P40457 1679 aa8.97□□□□□ -0.97
RRP4YHR069C NUP159P40477 1460 aa8.96□□□□□ -0.97
RRP4YHR069C ULS1Q08562 1619 aa8.96□□□□□ -0.98
RRP4YHR069C YCK3P39962 524 aa8.94□□□□□ -0.98
RRP4YHR069C STH1P32597 1359 aa8.93□□□□□ -0.98
RRP4YHR069C SPT21P35209 758 aa8.92□□□□□ -0.98
RRP4YHR069C PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
RRP4YHR069C SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
RRP4YHR069C LTE1P07866 1435 aa8.87□□□□□ -0.99
RRP4YHR069C VPS15P22219 1454 aa8.86□□□□□ -0.99
RRP4YHR069C IRC20Q06554 1556 aa8.85□□□□□ -0.99
RRP4YHR069C GEA2P39993 1459 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
RRP4YHR069C SPO14P36126 1683 aa8.84□□□□□ -0.99
RRP4YHR069C MRPL32P25348 183 aa8.83□□□□□ -1
RRP4YHR069C BNI1P41832 1953 aa8.82□□□□□ -1
RRP4YHR069C PDR12Q02785 1511 aa8.82□□□□□ -1
RRP4YHR069C TAF7Q05021 590 aa8.82□□□□□ -1
RRP4YHR069C HAA1Q12753 694 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
RRP4YHR069C TY3B-GQ99315 1547 aa8.8□□□□□ -1
RRP4YHR069C GEA1P47102 1408 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
RRP4YHR069C GDB1Q06625 1536 aa8.78□□□□□ -1
RRP4YHR069C MET10P39692 1035 aa8.77□□□□□ -1.01
RRP4YHR069C YBT1P32386 1661 aa8.76□□□□□ -1.01
RRP4YHR069C RTT106P40161 455 aa8.76□□□□□ -1.01
RRP4YHR069C RIM101P33400 625 aa8.75□□□□□ -1.01
RRP4YHR069C IFH1P39520 1085 aa8.74□□□□□ -1.01
RRP4YHR069C PDR10P51533 1564 aa8.73□□□□□ -1.01
RRP4YHR069C ITT1Q04638 464 aa8.71□□□□□ -1.02
RRP4YHR069C NUP157P40064 1391 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
RRP4YHR069C NUP170P38181 1502 aa8.7□□□□□ -1.02
RRP4YHR069C YKR023WP36119 530 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
RRP4YHR069C DRS2P39524 1355 aa8.68□□□□□ -1.02
RRP4YHR069C CAT8P39113 1433 aa8.68□□□□□ -1.02
RRP4YHR069C IQG1Q12280 1495 aa8.66□□□□□ -1.02
RRP4YHR069C ARO1P08566 1588 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
RRP4YHR069C DOP1Q03921 1698 aa8.62□□□□□ -1.03
RRP4YHR069C BUD3P25558 1636 aa8.62□□□□□ -1.03
RRP4YHR069C MMS1Q06211 1407 aa8.6□□□□□ -1.03
RRP4YHR069C YSP2Q06681 1438 aa8.59□□□□□ -1.03
RRP4YHR069C SEC7P11075 2009 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
RRP4YHR069C TRM3Q07527 1436 aa8.57□□□□□ -1.04
RRP4YHR069C IKI3Q06706 1349 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
RRP4YHR069C CHC1P22137 1653 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
RRP4YHR069C DNF2Q12675 1612 aa8.55□□□□□ -1.04
RRP4YHR069C CDC27P38042 758 aa8.55□□□□□ -1.04
RRP4YHR069C HOP09932 586 aa8.52□□□□□ -1.05
RRP4YHR069C CKB1P43639 278 aa8.52□□□□□ -1.05
RRP4YHR069C SRB8P25648 1427 aa8.52□□□□□ -1.05
RRP4YHR069C OXP1P28273 1286 aa8.5□□□□□ -1.05
RRP4YHR069C TFC8Q12308 588 aa8.5□□□□□ -1.05
RRP4YHR069C SSM4P40318 1319 aa8.5□□□□□ -1.05
RRP4YHR069C DCD1P06773 312 aa8.48□□□□□ -1.05
RRP4YHR069C BNR1P40450 1375 aa8.47□□□□□ -1.05
RRP4YHR069C YOR093CQ12275 1648 aa8.43□□□□□ -1.06
RRP4YHR069C ABP1P15891 592 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RRP4YHR069C BUD21Q08492 214 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RRP4YHR069C PTP3P40048 928 aa8.36□□□□□ -1.07
RRP4YHR069C GCN2P15442 1659 aa8.36□□□□□ -1.07
RRP4YHR069C VMR1P38735 1592 aa8.35□□□□□ -1.07
RRP4YHR069C NUP188P52593 1655 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
RRP4YHR069C YIL055CP40523 627 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
RRP4YHR069C YAH1Q12184 172 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
RRP4YHR069C DNF3Q12674 1656 aa8.33□□□□□ -1.08
RRP4YHR069C PDR5P33302 1511 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RRP4YHR069C MIF2P35201 549 aa8.29□□□□□ -1.08
RRP4YHR069C YGL015CP33199 130 aa8.28□□□□□ -1.08
RRP4YHR069C YAP3P38749 330 aa8.28□□□□□ -1.08
RRP4YHR069C SSP1P38871 571 aa8.27□□□□□ -1.09
RRP4YHR069C PDR11P40550 1411 aa8.26□□□□□ -1.09
RRP4YHR069C IML1P47170 1584 aa8.26□□□□□ -1.09
RRP4YHR069C BCH2P36122 765 aa8.25□□□□□ -1.09
RRP4YHR069C IPL1P38991 367 aa8.24□□□□□ -1.09
RRP4YHR069C TYS1P36421 394 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
RRP4YHR069C YLR271WQ06152 274 aa8.23□□□□□ -1.09
RRP4YHR069C URN1Q06525 465 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
RRP4YHR069C HAP1P0CE41 1502 aa8.23□□□□□ -1.09
RRP4YHR069C RSM7P47150 247 aa8.22□□□□□ -1.09
RRP4YHR069C MAP2P38174 421 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
RRP4YHR069C UBP10P53874 792 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
RRP4YHR069C RAV1P47104 1357 aa8.15□□□□□ -1.1
RRP4YHR069C SCY1P53009 804 aa8.15□□□□□ -1.1
RRP4YHR069C MAK10Q02197 733 aa8.15□□□□□ -1.1
RRP4YHR069C USO1P25386 1790 aa8.15□□□□□ -1.11
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