RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559312.5

NUMB-231, Transcript of NUMB, endocytic adaptor protein, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUMB, Length 1,439 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUMB-231	ENST00000559312	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
NUMB-231	ENST00000559312	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NUMB-231	ENST00000559312	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
NUMB-231	ENST00000559312	SMARCA4	P51532	1647 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NUMB-231	ENST00000559312	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
NUMB-231	ENST00000559312	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NUMB-231	ENST00000559312	NUBP1	P53384	320 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NUMB-231	ENST00000559312	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		13.69	□□□□□ -0.22
NUMB-231	ENST00000559312	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
NUMB-231	ENST00000559312	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		13.65	□□□□□ -0.22
NUMB-231	ENST00000559312	SMARCA2	P51531	1590 aa		13.65	□□□□□ -0.22
NUMB-231	ENST00000559312	RASEF	Q8IZ41	740 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NUMB-231	ENST00000559312	FAM212A	Q96EL1	285 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NUMB-231	ENST00000559312	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NUMB-231	ENST00000559312	NCAPD3	P42695	1498 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NUMB-231	ENST00000559312	GSE1	Q14687	1217 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NUMB-231	ENST00000559312	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
NUMB-231	ENST00000559312	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
NUMB-231	ENST00000559312	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NUMB-231	ENST00000559312	POTEH	Q6S545	545 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NUMB-231	ENST00000559312	HMGXB3	Q12766	1538 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NUMB-231	ENST00000559312	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NUMB-231	ENST00000559312	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
NUMB-231	ENST00000559312	WIZ	O95785	1651 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NUMB-231	ENST00000559312	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
NUMB-231	ENST00000559312	PKD2	Q13563	968 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NUMB-231	ENST00000559312	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NUMB-231	ENST00000559312	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
NUMB-231	ENST00000559312	TRIM41	Q8WV44	630 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NUMB-231	ENST00000559312	HAX1	O00165	279 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NUMB-231	ENST00000559312	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
NUMB-231	ENST00000559312	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NUMB-231	ENST00000559312	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		13.46	□□□□□ -0.26
NUMB-231	ENST00000559312	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
NUMB-231	ENST00000559312	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
NUMB-231	ENST00000559312	PYGB	P11216	843 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
NUMB-231	ENST00000559312	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
NUMB-231	ENST00000559312	EVX2	Q03828	476 aa		13.35	□□□□□ -0.27
NUMB-231	ENST00000559312	PHF12	Q96QT6	1004 aa		13.33	□□□□□ -0.28
NUMB-231	ENST00000559312	RGL2	O15211	777 aa		13.32	□□□□□ -0.28
NUMB-231	ENST00000559312	KIF12	Q96FN5	646 aa		13.32	□□□□□ -0.28
NUMB-231	ENST00000559312	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		13.3	□□□□□ -0.28
NUMB-231	ENST00000559312	MAP3K13	O43283	966 aa		13.29	□□□□□ -0.28
NUMB-231	ENST00000559312	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
NUMB-231	ENST00000559312	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		13.28	□□□□□ -0.28
NUMB-231	ENST00000559312	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
NUMB-231	ENST00000559312	CLCN6	P51797	869 aa		13.27	□□□□□ -0.29
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
NUMB-231	ENST00000559312	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		13.26	□□□□□ -0.29
NUMB-231	ENST00000559312	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		13.24	□□□□□ -0.29
NUMB-231	ENST00000559312	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		13.23	□□□□□ -0.29
NUMB-231	ENST00000559312	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		13.22	□□□□□ -0.29
NUMB-231	ENST00000559312	IFNL1	Q8IU54	200 aa		13.21	□□□□□ -0.3
NUMB-231	ENST00000559312	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		13.21	□□□□□ -0.3
NUMB-231	ENST00000559312	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
NUMB-231	ENST00000559312	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		13.2	□□□□□ -0.3
NUMB-231	ENST00000559312	CFTR	P13569	1480 aa		13.19	□□□□□ -0.3
NUMB-231	ENST00000559312	NES	P48681	1621 aa		13.17	□□□□□ -0.3
NUMB-231	ENST00000559312	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
NUMB-231	ENST00000559312	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
NUMB-231	ENST00000559312	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
NUMB-231	ENST00000559312	GABBR2	O75899	941 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NUMB-231	ENST00000559312	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		13.13	□□□□□ -0.31
NUMB-231	ENST00000559312	PRDM2	Q13029	1718 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NUMB-231	ENST00000559312	PSEN1	P49768	467 aa		13.11	□□□□□ -0.31
NUMB-231	ENST00000559312	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
NUMB-231	ENST00000559312	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
NUMB-231	ENST00000559312	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
NUMB-231	ENST00000559312	ERCC6	Q03468	1493 aa		13.07	□□□□□ -0.32
NUMB-231	ENST00000559312	STK25	O00506	426 aa		13.06	□□□□□ -0.32
NUMB-231	ENST00000559312	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		13.06	□□□□□ -0.32
NUMB-231	ENST00000559312	TRPC6	Q9Y210	931 aa		13.06	□□□□□ -0.32
NUMB-231	ENST00000559312	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		13.06	□□□□□ -0.32
NUMB-231	ENST00000559312	TIE1	P35590	1138 aa		13.05	□□□□□ -0.32
NUMB-231	ENST00000559312	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		13.04	□□□□□ -0.32
NUMB-231	ENST00000559312	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	13.03	□□□□□ -0.32
NUMB-231	ENST00000559312	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		13.02	□□□□□ -0.32
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		13.02	□□□□□ -0.33
NUMB-231	ENST00000559312	STK24	Q9Y6E0	443 aa		13.02	□□□□□ -0.33
NUMB-231	ENST00000559312	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
NUMB-231	ENST00000559312	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		12.97	□□□□□ -0.33
NUMB-231	ENST00000559312	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.33
NUMB-231	ENST00000559312	DCBLD2	Q96PD2	775 aa		12.96	□□□□□ -0.33
NUMB-231	ENST00000559312	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		12.96	□□□□□ -0.33
NUMB-231	ENST00000559312	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.34
NUMB-231	ENST00000559312	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		12.96	□□□□□ -0.34
NUMB-231	ENST00000559312	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	12.94	□□□□□ -0.34
NUMB-231	ENST00000559312	CABP2	Q9NPB3	220 aa		12.94	□□□□□ -0.34
NUMB-231	ENST00000559312	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	12.93	□□□□□ -0.34
NUMB-231	ENST00000559312	ABCC8	Q09428	1581 aa		12.93	□□□□□ -0.34
NUMB-231	ENST00000559312	WDR62	O43379	1518 aa		12.93	□□□□□ -0.34
NUMB-231	ENST00000559312	GOLGA2	Q08379	1002 aa		12.92	□□□□□ -0.34
NUMB-231	ENST00000559312	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	12.9	□□□□□ -0.34
NUMB-231	ENST00000559312	CUX2	O14529	1486 aa		12.9	□□□□□ -0.34
NUMB-231	ENST00000559312	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	12.9	□□□□□ -0.34
NUMB-231	ENST00000559312	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	12.89	□□□□□ -0.35
NUMB-231	ENST00000559312	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		12.89	□□□□□ -0.35
NUMB-231	ENST00000559312	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		12.89	□□□□□ -0.35
NUMB-231	ENST00000559312	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		12.88	□□□□□ -0.35

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 214.7 ms