RNA–Protein interactions for RNA: YGR161C-D

YGR161C-D, Transcript of Retrotransposon TYA Gag and TYB Pol genes, yeast

Gene YGR161C-D, Length 5,268 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YGR161C-D	YGR161C-D	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.89
YGR161C-D	YGR161C-D	MNN4	P36044	1178 aa		3.27	□□□□□ -1.89
YGR161C-D	YGR161C-D	PKH1	Q03407	766 aa		3.27	□□□□□ -1.89
YGR161C-D	YGR161C-D	ENV11	P53246	860 aa		3.27	□□□□□ -1.89
YGR161C-D	YGR161C-D	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89
YGR161C-D	YGR161C-D	ECM5	Q03214	1411 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YGR161C-D	YGR161C-D	EDE1	P34216	1381 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YGR161C-D	YGR161C-D	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	3.26	□□□□□ -1.89
YGR161C-D	YGR161C-D	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	3.26	□□□□□ -1.89
YGR161C-D	YGR161C-D	RGD1	P38339	666 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YGR161C-D	YGR161C-D	YAP3	P38749	330 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YGR161C-D	YGR161C-D	SMC1	P32908	1225 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YGR161C-D	YGR161C-D	RIA1	P53893	1110 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YGR161C-D	YGR161C-D	TPD3	P31383	635 aa		3.25	□□□□□ -1.89
YGR161C-D	YGR161C-D	ARP8	Q12386	881 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.25	□□□□□ -1.89	not detected
YGR161C-D	YGR161C-D	TAF8	Q03750	510 aa		3.25	□□□□□ -1.89
YGR161C-D	YGR161C-D	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	3.25	□□□□□ -1.89
YGR161C-D	YGR161C-D	SDH5	Q08230	162 aa		3.25	□□□□□ -1.89
YGR161C-D	YGR161C-D	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	3.24	□□□□□ -1.89
YGR161C-D	YGR161C-D	SSN2	P38931	1420 aa		3.24	□□□□□ -1.89
YGR161C-D	YGR161C-D	DNA2	P38859	1522 aa		3.24	□□□□□ -1.89
YGR161C-D	YGR161C-D	BUG1	Q12191	341 aa		3.24	□□□□□ -1.89
YGR161C-D	YGR161C-D	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	3.24	□□□□□ -1.89
YGR161C-D	YGR161C-D	ESL2	P36168	1195 aa		3.23	□□□□□ -1.89
YGR161C-D	YGR161C-D	RAD26	P40352	1085 aa		3.23	□□□□□ -1.89
YGR161C-D	YGR161C-D	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	3.23	□□□□□ -1.89
YGR161C-D	YGR161C-D	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
YGR161C-D	YGR161C-D	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
YGR161C-D	YGR161C-D	YKR018C	P36114	725 aa		3.23	□□□□□ -1.89
YGR161C-D	YGR161C-D	SSA2	P10592	639 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
YGR161C-D	YGR161C-D	NCB2	Q92317	146 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YGR161C-D	YGR161C-D	MAK10	Q02197	733 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YGR161C-D	YGR161C-D	AOS1	Q06624	347 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YGR161C-D	YGR161C-D	UBX2	Q04228	584 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YGR161C-D	YGR161C-D	CHD1	P32657	1468 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YGR161C-D	YGR161C-D	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.89
YGR161C-D	YGR161C-D	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	FET4	P40988	552 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	CSE4	P36012	229 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	CRF1	Q04930	467 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	YNL035C	P53962	389 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	NOP53	Q12080	455 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	DIP2	Q12220	943 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	GAL2	P13181	574 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	RRD1	P40454	393 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	VPS53	P47061	822 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	NSE3	Q05541	303 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	PSF3	Q12146	194 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	GRX6	Q12438	231 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	TCB1	Q12466	1186 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	GTT3	P39996	337 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	RLF2	Q12495	606 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	PUP2	P32379	260 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	PEX21	P50091	288 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	YBL036C	P38197	257 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	HSL1	P34244	1518 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	RAD54	P32863	898 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	BUD2	P33314	1104 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	IES2	P40154	320 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	PSK1	P31374	1356 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	AAD16	Q02895	342 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	MSM1	P22438	575 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	MAK21	Q12176	1025 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	ASF1	P32447	279 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	SLI15	P38283	698 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	UBP10	P53874	792 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	PSH1	Q12161	406 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	RRI2	Q12348	645 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	SWI6	P09959	803 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	BSD2	P38356	321 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	MPC54	Q08550	464 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	GPT2	P36148	743 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	IOC3	P43596	787 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	SAS4	Q04003	481 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	TRM3	Q07527	1436 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	TOP1	P04786	769 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	SMC3	P47037	1230 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	YBP2	P53169	641 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	PUS6	P53294	404 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	MCD4	P36051	919 aa		3.15	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	ATG1	P53104	897 aa		3.15	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	EAR1	Q03212	550 aa		3.15	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	MSN5	P52918	1224 aa		3.15	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
YGR161C-D	YGR161C-D	PES4	P39684	611 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YGR161C-D	YGR161C-D	BPT1	P14772	1559 aa		3.15	□□□□□ -1.91

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