RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627487.2

PCBP1-AS1-315, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 668 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 CLCN6P51797 869 aa10.23□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP10.22□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 LHX8Q68G74 356 aa10.2□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 PHF12Q96QT6 1004 aa10.2□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 DCBLD2Q96PD2 775 aa10.19□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 SMARCA4P51532 1647 aa10.18□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 CECR2Q9BXF3 1484 aa10.16□□□□□ -0.78
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 PEG3Q9GZU2 1588 aa10.14□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 SMARCA2P51531 1590 aa10.11□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 MIER1Q8N108 512 aa10.1□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 NCAPD3P42695 1498 aa10.09□□□□□ -0.79
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 HMGXB3Q12766 1538 aa10.08□□□□□ -0.8
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 MROH2BQ7Z745 1585 aa10.07□□□□□ -0.8
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 FKBP8Q14318 412 aa10.07□□□□□ -0.8
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa10.06□□□□□ -0.8
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 MS4A3Q96HJ5 214 aa10.04□□□□□ -0.8
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 PLEKHG5O94827 1062 aa10.03□□□□□ -0.8
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 RASEFQ8IZ41 740 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 PLCD3Q8N3E9 789 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 CCDC61Q9Y6R9 512 aa10.01□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 WIZO95785 1651 aa9.99□□□□□ -0.81
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 KIF12Q96FN5 646 aa9.96□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 POTEB2H3BUK9 544 aa9.95□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 MAP3K13O43283 966 aa9.92□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 TRPC6Q9Y210 931 aa9.91□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 NUBP1P53384 320 aa9.9□□□□□ -0.82
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 OTUD5Q96G74 571 aa9.89□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 METRNQ9UJH8 293 aa9.89□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 PRDM2Q13029 1718 aa9.89□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 SLC24A1O60721 1099 aa9.88□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 SLC39A7Q92504 469 aa9.87□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa9.87□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 C7P10643 843 aa9.85□□□□□ -0.83
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa9.83□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 POTEJP0CG39 1038 aa9.82□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 FBXO3Q9UK99 471 aa9.81□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 TIE1P35590 1138 aa9.8□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 FAM212AQ96EL1 285 aa9.8□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa9.8□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 CCDC88BA6NC98 1476 aa9.79□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 NESP48681 1621 aa9.78□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 TTLL13PA6NNM8 815 aa9.78□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 CADPSQ9ULU8 1353 aa9.77□□□□□ -0.84
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 POTEFA5A3E0 1075 aa9.77□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 IFNL1Q8IU54 200 aa9.76□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 SGIP1Q9BQI5 828 aa9.76□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 DCAF8Q5TAQ9 597 aa9.75□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 CFTRP13569 1480 aa9.74□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 VASPP50552 380 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 PDS5BQ9NTI5 1447 aa9.73□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 CUX2O14529 1486 aa9.72□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 TRIM35Q9UPQ4 493 aa9.72□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 PYGBP11216 843 aa9.71□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 KLHL34Q8N239 644 aa9.71□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 ERCC6Q03468 1493 aa9.69□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 MAMSTRQ6ZN01 415 aa9.69□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 TMEM106CQ9BVX2 250 aa9.69□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 SEC24BO95487 1268 aa9.68□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 SCUBE2Q9NQ36 999 aa9.66□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 WDR62O43379 1518 aa9.66□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 PCDHB8Q9UN66 801 aa9.65□□□□□ -0.86
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 IER5LQ5T953 404 aa9.64□□□□□ -0.87
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 ABCC8Q09428 1581 aa9.63□□□□□ -0.87
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 FANCD2Q9BXW9 1451 aa9.62□□□□□ -0.87
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 MRC2Q9UBG0 1479 aa9.61□□□□□ -0.87
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 CEP164Q9UPV0 1460 aa9.61□□□□□ -0.87
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 POTEMA6NI47 508 aa9.6□□□□□ -0.87
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 GSE1Q14687 1217 aa9.6□□□□□ -0.87
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 POTEGQ6S5H5 508 aa9.59□□□□□ -0.87
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 PLCG2P16885 1265 aa9.56□□□□□ -0.88
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 MYT1Q01538 1121 aa9.56□□□□□ -0.88
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 PLSCR2Q9NRY7 297 aa9.56□□□□□ -0.88
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 DNMBPQ6XZF7 1577 aa9.52□□□□□ -0.89
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 SPOCK2Q92563 424 aa9.52□□□□□ -0.89
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 OCEL1Q9H607 264 aa9.51□□□□□ -0.89
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.4 ms