RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550078.2

ZBED6-202, Transcript of zinc finger BED-type containing 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED6, Length 12,481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6-202ENST00000550078 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
ZBED6-202ENST00000550078 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
ZBED6-202ENST00000550078 SOX12O15370 315 aa7.2□□□□□ -1.26
ZBED6-202ENST00000550078 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
ZBED6-202ENST00000550078 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
ZBED6-202ENST00000550078 G3V3G9 751 aa7.19□□□□□ -1.26
ZBED6-202ENST00000550078 DCAF8Q5TAQ9 597 aa7.19□□□□□ -1.26
ZBED6-202ENST00000550078 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
ZBED6-202ENST00000550078 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
ZBED6-202ENST00000550078 MLECQ14165 292 aa7.18□□□□□ -1.26
ZBED6-202ENST00000550078 P3H3Q8IVL6 736 aa7.18□□□□□ -1.26
ZBED6-202ENST00000550078 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
ZBED6-202ENST00000550078 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
ZBED6-202ENST00000550078 AK7Q96M32 723 aa7.15□□□□□ -1.26
ZBED6-202ENST00000550078 PLCD3Q8N3E9 789 aa7.14□□□□□ -1.27
ZBED6-202ENST00000550078 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
ZBED6-202ENST00000550078 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
ZBED6-202ENST00000550078 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
ZBED6-202ENST00000550078 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.271e-7■■□□□ 12.5
ZBED6-202ENST00000550078 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
ZBED6-202ENST00000550078 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
ZBED6-202ENST00000550078 ERICH6BQ5W0A0 696 aa7.11□□□□□ -1.27
ZBED6-202ENST00000550078 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa7.1□□□□□ -1.27
ZBED6-202ENST00000550078 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa7.1□□□□□ -1.27
ZBED6-202ENST00000550078 VPS53Q5VIR6 699 aa7.1□□□□□ -1.27
ZBED6-202ENST00000550078 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
ZBED6-202ENST00000550078 RAD21O60216 631 aa7.06□□□□□ -1.28
ZBED6-202ENST00000550078 KCNH8Q96L42 1107 aa7.06□□□□□ -1.28
ZBED6-202ENST00000550078 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
ZBED6-202ENST00000550078 NCLP19338 710 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
ZBED6-202ENST00000550078 FBXW7Q969H0 707 aa7.05□□□□□ -1.28
ZBED6-202ENST00000550078 GRM1Q13255 1194 aa7.04□□□□□ -1.28
ZBED6-202ENST00000550078 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
ZBED6-202ENST00000550078 PAF1Q8N7H5 531 aa7.03□□□□□ -1.28
ZBED6-202ENST00000550078 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa7.02□□□□□ -1.29
ZBED6-202ENST00000550078 MAP3K9P80192 1104 aa7.02□□□□□ -1.29
ZBED6-202ENST00000550078 FGD1P98174 961 aa7.02□□□□□ -1.29
ZBED6-202ENST00000550078 TMC1Q8TDI8 760 aa7.01□□□□□ -1.29
ZBED6-202ENST00000550078 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
ZBED6-202ENST00000550078 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa7.01□□□□□ -1.29
ZBED6-202ENST00000550078 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
ZBED6-202ENST00000550078 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
ZBED6-202ENST00000550078 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
ZBED6-202ENST00000550078 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
ZBED6-202ENST00000550078 PLCB2Q00722 1185 aa6.99□□□□□ -1.29
ZBED6-202ENST00000550078 STAC3Q96MF2 364 aa6.98□□□□□ -1.29
ZBED6-202ENST00000550078 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
ZBED6-202ENST00000550078 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
ZBED6-202ENST00000550078 SPDYE4A6NLX3 237 aa6.97□□□□□ -1.29
ZBED6-202ENST00000550078 KCNA4P22459 653 aa6.97□□□□□ -1.29
ZBED6-202ENST00000550078 CREBRFQ8IUR6 639 aa6.97□□□□□ -1.29
ZBED6-202ENST00000550078 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
ZBED6-202ENST00000550078 SLC4A3P48751 1232 aa6.96□□□□□ -1.3
ZBED6-202ENST00000550078 PODXL2Q9NZ53 605 aa6.96□□□□□ -1.3
ZBED6-202ENST00000550078 FOXD4L1Q9NU39 408 aa6.95□□□□□ -1.3
ZBED6-202ENST00000550078 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
ZBED6-202ENST00000550078 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
ZBED6-202ENST00000550078 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
ZBED6-202ENST00000550078 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
ZBED6-202ENST00000550078 MYH16Q9H6N6 1097 aa6.94□□□□□ -1.3
ZBED6-202ENST00000550078 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
ZBED6-202ENST00000550078 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
ZBED6-202ENST00000550078 PPP4R2Q9NY27 417 aa6.94□□□□□ -1.3
ZBED6-202ENST00000550078 KCNJ4P48050 445 aa6.94□□□□□ -1.3
ZBED6-202ENST00000550078 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
ZBED6-202ENST00000550078 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
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ZBED6-202ENST00000550078 CHMP3Q9Y3E7 222 aa6.93□□□□□ -1.3
ZBED6-202ENST00000550078 CHMP4BP1P59074 171 aa6.93□□□□□ -1.3
ZBED6-202ENST00000550078 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
ZBED6-202ENST00000550078 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
ZBED6-202ENST00000550078 CCDC136Q96JN2 1154 aa6.91□□□□□ -1.3
ZBED6-202ENST00000550078 CSRNP3Q8WYN3 585 aa6.91□□□□□ -1.3
ZBED6-202ENST00000550078 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
ZBED6-202ENST00000550078 PIP4K2BP78356 416 aa6.9□□□□□ -1.3
ZBED6-202ENST00000550078 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa6.9□□□□□ -1.3
ZBED6-202ENST00000550078 ATRXP46100 2492 aa6.9□□□□□ -1.31
ZBED6-202ENST00000550078 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.315e-7■■■□□ 15.1
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ZBED6-202ENST00000550078 MARCH6O60337 910 aa6.89□□□□□ -1.31
ZBED6-202ENST00000550078 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
ZBED6-202ENST00000550078 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
ZBED6-202ENST00000550078 EVA1CP58658 441 aa6.87□□□□□ -1.31
ZBED6-202ENST00000550078 CA8P35219 290 aa6.87□□□□□ -1.31
ZBED6-202ENST00000550078 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
ZBED6-202ENST00000550078 TMEM87AQ8NBN3 555 aa6.87□□□□□ -1.31
ZBED6-202ENST00000550078 TRIM34Q9BYJ4 488 aa6.87□□□□□ -1.31
ZBED6-202ENST00000550078 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
ZBED6-202ENST00000550078 CBX1P83916 185 aa6.87□□□□□ -1.31
ZBED6-202ENST00000550078 TAF7LQ5H9L4 462 aa6.87□□□□□ -1.31
ZBED6-202ENST00000550078 NUTM2FA1L443 756 aa6.87□□□□□ -1.31
ZBED6-202ENST00000550078 ANP32CO43423 234 aa6.87□□□□□ -1.31
ZBED6-202ENST00000550078 PTMAP06454 111 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
ZBED6-202ENST00000550078 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
ZBED6-202ENST00000550078 TTC16Q8NEE8 873 aa6.86□□□□□ -1.31
ZBED6-202ENST00000550078 CHIC2Q9UKJ5 165 aa6.85□□□□□ -1.31
ZBED6-202ENST00000550078 WDR78Q5VTH9 848 aa6.85□□□□□ -1.31
ZBED6-202ENST00000550078 APBB1O00213 710 aa6.85□□□□□ -1.31
ZBED6-202ENST00000550078 RGL3Q3MIN7 710 aa6.85□□□□□ -1.31
ZBED6-202ENST00000550078 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
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